mctp2b (LOC108271124,LOC108428479)


Basic Information

Item Value
gene id mctp2b
gene name LOC108271124,LOC108428479
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047605.1
NCBI id CM018551.1
chromosome length 26640196
location 7595015 ~ 7623473 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
PREDICTED: multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026930592.2 False 3952 mRNA 0.44 23 7595015 7623472
XM_026930594.2 False 3950 mRNA 0.44 23 7595015 7623473
XM_026930595.2 False 2732 mRNA 0.48 22 7597283 7623473
XM_034308793.1 True 3988 mRNA 0.44 23 7595015 7623472
XM_034308794.1 False 3896 mRNA 0.44 22 7595015 7623473

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ero1b ero1b coding downstream 17175 7564380 ~ 7577840 (-)
nid1a nid1 coding downstream 47195 7515247 ~ 7547820 (-)
rbm34 rbm34 coding downstream 94115 7492501 ~ 7500900 (-)
irf2bp2b irf2bp2 coding downstream 157525 7434319 ~ 7437490 (-)
strn strn,LOC108271087,LOC108430145,LOC107702041,LOC107701064 coding downstream 240685 7296707 ~ 7354330 (-)
LOC113536417 LOC108271125 coding upstream 2023 7625496 ~ 7656954 (-)
lrrc28 lrrc28,LOC107662304,LOC107706938,LOC107690794 coding upstream 35573 7659046 ~ 7671661 (-)
mespaa mespbb,LOC108270617,LOC106024706 coding upstream 176192 7799665 ~ 7801552 (-)
mespba LOC108270618,LOC107714027,LOC107654092,LOC107581863,LOC107706936,LOC107568918 coding upstream 185917 7809390 ~ 7810679 (-)
sv2ba sv2ba,LOC108270522,LOC108428484,LOC107674753,LOC107568919 coding upstream 194763 7818236 ~ 7845027 (-)
G177691 NA non-coding downstream 43265 7551522 ~ 7551750 (-)
G177682 NA non-coding downstream 85827 7508851 ~ 7509188 (-)
G177562 NA non-coding downstream 115627 7479158 ~ 7479388 (-)
G177559 NA non-coding downstream 123805 7470974 ~ 7471210 (-)
G177550 NA non-coding downstream 152620 7441891 ~ 7442395 (-)
G177729 NA non-coding upstream 84038 7707511 ~ 7755018 (-)
G177733 NA non-coding upstream 105440 7728913 ~ 7750806 (-)
G177807 NA non-coding upstream 302820 7926293 ~ 7927058 (-)
LOC113536653 NA non-coding upstream 647634 8271107 ~ 8275360 (-)
G178057 NA non-coding upstream 700146 8323619 ~ 8324164 (-)
si:ch1073-365p7.2 NA other downstream 6200 7580434 ~ 7588815 (-)
si:dkey-56d12.4 LOC108270721 other downstream 110898 7480422 ~ 7484117 (-)
LOC113536608 LOC108270551 other downstream 733667 6856755 ~ 6861348 (-)
LOC113536561 srsf7,LOC107665899,LOC107693014 other downstream 1886711 5696380 ~ 5708304 (-)
trip4 trip4 other downstream 2398197 5139610 ~ 5196818 (-)
igf1rb LOC108271091 other upstream 52443 7675916 ~ 7764430 (-)
trnar-ucg_7 NA other upstream 621176 8244649 ~ 8244721 (-)
trnar-acg_7 NA other upstream 623230 8246703 ~ 8246775 (-)
trnar-acg_8 NA other upstream 624217 8247690 ~ 8247762 (-)
asb7 asb7,LOC107755647,LOC107662256,LOC107742335 other upstream 1359709 8983182 ~ 8995120 (-)

Expression


Co-expression Network