corin (corin,LOC107731243,LOC107572417,LOC107748931)


Basic Information

Item Value
gene id corin
gene name corin,LOC107731243,LOC107572417,LOC107748931
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047610.1
NCBI id CM018556.1
chromosome length 25111544
location 24932584 ~ 24960018 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
corin Predicted to enable scavenger receptor activity and serine-type endopeptidase activity. Predicted to act upstream of or within proteolysis. Predicted to be located in plasma membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in hypertension and pre-eclampsia. Orthologous to human CORIN (corin, serine peptidase).

NR:

description
PREDICTED: histidine-rich glycoprotein-like

GO:

id name namespace
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GO:0004252 serine-type endopeptidase activity molecular_function
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KEGG:

id description
K09614 CORIN; atrial natriuretic peptide-converting enzyme

RNA

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Neighbor

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si:ch73-106g13.1 LOC108275824 coding downstream 95856 24828532 ~ 24836728 (-)
LOC117599302 NA coding downstream 150540 24775086 ~ 24782044 (-)
cnga1b cnga1,LOC107748929,LOC107731257,LOC107567610 coding upstream 17876 24977894 ~ 24982298 (-)
tfr2 tfr2,LOC108412633,LOC107673155,LOC107676171 coding upstream 55194 25015212 ~ 25026090 (-)
ctc1 NA coding upstream 68777 25028795 ~ 25041468 (-)
LOC117599278 anp32b,LOC108275503,LOC108412630 coding upstream 87602 25047620 ~ 25053567 (-)
sh3gl2b sh3gl2,LOC108276379,LOC102797997,LOC100698524,LOC101160542 coding upstream 96900 25056918 ~ 25067948 (-)
G260942 NA non-coding downstream 58837 24870714 ~ 24873747 (-)
G260921 NA non-coding downstream 67694 24844027 ~ 24864890 (-)
G260897 NA non-coding downstream 202041 24730292 ~ 24730543 (-)
G260895 NA non-coding downstream 204215 24725850 ~ 24728369 (-)
G260894 NA non-coding downstream 207207 24724222 ~ 24725377 (-)
G260962 NA non-coding upstream 14697 24974715 ~ 24975307 (-)
G260926 NA non-coding upstream 83430 25043448 ~ 25046293 (-)
G260976 NA non-coding upstream 112693 25072711 ~ 25073088 (-)
G260979 NA non-coding upstream 128621 25088639 ~ 25089918 (-)
G260947 NA other downstream 49439 24880958 ~ 24883145 (-)
si:ch1073-157b13.1 LOC108276418 other downstream 137161 24787690 ~ 24795423 (-)
tent5ab LOC108275717 other downstream 424116 24501129 ~ 24508468 (-)
LOC113530517 LOC108273546,LOC108270753,LOC108268894,LOC108273219,LOC108261257,LOC108273545,LOC108270747,LOC108261406 other downstream 546329 24374273 ~ 24386255 (-)
reps2 reps2 other downstream 616169 24273737 ~ 24316415 (-)
nfxl1 nfxl1 other upstream 1003 24961021 ~ 24977067 (-)
si:ch211-149b19.4 LOC108275830 other upstream 23961 24983979 ~ 25008193 (-)
G260972 ctc1 other upstream 80773 25040791 ~ 25042595 (-)
LOC117599229 if4e2,eif4e2rs1,LOC106608398,LOC105891435,LOC107679374,LOC108276381,LOC105007409 other upstream 116755 25076773 ~ 25079035 (-)

Expression


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