syt7b (syt7,LOC108271440,LOC103462425,LOC101476086,LOC103139426,LOC102796193,LOC100697404,LOC108250198,LOC102203020)
Chromosome Information
Item |
Value |
chromosome id |
NC_047605.1 |
NCBI id |
CM018551.1
|
chromosome length |
26640196 |
location |
26260530 ~ 26352035 (+) |
genome version |
GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome |
Sequence
>TU222884
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GCCCTCCAACCTGCCTCCCGCGGCCATCCGGTCTCCTGCAAACAAACCGAGTGGAATGGATTGAGAGAGGAGCGAGGGAGGgactatgagagagagagagagagagagagagagagagaggactaaCCTGCTGGAGTGTAGCGGCTAGGAGACGCGCGCGGGCTGACTGCTAGGCACGCGCGGGCTCTTCCACGCTCGCGACGGAAACTCAGTCAATCTGTATTCctaatttgagttttttttcccttcttcctcacagtgaaaaaagaaagagaagaatagAGGAAAGGCAGCCATGCGCCTGAACCGAGACGCCGAGGACGGCAAAGgttcCCTGTCGCTGGGCGTGTTCCTCGTGTCAGTCGGtctaactgtgtgtgttgtgtggctCGTGGCACTCTGCGGCGTCTGTGGATGGTGCCAACGCAGACTGGGGAAGAGGAATAAGCCAGGTTTGGACACAGCAAGTTCTCCGGACTCAGTGTCCGTACGAGGCCGGGGTGAAAATAAAGCCATCAATGATCTAGACAGGGACTTTTGGAATAATAATGACAGCAGCAATGTTCAGCAGCGGTGGAGCTCCTACCCTCCTAAGGAGTTTCTCTTGAACATGTCTCCTTATGCTCCGTACGGAGACCCACGTCTAACGCCCAATTTTGGGGATGCGTCCCCGCTGTCCACAGCGTCCACTCTGGAGCACATCGCACCCTCGGCGTGTCGTCCTCGGCCCCTCGTCAGACAGCAGAGCCTCCAGCAGCCCCTGACCCCCCGGCCCCCTCCGCCGCCCAACGACCCCCCTGCCACTTCACAGAGCCTGGGGCAGTTACACAGCAGCTCCGGGGGCGGCGGGGGGCAGCGGGGGGGTGCAAGGCCGGGGGCAAGGGGCAGCCCAGCCGCACCCGGGGCATCTCGCTACAGAGCGGGCGCAGGGGCACGGTCCCGCTCCAACCCGGGCAGCTGGGATCACATGATGGGGCAAATACGCACCAGGGGCATGGACGTCAAATCCTTCCTGGAAGGCAAGATGGTGGTGCTGTCTCTCGCGATTGGCCTGGCAGAACAGGACGACTTCGCCAACCTGCCAGACCTGCAGGAGAAGCCAGCGAGCCAAGAAACTCCTCCTGGCGACAAGAGAGCCATTGGTAACAAAGCCAACAGCAGTCCTAAAGGCCAGACCCCAGACGAGAGCAACCGCCGCACGGACGCCAACTCCTCCGTCTCAGACCTCGCCAACTCCGTCACCAGTGACATGCTCATGTTGTCTCCAGGCTCTGAAGAGGAAGAACATGAGGGTCCGGTGTGTGAGAAGCTTGGACGAATACAGTTCAGCGTGGGCTACAGCTTTCAGGACTCCACACTTACTGTGAAGATCCTTAAAGGCCAGGATCTACCGGCAAAAGATTTCTCCGGAACCTCAGACCCATTTGTTAAAATCTATCTGCTGCCAGACAAGAAGCACAAACTGGAGACCAAGGTGAAGAGAAAGAACCTGAACCCTCACTGGAACGAAACTTTCCTGTTTGAAGGTTTCCCGTATGAGAAGGTGGTCCAGCGCACTCTGTACCTGCAGGTGCTGGATTATGACCGATTCAGCAGGAATGACCCCATAGGCGAGGTGTCCATTCCTCTCAACAAGATCAATCTCGCTCACACGGAGCCATTCTGGAAAGAGCTGAAACCGTGCAGCGATGGCAGTgggagtCGAGGTGACCTGTTGGTGTCGTTGTGTTACAATCCCACGGCTAACACCATCACTGTGAACATCATAAAGGCACGCAATCTAAAAGCCATGGACATCGGCGGCACCTCAGACCCCTATGTGAAAGTGTGGCTGATGCACAAAGACAAACGGGTGGAAAAGAAGAAGACAGTGGTAATGAAGAGGTGTCTGAACCCTGTTTTTAACGAGTCCTTTCCTTTCGATGTTCCTGCTCATGTGCTGAGAGAGACCACCATCGTCATCACAGTCATGGATAAGGACAGACTCAGTCGAAATGATGTCATAGGCAAGATCTATCTCTCATGGAAGAGCGGCCCCGCAGAGGTGAAACATTGGAAGGATATGATGGGCCATCCTCGCACTGCCGTTGCCCAGTGGCATGCCCTCAAGGCTTAATGGACCCACCCACTAGCCCCGCCCCCAGATTAACCCCACACCCACAAGCCCCTGTTAATATGCACAAGCTTGAACACGGGTACCAAAAGCCATCCAACATTTGCTCCTTTTCTGTCCTTCTTCTATGTGTGTCCACAGATGGACTCATTCTTTCACTCTTCTTTATCTAGTTCTTACCTGTTTTTCCTGATTTGCACCTGCTGAGATCCCTTCTTTCcctttttgccaaaaaaagagGCTAAGCACTGCCAAGAAGATTGTAAAAGTCCTGTGTTATGTAATGGAAAGCAGGCTTGTCTTCCTtgagattatttattttgactGTTCAGTTGTCCGGGGAACAACCCAACATCCGACCAGGATGATGGGACTTCCAACCAGCCGAAAAAGATAAAAATCCTTCCCttctactgccatgtttttgtagTCCTTCCTCCAGTTATCATTCCCCCCCATAAAGATCCGCAAGGATCGCATCGCAGTGCAATAcctgatggatggagagatgaactCTTTACTTGAAACTCTTCGCCATCTCTTGCCAGTTTTCCTGGCATCAAGTGTAGAAACCCATTTTTGCTGGAATTCCTTGTCATCTGTTTGTTACTGTGGGTGCCGTGATGTGACAAAAaagttgttgttaaaaaaaaaaaagactcacctttttttttttttttggctggatCAAAGGCTTAGGGCGTTTGCAGACCTAATTCATTTGAGTTTTGGTTTGAATCAAAACGGTTTTTGTCAACATCCAGATGAAGTTTATTCACTACAATAGTCCTGAAATTTCTGTGTCAGAGCTTTCTTTAGGTAGCCAAAATGAATTGCCAGTTGCACCCCGGGTTTTCATGTCGTACACATGTATCGTGTATGATGCATTACACTATTCCGAAATTCTTTTTCCGGAGCACTGAAAGAAAGCTTTCACTCTGAGCACCTTTAAAAGCTGGCTTTTCCCAAGTCAAAAGGTGAGTAAGACGTGTTCCTTTGTTGTTCCTGGATCAACACTGTGTGCTCCCTCCAGCACCTCCGACTCCTGAGCCGGTAAAAACTTCCTCCAGAACACGCGAGTTATTGCGTAGCTGTACATATACCAAAATCTGAAATTCTTGACAATCTTCATCATGCACCtctttcattattcatttaattgaGGACTGTTAGGGTTTGTAATTAGAAGCTATGTAGCTTGCTGAGCTGAGTGGTGCGTTTCTATGCTACACATACAAACGTAATATTGTCAACAAATGAACAGTATTGCTCAACATGCAGAGCTGTACAATGGTTTTCCTCTCTGGAAGCCAATTGGTGCATGTGGAGGAAATCTTCAGGTGGCTCAGGAATGGGAGGAATGACATCGGATGGTTCACTGGTGAAAAGGGCTGTTGACCATGGAACAACGAAAAGTTCATCCAGGAACATCTCTTACATAAAGAAACATTCAGCTCTTAGCCTAGCTAACACAACTGGAACAGACAGTACCATAACTTTATGTGTATCAGATAGCTTTCATGCTTAAATCAGACTGTACCTGAACTATAGCCAGTGCTATGTCATGATTTAAACTTCTACTGATGTGCATGCACCCATCCAAACCAACAGACCTGAGGAAACATCTGTGTCTGAAATGACCAAAAGAACCAAATGATGAAGGTGTGAAAGCGTCCTTGGTGCGAATACAGTCGAAAAGATGCTAAACATTCCAATCATGTATAAAACAGGGCAGGCGGGAGGAAATGAGAACTGCTCATTGTTGTTTTGAAGTCAGTTCAAATGCTTCCATGACAGAGAGGTTATATGGTTGGTGGCagcagatgtgtgtttgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgagacattagaCCAGTAGAAATGCACTATTATTAGAAGCTGCAAacctgatgcagtgtgtgtgctgcatcaCCCGCATTATTTTCTTAACCAGATCACTGCCAGTGTTAAACAAACTTCTTAGTagagtttattttttaagagcCAAAGTAGtagtttcaaaaaaaaaaatcacacctgcTGAGCAAAGAATGAGTTTGAAGGGAAGTAGCAGTTGAAAATATCATGTATCTTGTGTGTGAAAGTTGTAATTTATCCAGTCTTATTGTCCTAATGTCTGACTAGTGTATGTAAGAGTGTTAGATATGTGAGTGTTTGTAACAGGGACAAAGCGATTCAGGTGGAACTCAGCTCAATATtgcaatttaaatgaaattaagcCTTTATTAGCACTCTTACAGAAACCTTATTTTACACTCCTGTAGTTTACTGTATTTTCTGGATTGTAACACTATGATTTTGAGATTGAAATCATGGCATTCCTTCATTCTGAGCAATGCTAAATTTGCTAGCACTGGGTTGGGCTAACAATGCTAACTGAATTACCTGAGCACTTTACcgaaaaataaaatgcactgtaacatgtaataaaataagGATAGTGCCATATACATgacataaacatttttctgttcctGGTCTCATGTGTCTGTATCTTCTAACCGAAGGTACATTACATATGAAACCAGGCACTATCGTTAAGTTGGTGCTAAAACAGCATCAAAAATCTCACAGGAGTGCTAGCGGAATTTAGCATTACAATGTGATTGGACACGCAAATGCTATTTACGAAGGGATTTACGCTCTGGGATGTGTGCGACACTCGAGAGATTTATTGTCCAGAAAGTACAGTATCTATTGTTGCTTTTTAAATAGACATATATAAGCTTagtggaaaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggggcttgAGGGACTCTCATGTGTGCTACGAGTTTTGGGTTCTTTATTTCTGCTCACCTCTGAGTAGTGTTACAGTCTCTACAGTAGGCATGTgccaatattacattttttgatCTTTCACActttatattctattttatttttataaaataataatcactagGCTAATAAAGTTGTAGATTCTGCCCCCATGTTTATCTCACATGCATGGAACGTTTGTGCAGTCCTCGTCCTGAGTGGGACAGACTTCATCGTGGAAGCACTATCTAGGCAGCCTAGCTCCTCCTAAATTAAATGCTGATGTATTTGGTGATTTAAAGTGCCTATGATAACAACATATGCtgaattttgtgatttttggttATTGGCACAAGCCTACTGTAAAGGTTCCAGATATGGGAACCTGAGGAGAAGTGTTTGAGAAACAAGCTACCGGTGTAATTTTCTTAAACGTAAAGTAAACCTGATTAACATGTAGGTAGCGGAACATcggtattaaaggaatagttgagttaaaaattaaatgtatacaGTTTTTCTTCTTACCCCAAGTACAGTCCAGCAGCCAAGACATCTCTGGCGTTcagtattttcttcttaattttACGCTGAAGGTGctaaaatcttttccatatATACACATCTTCATCTACTTGCTTCCGATTACTTTAAGCTGTGtaatatatttgaattaaatcaaattgtTAAATATATCACATTATCAAAAAATTGAAGTTAATTGTCTTGTTATATCCAACTTTCTGGTAAAATTTCACCTTCAAATTTTAGTGCAATTtgggaaaaaagtgattttgGTTTCCTTTGTGATTTATAGCATTCAGCTACATTGTGAAGTTTAGGTTATTTTTATAGATAGCAGTTATACCACCCTGAAGATCTGGTTGAGCTATATGCAGTATCTACCTTGACGATTATTAGTtgcattagcctcatagctcacCCTTGTCTTGGCTGTTCGACTACATCTGGTGTTGGtggaaaatgttcatttttctgtCACTTTGAGGAGAATGAATTTTTGACTGTACTTGTGACAGTGAACCATTTCATATAAGCAATATTAACACAGAGAGATTGTGAATCCTGTAAAGTAAATAAGAAAGAACGAGGTAACCCATTCCCACCAatgctataatcacacactcagtgtgtCTGGAGTATCTGTAACATTGCACTGACATTTTGTCCTCCAAATTCTGACTGGAAGTGTCAGGCAGGAAGGGTGAGAGACATCAGGCGTGAGAATCTCTGGCAGAAATTCTCTTGCTTTTTATCCTTCTTGTGCATAACCAGCTGTGACAAGCACGACCTTCGCCGTACATGGAGGGAGAGCTGAGCGTGTTAAGGACAAATCCAGACTGAAGTAAAAGTAATGGCATGGTAGGGAGGAGCTGTCACTGGGaatttggattttaaaaaaatgtgtaaaagaaaattgacaaacagttgaggccaaaagtttacatgcacataggctcaatttttcaca
Function
symbol |
description |
syt7
|
Predicted to enable several functions, including SNARE binding activity; calmodulin binding activity; and phospholipid binding activity. Predicted to be involved in several processes, including calcium-ion regulated exocytosis; regulation of secretion by cell; and regulation of vesicle-mediated transport. Located in extracellular exosome.
|
NR:
description |
synaptotagmin-7 isoform X1 |
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KEGG:
id |
description |
K19907
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SYT7; synaptotagmin-7 |
RNA
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LOC117598392 |
LOC108270747,LOC108273219,LOC108273545,LOC108261282,LOC108273546,LOC108274210,LOC108261633,LOC108263642,LOC108268260,LOC108273691
|
non-coding |
downstream |
93944 |
26445979 ~ 26511407 (+) |
polr2l |
polr2l
|
other |
upstream |
48415 |
26185862 ~ 26212115 (+) |
G188164 |
NA
|
other |
upstream |
50520 |
26206942 ~ 26210010 (+) |
LOC113523924 |
nell1
|
other |
upstream |
563658 |
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oaz1a |
oaz1
|
other |
upstream |
1691887 |
24563400 ~ 24568643 (+) |
glrx2 |
glrx2
|
other |
upstream |
2049767 |
24207876 ~ 24210763 (+) |
Expression