G182877


Basic Information

Item Value
gene id G182877
gene name NA
gene type unknown
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047605.1
NCBI id CM018551.1
chromosome length 26640196
location 16913258 ~ 16922922 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU216450
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU216450 True 9568 TUCP 0.41 2 16913258 16922922

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC113532286 LOC108270593,LOC108430073,LOC107719667,LOC100332608,LOC107699403,LOC107593325,LOC107676991,LOC107586464 coding upstream 51109 16858927 ~ 16862149 (+)
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hdgfl2 hdgfrp2,LOC108270897,LOC108430101,LOC107676974,LOC107717991 coding upstream 99012 16801804 ~ 16814246 (+)
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unc13a LOC108270949,LOC108430111 coding upstream 263143 16606126 ~ 16650115 (+)
tle5 aes,LOC108271216,LOC108430095,LOC107593322,LOC107586404 coding downstream 26826 16949748 ~ 16975577 (+)
tle2b LOC108271164,LOC108430094,LOC107676970,LOC107719559 coding downstream 77183 17000105 ~ 17066956 (+)
trnak-cuu_26 NA coding downstream 106950 17029872 ~ 17029944 (+)
soul4 LOC108270966,LOC108411954 coding downstream 301504 17224426 ~ 17235688 (+)
ptk7a ptk7,LOC108411955,LOC107702250,LOC107588446,LOC107732247 coding downstream 317570 17240492 ~ 17277455 (+)
LOC117598387 NA non-coding upstream 56121 16852408 ~ 16857137 (+)
LOC117598408 zbtb7a,LOC108270628 non-coding upstream 187731 16708625 ~ 16725527 (+)
G182483 NA non-coding upstream 652942 16260058 ~ 16260316 (+)
G182190 NA non-coding upstream 904023 16006054 ~ 16009235 (+)
G182116 NA non-coding upstream 922848 15988630 ~ 15990410 (+)
G182906 NA non-coding downstream 37737 16960659 ~ 16961299 (+)
G182910 NA non-coding downstream 66397 16989319 ~ 16989519 (+)
G182932 NA non-coding downstream 156715 17079637 ~ 17083529 (+)
LOC113535983 NA non-coding downstream 493808 17416730 ~ 17423320 (+)
G183032 NA non-coding downstream 527535 17450457 ~ 17450736 (+)
G182819 NA other upstream 328315 16583303 ~ 16584943 (+)
LOC113532318 NA other upstream 656476 16255047 ~ 16256782 (+)
borcs8 borcs8,LOC107728595,LOC107554813,LOC107599453 other upstream 1239276 15668798 ~ 15673982 (+)
pdzk1ip1 NA other upstream 2201531 14708927 ~ 14711727 (+)
si:dkey-121a11.3 LOC108270690,LOC107588106,LOC107592730 other upstream 2263573 14622543 ~ 14649685 (+)
si:ch211-126j24.1 LOC108270963,LOC108411470,LOC107550685,LOC107588448,LOC107697062 other downstream 198977 17121899 ~ 17189315 (+)
LOC113528769 klc4 other downstream 273358 17196280 ~ 17222532 (+)
kcnh1b kcnh1b,LOC108270513,LOC108411957,LOC107689936,LOC107753489,LOC107570545,LOC105026838,LOC103369331,LOC106564801 other downstream 442776 17365698 ~ 17411425 (+)
LOC113536271 ankub1 other downstream 516874 17439796 ~ 17446248 (+)
anos1b LOC108271321,LOC108439428 other downstream 675542 17598464 ~ 17636395 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G195115 NA non-coding CI01000046 null 764897 ~ 770106 (-)
bowfin (Amia calva) G109616 NA non-coding CM030134.1 CM030134.1 4266827 ~ 4268470 (-)