slc46a3 (slc46a3)


Basic Information

Item Value
gene id slc46a3
gene name slc46a3
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047611.1
NCBI id CM018557.1
chromosome length 24879021
location 10302573 ~ 10320171 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
slc46a3 Predicted to enable transmembrane transporter activity. Predicted to act upstream of or within transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human SLC46A3 (solute carrier family 46 member 3).

NR:

description
PREDICTED: solute carrier family 46 member 3

GO: NA

KEGG:

id description
K20840 SLC46A3; MFS transporter, PCFT/HCP family, solute carrier family 46, member 3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
eva1c eva1c coding upstream 33823 10255575 ~ 10268750 (+)
hunk hunk,LOC108423838,LOC107691675,LOC107577711,LOC107734458,LOC104954747 coding upstream 60808 10232706 ~ 10241765 (+)
zar1l zar1l coding upstream 260777 10039409 ~ 10041796 (+)
rfc3 rfc3,LOC107589808,LOC107728889 coding upstream 282820 10014807 ~ 10019753 (+)
ccdc169 NA coding upstream 603255 9690378 ~ 9699318 (+)
dchs1b LOC108277286,LOC108438972,LOC107718741,LOC107701146,LOC107555179,LOC105907404,LOC107720538,LOC107693876 coding downstream 33096 10353267 ~ 10448165 (+)
arfip2b arfip2b,LOC108276920,LOC108438961,LOC107718740,LOC107555180,LOC107701145,LOC107557232 coding downstream 164853 10485024 ~ 10505442 (+)
fhdc3 LOC108276923 coding downstream 187055 10507226 ~ 10519216 (+)
trim3b trim3b,LOC108276924,LOC108423836,LOC107701140,LOC107557229,LOC107720632,LOC107718737 coding downstream 199847 10520018 ~ 10554251 (+)
trpc4a trpc4,LOC108423767 coding downstream 418131 10738302 ~ 10759716 (+)
G266580 NA non-coding upstream 299212 10003146 ~ 10003361 (+)
G266499 stard13,LOC107691680 non-coding upstream 356994 9944113 ~ 9945579 (+)
G266497 NA non-coding upstream 362273 9937395 ~ 9940300 (+)
G266495 NA non-coding upstream 366360 9935989 ~ 9936213 (+)
G266416 NA non-coding upstream 536078 9764641 ~ 9766495 (+)
G266802 NA non-coding downstream 226650 10546821 ~ 10547182 (+)
G266869 NA non-coding downstream 251720 10571891 ~ 10572147 (+)
G266871 frem2a,LOC108276566,LOC107701139,LOC107555183,LOC107693873,LOC107718779,LOC107720635 non-coding downstream 260688 10580859 ~ 10581182 (+)
G266892 NA non-coding downstream 346647 10666818 ~ 10668314 (+)
G266901 NA non-coding downstream 412366 10732537 ~ 10734630 (+)
dclk1a dclk1,LOC107728871,LOC107577778 other upstream 539876 9704360 ~ 9762697 (+)
LOC113543674 NA other upstream 877718 9419665 ~ 9424855 (+)
G266161 NA other upstream 966283 9335801 ~ 9336290 (+)
LOC113534874 LOC108276751 other upstream 1038462 9256943 ~ 9264111 (+)
G265807 LOC107756568 other upstream 1632776 8668814 ~ 8669797 (+)
G266868 LOC108276566 other downstream 248857 10569028 ~ 10570705 (+)
scaf4a scaf4,LOC107555128 other downstream 545441 10865612 ~ 10882265 (+)
vps36 vps36,LOC107701118 other downstream 4442142 14762313 ~ 14771073 (+)
trnar-ccu_11 NA other downstream 6767497 17087668 ~ 17087740 (+)
trnam-cau_40 NA other downstream 6767577 17087748 ~ 17087819 (+)

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