nf1a (nf1)


Basic Information

Item Value
gene id nf1a
gene name nf1
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047608.1
NCBI id CM018554.1
chromosome length 25848897
location 12940910 ~ 13007559 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_034310628.1
GATTCAAACTTCCGGTCGTGTGTCATGGCGGCGCGGTGGAGTATACTTGAAGCGAAAAAGCTAAACCCTGCTACTTATGCTTTTTCGCTGTGAGGTTTTGCGGTGTCTTGGGCTGGTTAGTGTGCTGCATTAGACGAAGCGGTTCGGATTTGGGACTGCCAGGCGGGGGAGCGCCTGCAGTTTGCATCCGCCTGACCATGGCGGCACACAAGCCCGTGGAGTGGGTCCAGGCCGTAATTAACCGATTCGACGAGCAGctTCCTATTAAGACAGGACAGCAGAACACTCACACCAAAGTCAGCACAGAGCACAATAAGGAATGCTTGATCAACATCTCCAAATACAAGTTTTCCCTTGTCATCAATGGCCTGACCAACATCCTCAAAAATGTTAACAATATGCGGATAATTGGGGAAGCTGCCGAAAAGAACCTCTACCTCTCGCAGCTTATCATCCTTGACACTCTGGAGAAGTGCTTGGCAGGGCAAACCAAGGACTGCTTGCGTCTAGATGAGGCCATGCTGGTGAAGCAGTTGCTCCCTGAGATCTGCCACTTCCTGCACTCATGTCGTGAGGGCCAGCAGCATGCCACCCAGCTACGCAGCTCTGCCTCAGCCGTGCTCTTCTCTCTTAGCTGCAACAACTTCAATGCCGTCTTTAGCCGCATCTCCACAAGATTACAGGAGCTTACAGTATGCACAGAGGACACCGTAGATGTTCATGACATAGAGCTTATTCAGTACATCAATGTTGACTGCTCCAAGTTAAAGAGATTACTGCAAGAAACTGTACTAAAATTTAAAGCACTGAAGAAGCCTGCACAGCTTGCTGTGatcaacagtttggagaagGCTTTTTGGAACTGGGTGGAGTATTATCCTGATGAATTTACTATGCTCTACCAGAGACCGCAGGCTGATATGGCGGACTCTGCAGAGAAGCTGTTTGACCTGGTAGACAGTTTTGCAGAGAGTGCTAAGAGGAAAGCTGCTGTGTGGCCACTGCAAATCATCCTTCTCATTCTCTGTCCTGAGATCACACAGAGCATCTCTAAAGAAGTGGTGGAAGAGAGCAAGGCTAACAAGAAGTTGTTTTTGGAGAGTCTTAGGAAGGCCCTGGCTGGTCACAGTAGCAGCAAGCAGTTGACTGAGAGTGCAGCCATCGCCTGTGTAAAACTGTCTAAAGCCTGCAcatacattaactgggaggatCATTCTGTCATCTTCCTCCTGGTGCAGTCTATAGTAATGGACCTCAAAGCTCTCCTGTTCAACCCCACTAAGCCGTTCTCCAGGGGCACCGGGTGCCAGAGTGCTGACGTAGACCTGATGATCGACTGCTTTGTGTCCTGCTTCCGCATCAACCCACACAACAACCAGCACTTCAAGGTCTGTCTGGCTTCCACCTCCCCACCAACCTTCCATTTTGTCTTGGTCAACTCTCTGcacaaaatcattactaatTCTCACTTGGATTGGTGGCCAAAGATTGACACAATCTACTGCTACTCTGGAGAACTGCGTGCCATGTTTGCCGACACACAGACCCGAGTCGTCCAGAGCCTTAGTGCCCACGCACCACTAAGGATGACACCTAGTTTGACATTCAAAGAGAAGATGACAACCAGCCTGAAGTTTAAAGAAAAGTCTGCAGATCTGGACTCACGCTCTCTTCTTCTGGCTTTGGTCAAACTCATCCATGCTGACCCCAAACTAATGCTACATAATCCTGGGAAGCAGGGCCAGGAGATCCAGAACAGCACAGCTGAACTCATCATAGGCCTGGTCCAGCTTGTTCCCCTGACCCATACTTCAGAGCTCTCTCAGGAGGCCATGGAGGCACTTTTGGTGTTGCATCAACCTGAGACCATTGAGCTGTGGAACCCTGATACACCAATTGAGACCTTCTGGGACATCAGCTCTCAGGTCCTGTTTCTTATCTGTAAGAAGTTGATTGGCCACCAGATGATCAACAGCACAGAGATCTTGAAGTGGCTGAGGGAGATTCTCATCTGCAGGAACAAGTTTCTCCTGAAGAACAAAGAAAGTGCCACACAGGGGAGTCTAATTCCCATCAGCAGACAAGCGCAGACCAAGCTGGAAGTGTGCCTGTATTCATTTCTGTGGAGCCCAGACGCCGAGGCCGTGCTGGTGGCCATGTCCTGCTTCCGGCACCTGTGTGAGGAGGCGGACATCCGCTGCAGTGTGGATGAGCTGCCTGTACACACAGTTCTGCCCAACTACAACACTTTCATGGAGTTTGCCTCCGTCAGCAACATGATGGCCACAGgtcgcTCTACCCTACAGAAGAGAGTGATGGCACTGTTGAGGAGGATAGAACATCCTACTGCTGGCAACATAGAGGCATGGGAGGACACACATGCTAAATGGGAACAAGCAACAAAACAAATACTAAACCATCCAAAGAACAAAGTTGAAGATGGCCAGGAGTGGATCAACATGACAGGCTTCCTGTGTGCTCTGGGTGGAGTGTGTCTGCAGCAGCGCAGTACTCCCAGCCTTGGTACCTACAGCCCACCCATGGGGCCAATGAGTGAGCGCAAGGGCTCCATGATCTCCATGGGCTCGTGTGAAGTGAACAGTGAGACTCCCCTCAGCAGGTTCCTGGAAAGGCTGCTGTCCCTCATGGTGTGTACACATGAGAAGGTGGGCTTGCACATCCGCACCAATGTTAAAGATCTGCTGGGACTGGAGCTGAGTCCGGCCCTCTATTCCATGCTGTTCACCAAACTGCGCAACAGCATTGGACGTTTCTTTGACACCCAGGGGCCGGTTCCCATAAATgacacaaatacattatttgtgGAGCAGACTATtgccatcatgaagaaccttcTGGACAGCCACACTGAGGGCAGCTCTGAGCACCTTGGTCAGGCCAGCATTGAGACAATGATGCTCAACTTGGTCAGATATGTGCGCATTTTAGGGAATGGGGTTCATGCAATACAGATTAAGACTAAACTTTGTCAACTCGTGGAGGTTATGATGGAACGCAGAGATGATCTCTCCTTCTGCCAAGAAATGAAATTCAGGAATAAGATGGTAGAGTACTTGACTGACTGGGTGATGGGCACTTCCAATCAAGCAGCAGATGATGATGTCAAATATCTCACACGGGACCTTGATCAGGCCAGTATGGAGGCAGTGGTGTCTCTGCTGGCTGGTTTACCACTACAGCCTGAAGAAGGAGATGGAGTGGAGCTGATGGAGGCCAAGTCTCAGCTTTTTCTTAAGTACTTCACTCTGTTCATGAACCTTCTGAATGACTGCAGTGAGGTGGAGGAAGATGGGCAGCAGGTAGGCGAAAGAAAGCGGGGCATGTCCCGACGTCTCGCCTCACTACGCCACTGCACTGTGCTTGCCATGTCCAACCTGCTCAATGCCAACGTGGACAGCGGCCTCATGCACTCTATAGgaCTGGGCTACCATAAAGACCTACAGACCAGGGCTACATTCATGGAGGTGTTGACTAAGATCCTGCAGCAAGGCACGGAGTTTGACACTCTGGCCGAGACTGTTCTGGCTGACCGCTTTGAGAGGCTGGTGGAGCTTGTCACCATGATGGGGGATCAGGGGGAGCTTCCCATTGCCATGGCACTGGCCAATGTGGTGCCCTGCTCCCAGTGGGATGAGCTGGCCAGGGTGTTGGTGACGCTGTTTGACTCCAGGCACCTGCTCTACCAGCTGCTCTGGAATATGTTCTCTAAAGAGGTGGAGCTGGCTGACTCCATGCAGACCCTCTTTAGAGGCAACAGTTTGGCTAGCAAGATCATGACCTTCTGCTTCAAGGTGTATGGAGCTGCTTATCTTCAGAAGCTTCTTGAGCCTCTGATGCGAGGCGTCATCACATCTCCTGAGTGGCAGCACATCAGCTTTGAGGTTGACCCCACCAGATTGGAACCTACTGAAAACCTGGAGGAGAACCAGCGGAACCTGCTGCAGATCACAGACCGTTTCTTTCTGGCCATCATTAACTCCTCCAGCGAGTTTCCTCCTCAGCTGCGAAGCGTATGCCACTGTTTGTACCAGGCTACTTGCCACTCCCTACTGAATAAAGCcactgttaaagaaaaaaaggaaaacaaaaaatccGTGGTGAGCCAGCGTTTTCCCCAGAACAGCATCGGTGCCGTTGGCAGTGCCATGTTCCTGCGCTTCATCAACCCTGCCATAGTCTCTCCATACGAGGCTGGCATCTTGGATAAGAAGCCTCCTCCTCGGATTGAGCGGGGCCTCAAACTCATGTCTAAGATTCTCCAGAGTATTGCCAATCATGTTCTCTTTACCAAGGAAGAGCATATGAGGTCATTTAACGATTTTGTGAAAAACAACTTTGAGGCAGCAAGGAGATTTTTCCTGGATATAGCATCTGATTCCCCTCCTAGCGATTCAGTCAATCATAGCTTGTCCTTCATCAGTGATGGTAATGTGCTCGCCCTGCACCGTCTACTCTGGAACAACCAGGAGAGGATTGGGCAGTATTTATCCAGCAACAGGGACCACAAGGCTGTTGGTAGAAGACCCTTTGATAAAATGGCTACACTCCTGGCGTATCTTGGCCCCCCTGAGCACAAACCTGTAGCAGACACTCACTGGTCCAGTCTCAACCTCACCAGTTCCAAATTTGAGGAGTTTATGACCAGGCACCAGGTCCATGAAAAAGAAGAATTCAAAGCTCTGAAGACACTTAATATCTTTTACCAGGCAGGAACATCTAAGAATGGCAACCCCGTCTTCTATTACATTGCTCGAAGGTTCAAAACAGGGCAGATCAATGGTGACCTTCTAATCTACCATGTACTACTCACACTCAAACCCTACTATGCTAAACACTATGAGATAGTTGTGGACCTCACCCATGTTGGCCCCAGCAACCGCTTCAAGACTGACTTCCTCTCCAAGTGGTTTGTAGTATTTCCAAACTTTGCCTATGAAAATGTGGCTGCGGTCTTTATCTATAACTGCAACACCTGGGTG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>XM_034310629.1
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Function

symbol description
nf1 Enables GTPase activator activity; phosphatidylcholine binding activity; and phosphatidylethanolamine binding activity. Involved in several processes, including positive regulation of GTPase activity; regulation of angiogenesis; and regulation of blood vessel endothelial cell migration. Acts upstream of or within negative regulation of MAPK cascade; negative regulation of cell migration; and negative regulation of endothelial cell proliferation. Located in axon and dendrite. Implicated in autistic disorder; hematologic cancer (multiple); nervous system cancer (multiple); neurofibromatosis 1; and neurofibromatosis-Noonan syndrome. Biomarker of acute myeloid leukemia; lung non-small cell carcinoma; and malignant astrocytoma.

NR:

description
PREDICTED: neurofibromin isoform X4

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KEGG:

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K08052 NF1; neurofibromin 1

RNA

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Neighbor

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Expression


Co-expression Network