car15 (LOC108264895)



Basic Information


Item Value
gene id car15
gene name LOC108264895
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 26400191 ~ 26462321 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


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>XR_004578635.1
tttttttttttgcaccccCCGCTCAAAAACTACTGAAGACAGATCTCCTGATACGTGAATgaatggGTGAAGTATGCAGTCCTGGATGTCTGCTCTAATATCTGTCCTAACGCTAAATGCCCTCAGTGCTTCGCCGCTTAAAGTGCCACCCCTTAATTACTGCTACACAGAAGACACCTGTAGTCCATATAACTGGGTGAAAACGTTTCCAACCTGCATCGCCAAAGAGACAATGCTGCACTCTCCCATCAACCTGGAACATATTGTTATTAAGAATGACTCCATTGATCCTCTGGAGCTGCGAGGCTTCGGTGTGCCTCAGAAGTCCTGGACTGTAGTCAATGTCCGGGACACTGttgctGTGAAGTTTCAAGCAGGCATGACTGTGAAAGGTGGCAGTATAAAGCATGATTACCAAATCGTAGAGATGAGATTCCACTGGGGTTCAAATACCACCAACGGATCAGAGCATAAACTTGACGATCGCAGGTTTCCTATGGAGatGCAGATTGTGGGCCTTGCTCCTGGATTCTCTGATGTGGAAGCCGCTTCTCTTGTGCAGTCAGGCCTGCTTATGATAGGAATCTTTGTTGATATCGCCTCTGATGagaataaagcatttaaagcCATAGCTCATGCTGTGCTCAACGTGCCGTACCCAGGCGATTCAGTGAGTGTGACTCCTCCAGCGTTGTCGCGCCTCCTTCCTGATAATTATAAATTCTATCAGTATCATGGAGGCCAGACAACTCCGCCCTGCCTCCAGACTGTGACTTGGATTGTGTTTGAGAAGCCCATTTTCATCTCCAGAGAGcagGTGCTTGTCACATTGTCTCAGGGGAagagaaggaaataaaaacaaggtGAAGCTTTCCATAAGGAGAcaattatttatggaaggagtctccagtgtcagtgtttgtaacagtcagagTATTTTCCGTTCATCACACATCTGTTTTACTCCGATAAAAACGACACCGTGAAGAAGTTTTTGGTGGACAACTATCGTTTCATCCAGCCCAGGTTGAACCGCCAAATCTTTGTTTCT

Function


NR:

description
PREDICTED: carbonic anhydrase 4-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XR_004578635.1 False 1051 misc_RNA 0.46 10 26454472 26461875

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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myl7 myl7,LOC107753162,LOC107554405,LOC107703146,LOC106580582 coding upstream 28394 26368415 ~ 26371797 (+)
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egr3 egr3 other upstream 841460 25551894 ~ 25558731 (+)
LOC113533115 gnrh1 other upstream 1265933 25132741 ~ 25134258 (+)
fkbp1aa fkb1b,fkbp1aa,fkbp1a,fkbp1ab,LOC103030299,LOC107553142,LOC107574256,LOC107752559,LOC107707744 other upstream 2386410 24011582 ~ 24013781 (+)
praf2 praf2,LOC107756831,LOC107702816,LOC107691574,LOC107565129 other upstream 2505466 23890416 ~ 23894725 (+)
LOC117597788 NA other downstream 100499 26562820 ~ 26567932 (+)
rimbp2 rimbp2,LOC108414005 other downstream 163732 26626053 ~ 26729946 (+)
fam160b2 LOC108265858 other downstream 720700 27183021 ~ 27261741 (+)
adam9 adam9,LOC107591921,LOC107722987,LOC107691559,LOC107566966,LOC107756844,LOC107702867 other downstream 804854 27267175 ~ 27295337 (+)
nr6a1a nr6a1,LOC107563838,LOC107721088,LOC107678448,LOC107698081,LOC107753334 other downstream 943129 27405450 ~ 27490461 (+)

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