G272360


Basic Information

Item Value
gene id G272360
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047611.1
NCBI id CM018557.1
chromosome length 24879021
location 20442699 ~ 20447678 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU322739
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>TU322740
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>TU322741
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU322739 False 4847 lncRNA 0.38 3 20442699 20447678
TU322740 True 4869 lncRNA 0.38 3 20442699 20447678
TU322741 False 4867 lncRNA 0.38 3 20442699 20447678

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
sftpba LOC108276523 coding upstream 100316 20330486 ~ 20342383 (+)
hvcn1 hvcn1 coding upstream 129442 20303730 ~ 20313257 (+)
mtrex skiv2l2,LOC107571110,LOC107744101,LOC106568406,LOC100380870 coding upstream 227945 20182654 ~ 20214754 (+)
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G272470 NA non-coding downstream 301683 20749361 ~ 20749647 (+)
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G272367 LOC108276637 other upstream 43752 20398280 ~ 20398947 (+)
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G272408 NA other downstream 92647 20540325 ~ 20542954 (+)
LOC113544125 LOC100304632 other downstream 911841 21359519 ~ 21361744 (+)
LOC113543995 NA other downstream 1028409 21476087 ~ 21478880 (+)
LOC113544129 LOC108276555,LOC108427250,LOC107687808,LOC107720650,LOC107744134,LOC107678044,LOC563710,LOC107560524 other downstream 1474873 21922551 ~ 22033997 (+)
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Expression


Co-expression Network