clpxa (clpx,clpxa,LOC107733949,LOC107737000,LOC107594724,LOC107600713)


Basic Information

Item Value
gene id clpxa
gene name clpx,clpxa,LOC107733949,LOC107737000,LOC107594724,LOC107600713
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047605.1
NCBI id CM018551.1
chromosome length 26640196
location 8550368 ~ 8564908 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
clpxa Predicted to enable ATP binding activity and ATP hydrolysis activity. Acts upstream of or within erythrocyte development. Predicted to be active in mitochondrial matrix. Human ortholog(s) of this gene implicated in erythropoietic protoporphyria. Orthologous to human CLPX (caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit X).
clpx Enables peptidase activator activity. Contributes to ATP-dependent peptidase activity. Involved in ATP metabolic process and proteolysis involved in cellular protein catabolic process. Located in cytosol; mitochondrial nucleoid; and nucleoplasm. Part of mitochondrial endopeptidase Clp complex. Implicated in erythropoietic protoporphyria.

NR:

description
PREDICTED: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial

GO:

id name namespace
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GO:0051082 unfolded protein binding molecular_function

KEGG:

id description
K03544 clpX, CLPX; ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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aldh1a3 aldh1a3,LOC107692006,LOC107742307,LOC107553814,LOC106562593,LOC107755645,LOC107662254 coding upstream 361904 8926812 ~ 8950809 (-)
G178208 NA non-coding downstream 28283 8521801 ~ 8522085 (-)
G178057 NA non-coding downstream 226204 8323619 ~ 8324164 (-)
LOC113536653 NA non-coding downstream 275008 8271107 ~ 8275360 (-)
G177807 NA non-coding downstream 623310 7926293 ~ 7927058 (-)
G177733 NA non-coding downstream 799562 7728913 ~ 7750806 (-)
G178227 NA non-coding upstream 28278 8593186 ~ 8593405 (-)
G178398 NA non-coding upstream 146269 8711177 ~ 8712118 (-)
G178501 NA non-coding upstream 438736 9003644 ~ 9003852 (-)
G178673 NA non-coding upstream 622163 9187071 ~ 9189914 (-)
G178679 NA non-coding upstream 632692 9197600 ~ 9197805 (-)
trnar-acg_8 NA other downstream 302606 8247690 ~ 8247762 (-)
trnar-acg_7 NA other downstream 303593 8246703 ~ 8246775 (-)
trnar-ucg_7 NA other downstream 305647 8244649 ~ 8244721 (-)
igf1rb LOC108271091 other downstream 785938 7675916 ~ 7764430 (-)
si:ch1073-365p7.2 NA other downstream 961553 7580434 ~ 7588815 (-)
asb7 asb7,LOC107755647,LOC107662256,LOC107742335 other upstream 418274 8983182 ~ 8995120 (-)
mthfs mthfs,LOC102796869 other upstream 756058 9320966 ~ 9336186 (-)
LOC113536412 NA other upstream 822583 9387491 ~ 9407218 (-)
G178942 NA other upstream 957508 9522416 ~ 9523330 (-)
G179035 NA other upstream 1248984 9813892 ~ 9815225 (-)

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