G260697


Basic Information

Item Value
gene id G260697
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047610.1
NCBI id CM018556.1
chromosome length 25111544
location 24745781 ~ 24751808 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU308715
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>TU308717
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>TU308718
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04972 Pancreatic secretion
ko04974 Protein digestion and absorption

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU308715 False 5692 lncRNA 0.38 3 24745781 24751808
TU308717 True 5804 lncRNA 0.38 2 24745781 24751808
TU308718 False 5748 lncRNA 0.38 2 24745781 24751808

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
sgms2b LOC108275722 coding upstream 20546 24715017 ~ 24725235 (+)
aimp1b LOC108275725 coding upstream 47348 24693031 ~ 24698433 (+)
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LOC113530697 NA coding upstream 121976 24618620 ~ 24623805 (+)
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LOC117599303 NA coding downstream 45421 24797229 ~ 24801608 (+)
LOC117599304 LOC108275642 coding downstream 50084 24801892 ~ 24802529 (+)
LOC117599305 NA coding downstream 51363 24803171 ~ 24804413 (+)
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G260691 NA non-coding upstream 17384 24725847 ~ 24728397 (+)
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G260677 NA non-coding upstream 128564 24616168 ~ 24617217 (+)
G260623 tcp1 non-coding upstream 141722 24528252 ~ 24604059 (+)
G260664 NA non-coding downstream 17114 24768922 ~ 24771134 (+)
G260705 NA non-coding downstream 22707 24774515 ~ 24775224 (+)
G260711 NA non-coding downstream 54148 24805956 ~ 24806167 (+)
G260713 NA non-coding downstream 75515 24827323 ~ 24829045 (+)
G260718 NA non-coding downstream 77972 24829780 ~ 24830030 (+)
ddx58 ddx58 other upstream 109652 24624937 ~ 24636129 (+)
rnf146 rnf146,LOC107751835,LOC107599252,LOC107697902,LOC101069158,LOC107735261,LOC106571496 other upstream 292243 24400584 ~ 24453538 (+)
G260483 LOC108275756 other upstream 476514 24268577 ~ 24269267 (+)
G260415 NA other upstream 713057 24032227 ~ 24032724 (+)
G259993 NA other upstream 1356467 23387538 ~ 23389314 (+)

Expression


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