slc7a4 (slc7a4)


Basic Information

Item Value
gene id slc7a4
gene name slc7a4
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 28748834 ~ 28803174 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU166319
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>XM_026945841.2
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Function

symbol description
slc7a4 Predicted to enable amino acid transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in amino acid transport. Predicted to act upstream of or within transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in plasma membrane. Orthologous to human SLC7A4 (solute carrier family 7 member 4).

NR:

description
PREDICTED: cationic amino acid transporter 4

GO:

id name namespace
GO:0003333 amino acid transmembrane transport biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0015171 amino acid transmembrane transporter activity molecular_function

KEGG:

id description
K13866 SLC7A4; solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter), member 4

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU166319 False 4039 lncRNA 0.35 2 28748834 28803171
XM_026945841.2 True 9044 mRNA 0.40 6 28788408 28803174

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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arpc5la arpc5la,LOC108265305,LOC108411248,LOC107571143,LOC107753090,LOC107550963,LOC107676626 other upstream 721384 28019184 ~ 28027450 (+)
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nr6a1a nr6a1,LOC107563838,LOC107721088,LOC107678448,LOC107698081,LOC107753334 other upstream 1258373 27405450 ~ 27490461 (+)
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adam9 adam9,LOC107591921,LOC107722987,LOC107691559,LOC107566966,LOC107756844,LOC107702867 other upstream 1453497 27267175 ~ 27295337 (+)
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Expression


Co-expression Network