LOC117597881 (LOC108265326)


Basic Information

Item Value
gene id LOC117597881
gene name LOC108265326
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 29325934 ~ 29351762 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU166505
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>XM_034307011.1
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>XM_034307013.1
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ATAAAAGTTTTACCGAA

Function

NR:

description
PREDICTED: dematin-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU166505 False 1136 lncRNA 0.34 2 29332414 29351756
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XM_034307013.1 False 5017 mRNA 0.43 16 29325934 29351762

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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si:dkey-220o5.5 LOC108265324 coding downstream 3221 29354983 ~ 29409064 (+)
si:ch73-138n13.1 LOC108265491 coding downstream 60065 29411827 ~ 29472922 (+)
kazald3 LOC108265493 coding downstream 130254 29482016 ~ 29485959 (+)
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trnar-ucg_2 NA coding downstream 136787 29488549 ~ 29488621 (+)
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G140935 NA non-coding downstream 69118 29420880 ~ 29421294 (+)
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G141247 NA non-coding downstream 585746 29937508 ~ 29954068 (+)
G141235 NA non-coding downstream 598096 29949858 ~ 29968041 (+)
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arpc5la arpc5la,LOC108265305,LOC108411248,LOC107571143,LOC107753090,LOC107550963,LOC107676626 other upstream 1298484 28019184 ~ 28027450 (+)
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nr6a1a nr6a1,LOC107563838,LOC107721088,LOC107678448,LOC107698081,LOC107753334 other upstream 1835473 27405450 ~ 27490461 (+)
G139781 NA other upstream 1896457 27428727 ~ 27429477 (+)
LOC113546008 LOC108264940,LOC108412050 other downstream 508426 29860188 ~ 29876280 (+)
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Expression


Co-expression Network