ttc34 (ttc34)


Basic Information

Item Value
gene id ttc34
gene name ttc34
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047610.1
NCBI id CM018556.1
chromosome length 25111544
location 10403177 ~ 10411529 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026920375.2 False 4600 mRNA 0.48 8 10403177 10411509
XM_034311643.1 True 4907 mRNA 0.47 9 10403177 10411509
XM_034311644.1 False 4483 mRNA 0.48 9 10403177 10411529
XM_034311645.1 False 4797 mRNA 0.47 8 10403177 10410035

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
megf6a megf6,LOC108276135 coding downstream 30481 10342798 ~ 10372696 (-)
emc1 emc1,LOC107593385 coding downstream 250455 10140734 ~ 10152722 (-)
ubr4 ubr4 coding downstream 263886 10092732 ~ 10139291 (-)
iffo2a iffo2 coding downstream 312024 10065107 ~ 10091153 (-)
LOC113530596 LOC108276390 coding downstream 340432 10057524 ~ 10062745 (-)
si:ch211-112c15.8 NA coding upstream 1197 10412726 ~ 10420802 (-)
ccdc30 ccdc30 coding upstream 27315 10438844 ~ 10458808 (-)
arhgef3l LOC108276039,LOC108434749,LOC107712679,LOC107593396,LOC107699573,LOC107565836,LOC107737584 coding upstream 58970 10470499 ~ 10479864 (-)
uba1 uba1,LOC107737583,LOC107699604,LOC107593395 coding upstream 68961 10480490 ~ 10496127 (-)
camkvl camkvl,LOC108275516,LOC106572974,LOC101077320 coding upstream 86189 10497718 ~ 10529717 (-)
G252610 NA non-coding downstream 6437 10396395 ~ 10396740 (-)
LOC117599279 NA non-coding downstream 114493 10244041 ~ 10288684 (-)
LOC117599207 NA non-coding downstream 221289 10179788 ~ 10181888 (-)
G252479 NA non-coding downstream 347094 10054877 ~ 10056083 (-)
G252331 NA non-coding downstream 483029 9917429 ~ 9920148 (-)
G252783 NA non-coding upstream 243785 10655314 ~ 10655522 (-)
G252833 NA non-coding upstream 298866 10710395 ~ 10711491 (-)
G252856 NA non-coding upstream 367456 10778985 ~ 10779600 (-)
G252859 lrrc23 non-coding upstream 370606 10782135 ~ 10782588 (-)
G252920 NA non-coding upstream 453831 10865360 ~ 10865700 (-)
G252373 NA other downstream 373184 10029492 ~ 10029993 (-)
LOC117599234 LOC108275963 other downstream 631614 9768247 ~ 9771563 (-)
ttll10 ttll10 other downstream 1824577 8566656 ~ 8578600 (-)
ctnnbip1 ctnnbip1 other downstream 2893386 7476205 ~ 7509791 (-)
nmnat1 nmnat1 other downstream 2994920 7399793 ~ 7408257 (-)
usp21 LOC108276040,LOC108432659 other upstream 49165 10460694 ~ 10469796 (-)
sinup NA other upstream 224972 10636501 ~ 10638718 (-)
LOC113530950 smim4,zgc:193598,LOC108436318,LOC108276132,LOC107570281 other upstream 597934 11009463 ~ 11015666 (-)
abhd6b LOC108275644,LOC108436291 other upstream 609002 11020531 ~ 11025009 (-)
LOC113530309 NA other upstream 1044491 11456020 ~ 11462706 (-)

Expression


Co-expression Network