si:ch211-149b19.4 (LOC108275830)


Basic Information

Item Value
gene id si:ch211-149b19.4
gene name LOC108275830
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047610.1
NCBI id CM018556.1
chromosome length 25111544
location 24983979 ~ 25008193 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU309088
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>TU309124
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>XM_034311595.1
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>XM_034311596.1
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>XM_034311597.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU309124 True 3412 TUCP 0.45 2 24990576 24999848
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XM_034311597.1 False 1588 mRNA 0.52 11 24983979 25008186

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC117599306 LOC108275826 coding downstream 54593 24921918 ~ 24929386 (-)
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LOC117599278 anp32b,LOC108275503,LOC108412630 coding upstream 39427 25047620 ~ 25053567 (-)
sh3gl2b sh3gl2,LOC108276379,LOC102797997,LOC100698524,LOC101160542 coding upstream 48725 25056918 ~ 25067948 (-)
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si:ch1073-157b13.1 LOC108276418 other downstream 188556 24787690 ~ 24795423 (-)
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LOC113530517 LOC108273546,LOC108270753,LOC108268894,LOC108273219,LOC108261257,LOC108273545,LOC108270747,LOC108261406 other downstream 597724 24374273 ~ 24386255 (-)
G260972 ctc1 other upstream 32598 25040791 ~ 25042595 (-)
LOC117599229 if4e2,eif4e2rs1,LOC106608398,LOC105891435,LOC107679374,LOC108276381,LOC105007409 other upstream 68580 25076773 ~ 25079035 (-)

Expression


Co-expression Network