dram2b


Basic Information

Item Value
gene id dram2b
gene name NA
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047614.1
NCBI id CM018560.1
chromosome length 21552800
location 351588 ~ 360258 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU354966
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>TU354973
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>TU354974
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>TU354977
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>TU354978
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>XM_034314472.1
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Function

NR:

description
DNA damage-regulated autophagy modulator protein 2-like

GO:

id name namespace
GO:0044448 obsolete cell cortex part cellular_component
GO:0032156 septin cytoskeleton cellular_component
GO:0031105 septin complex cellular_component

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU354966 False 525 lncRNA 0.48 4 351660 354432
TU354973 True 2385 TUCP 0.39 3 356762 360258
TU354974 False 2309 lncRNA 0.39 4 356762 360258
TU354975 False 2355 TUCP 0.39 4 356762 360258
TU354977 False 2215 TUCP 0.38 4 356762 360258
TU354978 False 2031 TUCP 0.37 4 356762 360258
TU354979 False 2169 TUCP 0.38 5 356762 360258
XM_034314472.1 False 1416 mRNA 0.49 7 351588 358366

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
wdr77 wdr77 coding upstream 25281 315968 ~ 326307 (+)
pparda ppard,ppardb,LOC108281076 coding upstream 56428 282867 ~ 295160 (+)
LOC113525392 stk38,stk38b,LOC105900354,LOC107667630,LOC105016867,LOC108265501 coding upstream 109922 226264 ~ 241666 (+)
zgc:153675 LOC108255011 coding downstream 16304 376562 ~ 380543 (+)
btg2 LOC108255010 coding downstream 45850 406108 ~ 409450 (+)
arl8a arl8a,LOC107671521,LOC107722853,LOC107569762,LOC107750681 coding downstream 71254 431512 ~ 439177 (+)
apobec2a LOC108281085 coding downstream 131787 492045 ~ 495637 (+)
srsf3b srsf3,srsf3b,LOC107569752,LOC107690536,LOC107656901 coding downstream 143211 503469 ~ 508353 (+)
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G299522 NA non-coding upstream 115098 236076 ~ 236490 (+)
G299482 NA non-coding upstream 134179 209994 ~ 217409 (+)
G299486 NA non-coding upstream 146676 203812 ~ 204912 (+)
G299503 NA non-coding upstream 172923 173753 ~ 178665 (+)
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G299708 NA non-coding downstream 478105 838363 ~ 838915 (+)
G299695 NA non-coding downstream 485210 845468 ~ 847722 (+)
LOC113525237 LOC108281078 other upstream 162271 165615 ~ 189317 (+)
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LOC117599902 NA other downstream 318659 678917 ~ 726922 (+)
mfap2 mfap2 other downstream 398251 758509 ~ 805098 (+)
LOC113539702 LOC108281106 other downstream 482595 842853 ~ 844870 (+)
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