G30288 (evi5)


Basic Information

Item Value
gene id G30288
gene name evi5
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047596.1
NCBI id CM018542.1
chromosome length 35203048
location 20037735 ~ 20039974 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU35757
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>TU35759
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>TU35760
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>TU35761
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>TU35765
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Function

symbol description
evi5 Enables GTPase activator activity and small GTPase binding activity. Involved in positive regulation of GTPase activity and retrograde transport, endosome to Golgi. Located in cytosol.

NR:

description
PREDICTED: ecotropic viral integration site 5 protein homolog isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU35757 True 2212 lncRNA 0.43 2 20037735 20039974
TU35759 False 2158 lncRNA 0.42 2 20037735 20039974
TU35760 False 2184 lncRNA 0.42 2 20037735 20039974
TU35761 False 2116 lncRNA 0.42 2 20037735 20039974
TU35765 False 2100 lncRNA 0.41 2 20037735 20039974

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tp63 tp63,LOC107574491,LOC103365775 coding upstream 81701 19884761 ~ 19956034 (+)
tprg1 LOC108272012 coding upstream 154147 19855130 ~ 19883588 (+)
lpp lpp,LOC108271779,LOC108427685,LOC107717931,LOC107590653,LOC107684332,LOC107696776,LOC107752632 coding upstream 233887 19588827 ~ 19803848 (+)
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gpr17 gpr17,LOC107717943,LOC107752663,LOC107694121,LOC107590682 coding upstream 530878 19501596 ~ 19506857 (+)
rpl5b LOC103397662,LOC103368809,LOC104921761,LOC101078338,LOC107590646 coding downstream 64230 20104204 ~ 20112519 (+)
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si:ch211-201h21.5 LOC108271508,LOC108427703 coding downstream 218847 20258821 ~ 20265493 (+)
G30224 NA non-coding upstream 119367 19918145 ~ 19918368 (+)
G30049 NA non-coding upstream 217364 19820142 ~ 19820371 (+)
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G29999 NA non-coding upstream 471712 19565810 ~ 19566023 (+)
G29985 NA non-coding upstream 496487 19540939 ~ 19541248 (+)
G30382 nme7,LOC107732015 non-coding downstream 194001 20233975 ~ 20234772 (+)
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LOC113543059 c11h1orf146 other upstream 17509 20000046 ~ 20020226 (+)
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boka bok,LOC107733256,LOC107752647,LOC107694130,LOC107696759 other upstream 1088998 18932683 ~ 18948737 (+)
G29569 hdlbpa,hdlbp,LOC107694132,LOC107733253 other upstream 1202014 18774770 ~ 18835721 (+)
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G32684 NA other downstream 3980404 24020378 ~ 24021036 (+)

Expression


Co-expression Network