LOC113530579 (ttc39b,LOC108275605,LOC107750185,LOC107568957,LOC108412195)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113530579
gene name ttc39b,LOC108275605,LOC107750185,LOC107568957,LOC108412195
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047610.1
NCBI id CM018556.1
chromosome length 25111544
location 24745883 ~ 24765073 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_034312202.1
AGCAGAAAAAAGCAAGAGTTCAGTCACTCTAGGTTTCAGCTAGTGTTTATCCAAACTCGcgcatttatttacttattaaggACGAGATTTCACAGACTTCACAGATTGCATTTACCCTGACTGGTGTGATTAGTGAACAGAAAAGTTGATGGtgaaaaaacagaatgtttaaagatgatggGAAAGAGAAGTGTGTTTATTCCTCACATCAAGTCTCATCTGTTTGATATTGTGAAGCAACGTTAAAAGGTTACTGTCACGTCGTTCAGTCGCATTAGACGGACCTTTATAAACAACGAGTTTTGTGTAACCCAAGTTTCACAAATTTGATTCGAATACCCCTGGGTTAAGGAGACGGGATGGTTTATTAGTCTggttaataaaagtaataatatccTTCATTTATATGCCACATTTCATCAGATTTTATAATCTGATCTGTAATCCACTATCCGGTTTCACGCAGAAGAGGATTCGGGTTccgttttgagtctggttcctctcacggTTTCCTCCTTGTGTCTTCTCAGGGAGTATTTCTTCACCACCGCAcctctggattgctcattagggatctaaatctacatctggatttctgttaaAGCTGCACTGTCACGATGTCTAGAGTTAAATGAGCTGGTTTGcaggttgtgtttgtgtgatttatgttgagctaaagtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtattttgtgcagGACTGCTTCGAAGATGCCTTTGATCGAATCCCAGTtgcctCTAAGATGGACCTGCCGTTGTCTATAGAGGAGTGCACTCTGGCTCTCAACCTGCTGCTGAACAACAAGTTCACTGAAGCTCTGGACGTCCTCAGACCCTGgtatAAGGACAGTGTGTATCACGCTCTGGGCTACAGCAGTATTCTGGTGATGCAAGCAGGAATGACCTTTGAGCACAAGGACATTCAAGTTGCCATGACAGCCATCAAAGAGTCTCTGCAAACCTGCCAGAAgttcaGGAAGAGAAGTTCGATGGTGGACTCGCTCTCCAGTTTGGTCTCTAAACAGTCATCTAATGGTCTgaaagcagaggaGATGCACGCAGAGATTTGTTATGCTGAATGTCTGCTACAGAAAGCCGCACTGACCTTCATACagGATGAGAACATGATCAGCTTCATTAAGGGTGGCATGAAAATCCGCACCAGCTATCAGATATACAAggaCTGCCAGAATGTGTTAAACGTGTGTCAGGGTGTGGACAGACACATCGACGCCTTCACACAGTTTGAAAGCGGCGTCAAGCTGGGCATCGGCTCCTTCAACCTgATGTTGTCGCTGCTGCCTGCGCGAATCCTCCGACTGCTGGAGTTCATCGGCTTCTCAGGGaacagagagtttGGGCTGGCCCAGCTGAGAGAAGGAGCAGCAAGTCACAGTTTAAGATCCATCTTGTGTGTGTTAACACTGCTGGTGTACCACACCTACGTCTGCCTCATCCtcgGAACAGGAGAAGCGAACTTGGTGGAAGCAGAGGCTCTGTTAGAGCCGTACGTGGACAAATTTCCTAAAGGTTCCATCATCCTGTTCTACACGGCACGCATCGCAGTACTGCGCGGACATTTCCACAAGGCACAGCAGAAGTTTGAGGAGTGTATTAGTTCTCAGCAGCAGTGGCGTCAGATTCATCACCTGTGTTACTGGGAGCTGATGTGGTGTCACTCGTTCCAGCAGCAGTGGAGTGAAGCGCACCGTTACGCCGATCTACTGTACAGAGAGAGCCGCTGGTctaaagcgaTCTACGTGTATCAGAAAGCTGCTATTCTCAGCATGATGAGTGAAGACGAGGTGAAGAACACTGGGGAGGACATTGTGGACTTAttcaggcaggTGGAGGGGCTGAAGCAGCGATTAGCCGGGAAGTCCATCCCCACTGAGAAGTTCGCGGTGAGGAAAGCTCGCCGATACTCAGGAGCCAAACCTGTCAAACTAGTCATCCCTGCactgGAAATGATGTACGTGTGGAACGGGTTCGCCATTGTGGGGAAGCAGCCGGACGCCACAGAGGCTTTACTGATCACTATAGAGAAAGCAGAGGAACAGCTGAGGAACAAtcccaAGCCCACAGAGTATCACACGGATGACGAGTGTTTGGTGCAGATGTTGAAGGGTTTGTGTCTGAAACATCTGGGCAGGTTCCTGCAGGCGGAGCTCTGCTACTCACAAGTCAttgcaagtgagaaGAGGATTCGTTATGATCATTATTTGATCCCTTTCACTCTCTATGAGCTGGGTTTACTCTACAAACTGCAGGGAGATGTCGCCAAGGCAACCAGATACATCGAAGACGCcaaGATGAATTATAAGGATTACTCGATGGAGTCTCGGCTGCATTTCCGCATCCACGCAGCGCTGAACAGCCTGAAAGGTACTCCGGTCAACTCGCCATAGCAACGGGCACTTCACaccctgacctttgacctttacgATGGGAGCGACATCATCCTGATCATCACAGTACTGTAACGAGTGACGAGTAAAACGTTCGTCTAGAAAAACACACCAAAGTGCTTTTCCTCTTCTGTGTATTAGCAGAGAGGAGAcgttagaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatgcttgtaCCTCAGCAGGTCAAAACTTGAAATGGGGTTTAGTtgtttatagaaatattatataattaaggGAGAATGgtgtataaattttatttaattttctttttatcttctatttttttttctcatgagcaaaaatgaaaaaatcaaGCAAAATCCAACATGGCTGCCTTCGGCCTTGTTCTagttaaagctgcagtatgaattttttaaaaccttttttatgCTTAAAAATTAGCATTGAGAAGCATTTATGAGTCGGTTCTGCTCtctgagtgggcggggcttcctcactcacctgtcaatcacagtaacactagccaatcattggTGCttgcagcagttcgaaaagatgcgaTGTTTTCACGCTCTCGGATAACTAGCTCAGCTAGCAATTAAACCTTCGACTATGGAAATGTGGCTGCGACTAAATTGACTGAATTCGTCGTACGTTTTTCGTACGTGGAAATTAACGTAACGtgtttttactttacattcTCCACAGGAGAGGAGCACGTGATGTTATGAAAAGATTTCACTTGCAGTAACACATTTCCACCAGAGATGTCACCAAATCACTCAACGCCCCAAAGttacatactgcagctttaaagtttttttttttctggtgattAAAATGAGTTATTTTTAGTTTAAGTTCTAGCACAGTTTAGACAATCATAAAGCTTCGGTTACTGACGCTGTGCTGATGCCGACGTCTGATCAAGAACAGCTCCGTGCTTTTCCATTGGTTCTCTTCATCGCCATGACAACTCATAGAGCAGTTCAAATGATTTGCATAAGACACATGTGAAACAGTATGGCGAGATGTtggaatattgaatattattaTTGAAGGAAATAGCTGAATTAATCGTGATGATTGTTattaggacacgcccacaaaTGATGACGTAATAGCTGCGACTCTTAACCTGGTGGAAGTGGGAGGCGGTTCATCAGCGCAGTATCGCAGAAAAACTGTTACGAAGAATATTTACTCAAATCTaaaatccaagatggctgctTTCAGgatcttttattgttttattcacaccaaacatttctgtttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcattctcaCCCCTCTGTGTGGCTCACTGTAtggtgtttaatattttattgcgTACCTTTTAAACGAGCCTCACTGCATCATTTCAGCTTTGCGTACTTTACGTTtgtgtaaattatatatatatattttcgtAATGCTGTGTGATGAGATGAGATGCAGTAGCGCAGAGTTTACGCTGATCATCAGTTACACGATACATATCACGGTATTATCACAATATTCTCATCACCATAAAATCTGCACAGCGTCTTCTAAAGGTCCTGATTCGTCAGGAGAAATCCATCCCATAATACTCAGGCTCTGGAGCAGAtcagaaatattatttattctagaaattgtttctattatttattctagaaattctgaaattgtttatttcattagaAAGGAAATGTTACATTTCTTTTGGTTTGGATTAGACACAAAATCATACACGTGAAAGTATAGATTTATAAGATCAGACACGGATTCATACGTTTAAAAGTTATTACTAATGAAAAGATTATAAATGTagataaattacaaattataaaCTTAAAAGATTAGactttaaatgtatacattaaGAAGATTAGACACAAAACTGTAGAATTGTAAGATTTGGCCTGTTCTAGAATCAGAAAATTCAGACACCAAAGGATAGAAGATCAGACGTAAATTTTTAAATTGGAAAATTAGACAGAAAATGAAACTGAGGAACATTAGATTTTAACTTTCTCAGATTTGGTACGTTATAGAACCGAAAAATTAGGCAGAAATTTATCCTTCAGATTATTAAAACATAACGATATGTTTGGAAGATCAGATTTAGATTCAGTTTAGATCCTGAGGTTTAGATGATTTTGGAGATTAGATTCTGAAGGTTACAGtcagctccaaaattattggcacgcTTGATAAAGATTAGTTTAAAAGaaaggttatgaaaaaaaagtctttgtggttaattagcttaatctcgCACTGAGTATACatgagagaaatctaacctttaaatgatgtaaatttattctacaaaaaaaattgcaattatcaatcaaaaaaagtaataaaacctTGTGTCACAATTCTTGCATtgataattctggagctgagtGTAGATACACATTTACCGCAACACTGTCTCAATGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAATCACACTCCAGCTCGGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACATTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACTggctcattaatatttatgatcTCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAATCACACGCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAATCACTCGCCAGCTCTGTGTAGAAcgttaataatagtaataataataataataatagtaataataataatgggtttAGACTGATTGTtatctctcttttattctctctctctgtctgtctttagaTGTAAGGCAATATTCAGGTACATCAGGAGGAGTTTCTCTCGATCACTTTGTTgtgacatgaaacatgaaaaaagaataaataaaaaaaaagaatttagtataaatttaatcataaactataatgtaaatatatacacgAATCTCTCCATTGCTTTACTATGCAGATTGTATACGcacatattcataaaaataaatgtacaatatcCGTTACTTTAAGTAAAACACGCTAAACAAGCGATCTtagtttttttcctcaaacacCAGCACATATGACATGAAGCTCCTCCAGCAAGCTGACggcttttacaaagtgctgctGCTGACGAAGCTgcaaaaaagttacatttaaaaaacaaaaacacgctGAGTGATATCACAtgcgttttttgttttttaatcgctgaccaatcaggtggcagctcagggagaaaacaaaaacaagcagtaCAGTGCGGAGTGCGAGTCTCATGACACAGGGCTGTACTCACATTCgcaacttaagtccaaaagttaggAAAGTTccaggaaagttgctggtattcagagtcgggttacgcggCTGCTTGAGTGGAATTTCTGAGCTCCgctttcagattattaaaatcacctgcgcgtagttcacacctccgcggcttcagatttttcttgagtagaagtgtcTGAGATAACGGCGTCTAGACCACCTTTAAACTGCTCGCTCGTGTCGATATCGCAGAAGAATGTGTTTAAGTTCGAGGTCAGAATCACTCGTACCTCAGACGCGGCTCtattttagacaaactccgctCCGTGTACGTCATTCTCTCACGTAACTCTCTGAATATTAACAAGTCTGTGTGTAGTTTCCTGACTGAGCACTTACCTCAACTCTGAGTGATTATAAACAGACTTATGAGATGGTAATTCAGTAATTCTGCAGTCATTCAAAATGGCTCAGTAGTGGGCGGAGTCTGAGGCACCCGCTGATGACATCAGACAGCAGTGTTTGGCTAAAAGAAATGTCCTTCCAGGAACATGTTCTACATGAAAGTATCAGTAGCAGAGCAGAACACTGAGAGCGGTTCTACATCGCCTGCGTCCGACCCTTTCTCCATCAGCCGACTCctgctaatttgcatataatttgcatatcagacgCCGCAGACTCCTAGTTGCCTTGTGTTTATTCCAGGTGAAGCTCCGTGTACTGTACGGCTGGTCGATGCGATGAGaagaataaatatatgaataaacagATGTACAGATAGATGTATATATCGCTACGCAGGACagagttttatttatatcagcGTTTatgttgtgtgagtgtgatcAGAAAAGTCACACCGAGGTCACATGATCACCCCGTTAGCTATGAGAACGTAAAGAGACGATACACCACAGAGAAGTAGTTCTTGACTCGATTATCGGATTAATACCTCCATCTCAAACTGCACACTACGATGATTTATACGATTTATAGGAATTCCAGTCTACACTCTACTGTACTAAATAGTGCGCAGGTTGTCTTTACTAAGGCTTTatcccaaaacacacactacactactaacTAGTATGCTATGAAGGTTCATTTTTAGGAGTATGACTCTATCCTAAACAGCATACTAGCATACTAaatagtgtgcgtgtgtgattcTGTAGGATTGAGGCTGCGTCCTGAACCTCAGTAAACCACAGTGTGATGGGGTTTATACAGGATTAAGGCTGCATCCCAAATGCATACTGCTGTATTAAATAGTGGGCAAGTGTTAAGGTATAGAGTCATGCAGAAGAGGGTGTGTAGGCTGTtaagtagtgtgtagtgcagttgtttgtggtttgggacgcagcccgaGTCTCTTCATGATAGCGTCTGATTTTATGTTTctcactcatcaccactcaGCCTgcatctttatttctttacaacatttaattattaaatattaattattaatgatagTACAAAGTATAATGATATAAGTAcaaagttgttttctttttacatgtatttgttcacattttgattctgtatgtttttttttatttcagttaaacaCCAAATGTTGAtcagaaaatgtgtaaaaaaaaaa
>XM_034312203.1
GGGCGgaccgaacacacacacacacacacacactctctctctctgagagcGGTAATGCTGAGTCTGTTGGAAGGTGTGTGTTTACTTCCCCTGTGAGCTCGCGCTGGACACAGCGACATGGCGGCGCGCGGTAACGGAGCGGAAAACACCGACAGCACCGAGGACTGCTTCGAAGATGCCTTTGATCGAATCCCAGTtgcctCTAAGATGGACCTGCCGTTGTCTATAGAGGAGTGCACTCTGGCTCTCAACCTGCTGCTGAACAACAAGTTCACTGAAGCTCTGGACGTCCTCAGACCCTGgtatAAGGACAGTGTGTATCACGCTCTGGGCTACAGCAGTATTCTGGTGATGCAAGCAGGAATGACCTTTGAGCACAAGGACATTCAAGTTGCCATGACAGCCATCAAAGAGTCTCTGCAAACCTGCCAGAAgttcaGGAAGAGAAGTTCGATGGTGGACTCGCTCTCCAGTTTGGTCTCTAAACAGTCATCTAATGGTCTgaaagcagaggaGATGCACGCAGAGATTTGTTATGCTGAATGTCTGCTACAGAAAGCCGCACTGACCTTCATACagGATGAGAACATGATCAGCTTCATTAAGGGTGGCATGAAAATCCGCACCAGCTATCAGATATACAAggaCTGCCAGAATGTGTTAAACGTGTGTCAGGGTGTGGACAGACACATCGACGCCTTCACACAGTTTGAAAGCGGCGTCAAGCTGGGCATCGGCTCCTTCAACCTgATGTTGTCGCTGCTGCCTGCGCGAATCCTCCGACTGCTGGAGTTCATCGGCTTCTCAGGGaacagagagtttGGGCTGGCCCAGCTGAGAGAAGGAGCAGCAAGTCACAGTTTAAGATCCATCTTGTGTGTGTTAACACTGCTGGTGTACCACACCTACGTCTGCCTCATCCtcgGAACAGGAGAAGCGAACTTGGTGGAAGCAGAGGCTCTGTTAGAGCCGTACGTGGACAAATTTCCTAAAGGTTCCATCATCCTGTTCTACACGGCACGCATCGCAGTACTGCGCGGACATTTCCACAAGGCACAGCAGAAGTTTGAGGAGTGTATTAGTTCTCAGCAGCAGTGGCGTCAGATTCATCACCTGTGTTACTGGGAGCTGATGTGGTGTCACTCGTTCCAGCAGCAGTGGAGTGAAGCGCACCGTTACGCCGATCTACTGTACAGAGAGAGCCGCTGGTctaaagcgaTCTACGTGTATCAGAAAGCTGCTATTCTCAGCATGATGAGTGAAGACGAGGTGAAGAACACTGGGGAGGACATTGTGGACTTAttcaggcaggTGGAGGGGCTGAAGCAGCGATTAGCCGGGAAGTCCATCCCCACTGAGAAGTTCGCGGTGAGGAAAGCTCGCCGATACTCAGGAGCCAAACCTGTCAAACTAGTCATCCCTGCactgGAAATGATGTACGTGTGGAACGGGTTCGCCATTGTGGGGAAGCAGCCGGACGCCACAGAGGCTTTACTGATCACTATAGAGAAAGCAGAGGAACAGCTGAGGAACAAtcccaAGCCCACAGAGTATCACACGGATGACGAGTGTTTGGTGCAGATGTTGAAGGGTTTGTGTCTGAAACATCTGGGCAGGTTCCTGCAGGCGGAGCTCTGCTACTCACAAGTCAttgcaagtgagaaGAGGATTCGTTATGATCATTATTTGATCCCTTTCACTCTCTATGAGCTGGGTTTACTCTACAAACTGCAGGGAGATGTCGCCAAGGCAACCAGATACATCGAAGACGCcaaGATGAATTATAAGGATTACTCGATGGAGTCTCGGCTGCATTTCCGCATCCACGCAGCGCTGAACAGCCTGAAAGGTACTCCGGTCAACTCGCCATAGCAACGGGCACTTCACaccctgacctttgacctttacgATGGGAGCGACATCATCCTGATCATCACAGTACTGTAACGAGTGACGAGTAAAACGTTCGTCTAGAAAAACACACCAAAGTGCTTTTCCTCTTCTGTGTATTAGCAGAGAGGAGAcgttagaacacacacacacacacacacacacacacacacacacatgcttgtaCCTCAGCAGGTCAAAACTTGAAATGGGGTTTAGTtgtttatagaaatattatataattaaggGAGAATGgtgtataaattttatttaattttctttttatcttctatttttttttctcatgagcaaaaatgaaaaaatcaaGCAAAATCCAACATGGCTGCCTTCGGCCTTGTTCTagttaaagctgcagtatgaattttttaaaaccttttttatgCTTAAAAATTAGCATTGAGAAGCATTTATGAGTCGGTTCTGCTCtctgagtgggcggggcttcctcactcacctgtcaatcacagtaacactagccaatcattggTGCttgcagcagttcgaaaagatgcgaTGTTTTCACGCTCTCGGATAACTAGCTCAGCTAGCAATTAAACCTTCGACTATGGAAATGTGGCTGCGACTAAATTGACTGAATTCGTCGTACGTTTTTCGTACGTGGAAATTAACGTAACGtgtttttactttacattcTCCACAGGAGAGGAGCACGTGATGTTATGAAAAGATTTCACTTGCAGTAACACATTTCCACCAGAGATGTCACCAAATCACTCAACGCCCCAAAGttacatactgcagctttaaagtttttttttttctggtgattAAAATGAGTTATTTTTAGTTTAAGTTCTAGCACAGTTTAGACAATCATAAAGCTTCGGTTACTGACGCTGTGCTGATGCCGACGTCTGATCAAGAACAGCTCCGTGCTTTTCCATTGGTTCTCTTCATCGCCATGACAACTCATAGAGCAGTTCAAATGATTTGCATAAGACACATGTGAAACAGTATGGCGAGATGTtggaatattgaatattattaTTGAAGGAAATAGCTGAATTAATCGTGATGATTGTTattaggacacgcccacaaaTGATGACGTAATAGCTGCGACTCTTAACCTGGTGGAAGTGGGAGGCGGTTCATCAGCGCAGTATCGCAGAAAAACTGTTACGAAGAATATTTACTCAAATCTaaaatccaagatggctgctTTCAGgatcttttattgttttattcacaccaaacatttctgtttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcattctcaCCCCTCTGTGTGGCTCACTGTAtggtgtttaatattttattgcgTACCTTTTAAACGAGCCTCACTGCATCATTTCAGCTTTGCGTACTTTACGTTtgtgtaaattatatatatatattttcgtAATGCTGTGTGATGAGATGAGATGCAGTAGCGCAGAGTTTACGCTGATCATCAGTTACACGATACATATCACGGTATTATCACAATATTCTCATCACCATAAAATCTGCACAGCGTCTTCTAAAGGTCCTGATTCGTCAGGAGAAATCCATCCCATAATACTCAGGCTCTGGAGCAGAtcagaaatattatttattctagaaattgtttctattatttattctagaaattctgaaattgtttatttcattagaAAGGAAATGTTACATTTCTTTTGGTTTGGATTAGACACAAAATCATACACGTGAAAGTATAGATTTATAAGATCAGACACGGATTCATACGTTTAAAAGTTATTACTAATGAAAAGATTATAAATGTagataaattacaaattataaaCTTAAAAGATTAGactttaaatgtatacattaaGAAGATTAGACACAAAACTGTAGAATTGTAAGATTTGGCCTGTTCTAGAATCAGAAAATTCAGACACCAAAGGATAGAAGATCAGACGTAAATTTTTAAATTGGAAAATTAGACAGAAAATGAAACTGAGGAACATTAGATTTTAACTTTCTCAGATTTGGTACGTTATAGAACCGAAAAATTAGGCAGAAATTTATCCTTCAGATTATTAAAACATAACGATATGTTTGGAAGATCAGATTTAGATTCAGTTTAGATCCTGAGGTTTAGATGATTTTGGAGATTAGATTCTGAAGGTTACAGtcagctccaaaattattggcacgcTTGATAAAGATTAGTTTAAAAGaaaggttatgaaaaaaaagtctttgtggttaattagcttaatctcgCACTGAGTATACatgagagaaatctaacctttaaatgatgtaaatttattctacaaaaaaaattgcaattatcaatcaaaaaaagtaataaaacctTGTGTCACAATTCTTGCATtgataattctggagctgagtGTAGATACACATTTACCGCAACACTGTCTCAATGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAATCACACTCCAGCTCGGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACATTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACTggctcattaatatttatgatcTCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAATCACACGCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatttCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTACtgattcattaatattcatgatctCACCTCATCCAGTCACACTCCAGCTCTGTGTActggctcattaatattcatgatctCACCTCATCCAATCACTCGCCAGCTCTGTGTAGAAcgttaataatagtaataataataataataatagtaataataataatgggtttAGACTGATTGTtatctctcttttattctctctctctgtctgtctttagaTGTAAGGCAATATTCAGGTACATCAGGAGGAGTTTCTCTCGATCACTTTGTTgtgacatgaaacatgaaaaaagaataaataaaaaaaaagaatttagtataaatttaatcataaactataatgtaaatatatacacgAATCTCTCCATTGCTTTACTATGCAGATTGTATACGcacatattcataaaaataaatgtacaatatcCGTTACTTTAAGTAAAACACGCTAAACAAGCGATCTtagtttttttcctcaaacacCAGCACATATGACATGAAGCTCCTCCAGCAAGCTGACggcttttacaaagtgctgctGCTGACGAAGCTgcaaaaaagttacatttaaaaaacaaaaacacgctGAGTGATATCACAtgcgttttttgttttttaatcgctgaccaatcaggtggcagctcagggagaaaacaaaaacaagcagtaCAGTGCGGAGTGCGAGTCTCATGACACAGGGCTGTACTCACATTCgcaacttaagtccaaaagttaggAAAGTTccaggaaagttgctggtattcagagtcgggttacgcggCTGCTTGAGTGGAATTTCTGAGCTCCgctttcagattattaaaatcacctgcgcgtagttcacacctccgcggcttcagatttttcttgagtagaagtgtcTGAGATAACGGCGTCTAGACCACCTTTAAACTGCTCGCTCGTGTCGATATCGCAGAAGAATGTGTTTAAGTTCGAGGTCAGAATCACTCGTACCTCAGACGCGGCTCtattttagacaaactccgctCCGTGTACGTCATTCTCTCACGTAACTCTCTGAATATTAACAAGTCTGTGTGTAGTTTCCTGACTGAGCACTTACCTCAACTCTGAGTGATTATAAACAGACTTATGAGATGGTAATTCAGTAATTCTGCAGTCATTCAAAATGGCTCAGTAGTGGGCGGAGTCTGAGGCACCCGCTGATGACATCAGACAGCAGTGTTTGGCTAAAAGAAATGTCCTTCCAGGAACATGTTCTACATGAAAGTATCAGTAGCAGAGCAGAACACTGAGAGCGGTTCTACATCGCCTGCGTCCGACCCTTTCTCCATCAGCCGACTCctgctaatttgcatataatttgcatatcagacgCCGCAGACTCCTAGTTGCCTTGTGTTTATTCCAGGTGAAGCTCCGTGTACTGTACGGCTGGTCGATGCGATGAGaagaataaatatatgaataaacagATGTACAGATAGATGTATATATCGCTACGCAGGACagagttttatttatatcagcGTTTatgttgtgtgagtgtgatcAGAAAAGTCACACCGAGGTCACATGATCACCCCGTTAGCTATGAGAACGTAAAGAGACGATACACCACAGAGAAGTAGTTCTTGACTCGATTATCGGATTAATACCTCCATCTCAAACTGCACACTACGATGATTTATACGATTTATAGGAATTCCAGTCTACACTCTACTGTACTAAATAGTGCGCAGGTTGTCTTTACTAAGGCTTTatcccaaaacacacactacactactaacTAGTATGCTATGAAGGTTCATTTTTAGGAGTATGACTCTATCCTAAACAGCATACTAGCATACTAaatagtgtgcgtgtgtgattcTGTAGGATTGAGGCTGCGTCCTGAACCTCAGTAAACCACAGTGTGATGGGGTTTATACAGGATTAAGGCTGCATCCCAAATGCATACTGCTGTATTAAATAGTGGGCAAGTGTTAAGGTATAGAGTCATGCAGAAGAGGGTGTGTAGGCTGTtaagtagtgtgtagtgcagttgtttgtggtttgggacgcagcccgaGTCTCTTCATGATAGCGTCTGATTTTATGTTTctcactcatcaccactcaGCCTgcatctttatttctttacaacatttaattattaaatattaattattaatgatagTACAAAGTATAATGATATAAGTAcaaagttgttttctttttacatgtatttgttcacattttgattctgtatgtttttttttatttcagttaaacaCCAAATGTTGAtcagaaaatgtgtaaaaaaaaaa

Function

symbol description
ttc39b Predicted to be involved in several processes, including cholesterol homeostasis; negative regulation of cholesterol storage; and regulation of cholesterol efflux.

GO: NA

KEGG:

id description
K24943 TTC39; tetratricopeptide repeat protein 39

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_034312202.1 True 8257 mRNA 0.41 18 24745883 24760695
XM_034312203.1 False 7704 mRNA 0.41 19 24745883 24765073

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cfi cfi coding downstream 658 24734614 ~ 24745225 (-)
LOC113530848 NA coding downstream 40554 24702380 ~ 24705329 (-)
LOC113530806 LOC108275724,LOC105922125 coding downstream 100150 24638291 ~ 24645733 (-)
prelid1b LOC108275727,LOC108413730 coding downstream 148224 24592873 ~ 24597659 (-)
LOC113530539 plekhg1,LOC108275720 coding downstream 161320 24537485 ~ 24584563 (-)
LOC113530888 LOC108275606,LOC107568964 coding upstream 6187 24771260 ~ 24774653 (-)
LOC117599302 NA coding upstream 10013 24775086 ~ 24782044 (-)
si:ch73-106g13.1 LOC108275824 coding upstream 63459 24828532 ~ 24836728 (-)
tec tec coding upstream 71759 24836832 ~ 24851867 (-)
LOC113525311 LOC108414782,LOC103038743 coding upstream 123661 24888734 ~ 24898675 (-)
G260897 NA non-coding downstream 15340 24730292 ~ 24730543 (-)
G260895 NA non-coding downstream 17514 24725850 ~ 24728369 (-)
G260894 NA non-coding downstream 20506 24724222 ~ 24725377 (-)
G260871 NA non-coding downstream 47459 24697969 ~ 24698424 (-)
G260885 NA non-coding downstream 51637 24693335 ~ 24694246 (-)
G260921 NA non-coding upstream 78954 24844027 ~ 24864890 (-)
G260942 NA non-coding upstream 105641 24870714 ~ 24873747 (-)
G260962 NA non-coding upstream 209642 24974715 ~ 24975307 (-)
G260926 NA non-coding upstream 278375 25043448 ~ 25046293 (-)
G260976 NA non-coding upstream 307638 25072711 ~ 25073088 (-)
tent5ab LOC108275717 other downstream 237415 24501129 ~ 24508468 (-)
LOC113530517 LOC108273546,LOC108270753,LOC108268894,LOC108273219,LOC108261257,LOC108273545,LOC108270747,LOC108261406 other downstream 359628 24374273 ~ 24386255 (-)
reps2 reps2 other downstream 429468 24273737 ~ 24316415 (-)
LOC113530810 LOC108275656 other downstream 766188 23973365 ~ 23979695 (-)
G260310 NA other downstream 981720 23763674 ~ 23764163 (-)
si:ch1073-157b13.1 LOC108276418 other upstream 22617 24787690 ~ 24795423 (-)
G260947 NA other upstream 115885 24880958 ~ 24883145 (-)
nfxl1 nfxl1 other upstream 195948 24961021 ~ 24977067 (-)
si:ch211-149b19.4 LOC108275830 other upstream 218906 24983979 ~ 25008193 (-)
G260972 ctc1 other upstream 275718 25040791 ~ 25042595 (-)

Expression


Co-expression Network