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Basic Information


Item Value
gene id camkvb
gene name camkv,LOC108414427,LOC107718199,LOC107685970,LOC107715795,LOC107659532,LOC107576418
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047614.1
NCBI id CM018560.1
chromosome length 21552800
location 2141522 ~ 2188917 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>TU356488
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>XM_034314198.1
TAGTGGATGTTCCCATGGAGGACCTGAGAAGAAGAGGGCTGAGGTGGTGTGGAGGAAATGGGTTTCTCCAAGCACTTCAATCCTGGAAATAGGaacagttcCCTCCTCTTTTTTCCCTGCACCGCGCGGCGCACAGCGGATGGGTGAAGAGCGACCGAGAGCGCAACTCGTGCGCGCATCTGTATCGAGATTTAACCATCAAAAGCATCAGCCCCATCACCGGAACGTGCCGGCCTTTCGGACGGAGAGCTCAGGGGGGGTCACCGGAAAGCTTTGAAAGCGCGCACCACCGCAAAAAgAGTGCCATGCCGTTTGGCTGTTTAACGCTCGGAGAGAAGAAGGACTACAACAGTCCCACAGATATCACAGACAGATATGATCTCGGCCAGATTGTTAAATCGGAAGAGTTCTGCGAGATCTTTCGAGCCAAGGACAAGACAACTTCGAAAATGTACACCTGCAAAAAGTTCCTGAAGAAGGACGGGAGGAAAGTGCGCAAGGCTGCGAAGAATGAGATTTTCATTCTGAAGATGGTGAAGCATCCTAATATTCTCCAGCTGGTGGATGTCTATGAGACGAGAAAAGAATATTACCTCTTCTTGGAACTTGCTACTGGTAGAGAGGTGTTTGATTGGATCCTGGACCAGGGTTACTACTCCGAGAAAGACACCAGCAATGTGATTCGGCAGGTGCTGGAGGCTGTGGCATACCTGCACTCCCTCAACATCGTCCACCGCAATCTGAAGTTGGAGAATCTGGTGTATTACAACCGCCTGAAGCACTCCAAAATAGTTATCAGTGATTTCCACCTGGCCAAGCTTGAGAATGGGCTTATTAAAGAACCTTGTGGGACTCCAGAGTACCTGGCTCCAGAGGTTGTTGGGAGACAGAGATATGGCCGACCCGTGGACTGCTGGGCGCTTGGAGTGATCATGTACATACTACTTTCTGGAAACCCTCCGTTCTACGATGAAGCAGACGATGACGATTACGAAAACCATGACAAGAATCTGTTTCGCAAAATTCTGGCAGGAGATTACGAGTTTGATTCGCCGTACTGGGACGAAATCTCCGACTCAGCTAAAAGTTTAGTAGCACGTCTCATGGAGGTCGACCAAGATCAGAGACTCACAGCGCAGGAAGCCATCAACCATGAATGGATATCTGGAAATGCTGCCTCAGATAAAAACATCaaggaaaatgtgtgtgcacagatGGAGAAGAATTTTGCAAGAGCCAAGTGGAagAAAGCCGTGCGTGTCACGACCATCATGAAGAGGCTGAGAGCTCCGgagcaccaccaaactgccgCTGCAGCTCAATCCAGTGAGGGAGCCACAAACCCTGCAGGAGGAGCACAGGAAAATCCCCAGGCTCCAGCTGAGGCCTCCACGTCCCCCGCAGGCACAGAGCCCCCTGCTGGTCTGGAGGCATCTAACGCAGAAGCTTCTTCATCACGGTGCAACGGTGAATCTCCTGCTCCCCCGTCTTTCGCCACACAGACCGGAGACGAGCAGAACGGTTAAAGTCTGTCCCTCTATCCAACCTTTCCCGCATCCCTCGCAGCAAACCCTGAGCTCTGTAAATTAGCATCTAGCATGGTCACCCTGAGCCTGCTTCGCTCTCACGGTAACATTAGCAGCGCCAGCGTCGTCTTGCAGAGCCTCGTCGACGTCTTTTCCTGAGCTTTGTCTTTTCTTGTTACGACAGCTGTATTTGCTAATCCTACAAGCCATACTGTCACATACGCTATAAAAACAGTTACATACTCTACAAAAACATGAGGATTTGCTTTGCGTTAATTGTGTTATACACatatagaatttaaaaaagatataaatagAAAAGGGTATTACTTTGCCAAATTTGGGAACTTTCATGGGATTTTTTAGTAAAGTAACAAACTCTTTGATGTACGCCTTACAATATTTGTCGCTactcagaggtgccaacattagTATTAGTTATTAGTATAGCTGTAGTATTTATTTCTGACTCCGGCGATATAGAAAACACCTTAAAAACTATGCTTTTCTACTTTCTCAAGTTAGaccaaatgcaaaaataattcacttggcggaaaattcactgaaggggaaaggacagaTTTGCTTCTGTTAGAGGTTAATATACTTCGATctgtgaattcacaagcctcagtgttgtgagccaatagaaaacaagtggGCAGGACTGTGCTCTCTTTGGTTGGTTCAAAAATTgaggagctgcttattattaattagcGATCCCATTGAACTTTTGCCCAACAGTTTCAGCTATGTTGGCACCTTTGGGTACAGCTTCGCTCCTGTGCTCAGGAAAGCACGCCGTGGCTCGTTAGCAATTGTAAAATTTCTGTAAATACTAAACTCCAGAGAGACGTAGCCAAAAACAGCATGCGTTTTACGATTACTGTTTATTTCATACAAGTCCTGCCAACCTGTGTGTCGACAAAGATGTCTGACTATCGGCCTTACACGGAGAATTTTGTCCCTCCTGGTTCAGCCATTTCTAtgtcatatttacatatttaaatattgaacattAAATAACATAAGATTTATATGAAAAATGCGCTACATGCTATACTTTATCTAGGCTGAAGTTTGTTTGATGGTTAAGGGATTTGAAGTATGCAGTCGGAACAAGGTGCACAGCTAGCTTTAGATCTGCATGGTAGCTCGGCAAATGAAAACACGCTATTCACAAATTGGTTGTTATTGGACTGTATAAGGaaatgattagatttttttttttttgtaaattacatTTACTACATTTTAAACGGCATACGCAAGCTACACATTAGTCGTTCATTTGGTTTGGCTAGGTTGCATTAAGCCATGCTCTGCTAAGAACACTATACTCTTACTGTTTGTTAGTTAAATGTAACGTGTTCGGTGTTTTAGCTACTATGCATTCGAGGTCAGCAGTTTATATCCATTAAAACGAATGCGATGTCAGACACACAActgcattaattatttataataagaaAACTTTCATGTTTCACCAAAAGATTCAgccaagatatgtttggtgGCTTATGCTTGCTTTTTGAGCTACAAACCTAATTTAGTGGAAATCTTTTAACTTCAAACATCATTAAGCTTCGTAATCTCACTTTTGAAGAAATTATTATAGCAGCTCCACCTTCTGCTTTGGGAGGCGGAGCCTAAGGGGGCTTTGGTGTTGATACCAAACATCAACGCTGccagcatttaaaaatgattctggttgtccaagatggccaccCAAATATCGGTGCAGTGATCAGCTACACTGTAAGgttttgtccatgtttatagATTAAATTAAGTCTTAAACCTACTGAAGAAATTTTGGATTTGGAGATAGTGATCCATTACTCGTTAGCAACATCAGCGTCATAGCCAGTAGCTCCAAgaatgtcttggctgatcaactacatttacacaatattggagaaatatttatttatttatttatttatttatttatttatttatttaatactctTCCTTTAATCCCTTAACCCCTGCTTAGGATGTGCTCGGTTTATAATTCCTTTTCTGTCTACGCTCTGAAATACGAACACatacaatacaaatatataatatggaAGAATAAATAAGAGTATCATATTTTATCATTAGTTACATAAAATAACATTCTTTATATGTGTGCAATTCtgtattaaaacattataaactaCAGATATGTATTAATCCATTGTACAGTATTCTGTTCTACTTATTTTAATAcgtgtttaatatattttctgtatatatttagACATTTCCATGCATTTTAGCATGAAGTACACAGGAAACTCACGAGCTCAGTCTCCTGCTCCAGTTCAGCCAGCGTGACTGAGGAGacggacgtgtgtgtgtgtggtaaagtGACAGGAGTGAGAGTGTGTTCGGCATAAACCAGAGCAATAGTCGACCTACTGCGATACTGTGACGCGTGTTCCTGCTGTTCGCTCTTGCGCTGTTCAAATGGCCTAAATGTGCTCGTGTTAGCGTCGGAATGCTGGGAGGTTCATCATGGCTGCGTTCCAGTACTGTTTTAACGAGCCCTCATCAGCCATTACTGTGTCCTCATGGACACAGTGTTACGTTAATATATTACCGTATTATGTTTAGGACCCCTTGGAGTCCAAACCTACGTTAAgactagcaagtgacaagtcACTCAtgtctcttgtgggtgtgtagcaACCGCTACTAGCgttgcttgtgggcgtggcctatccAGCTCTTTTATTATATTCCGACAAGAAActgtagtagctatatatagctactaaactagttaaacacaaattaaataactcACTATTCATTGTGACGGTGGTTTGATTTACGTTATGTGCTCGGCTTCGTTGGTCGATAAgcactagctacgtacactcagCGGAGGCAATGACaatctgctacttccttccatgCTTTTTTCTCCGTATACACGtgtctatacacatttaataaggGGTTGTATAAGACAGgataaatgaaacaatgtttatgtttttcctccatttttgcATGTCAAACAGTTGGAAAGCTGAAGAAACATCGGGCCACATCATAGCGCTATAGGactggtccgaggaatcattcaagccaatcgtttggatttgtcacatCTTTACAGCGTGATACCTAATTTACAAccaatttataaaaaaatctcAACTTGTTACAGGTTGcacattgaaaatgaatgatctCCTGCTGTTTGTCGCTTGCTCGTGTGAATGCAGCATAGCCTCAACACTGTAGAGTTTATGTAGAATTCCTCGCAAACCAATTCTAACAGGAAACGTAGAAAGAAGCAATAAAGTACTTAATGTGTCAAGAAATACAAGCTAACATTCGATGTGCTGTGTTTAAACTGATTATTATGTAGCCAGCCTACCAATGGATGGAACTTTATTACGTTATCCTGTTAGTTTGTTAGCAGGCCaggtagttagctagctaatatagcTATGTACAACGGAAATGGGTCATACCTATGGCCAAAGAACTCTTCAGCTACTGCTGTGGAAATCAAATGTGTCCATGCTAACTCCGCTACATGCTTGCGCTCGTTTTGATATAGCCGATGTCTCAACTCGATGAGGGCAAGTTGAAAACAGTTCTGGAGCGTAGGGCGTGGCTTCAAATTGCGTATCCGTCAACTGAACTTCCTGTGTTGTCACTTTAGGGAACGTTAAGGGCCTTGGTGCTTGtgccagctagctaactttgaAACGGGAAGTAACTGATAACAGTCACTTGTGAGCAGCCATTTCCTACAGCAAATTATGCACATCTGGTTCAGTTTTAAACTTATATAATGGGAGTTTGGTTTTCTTTGTGTTTGAGTCTTTTAAAGCAAATTTAGTCCCTAACTTAACTTTTAACTATTATCCAAAATGAGCAGATTGACTAAAACCATCTGCTAATGAATTCAAAAATTACTCAAATGATGAAAAGCtccatcaaaaatattttacttctcAAGAAACTTCAGACGTTTCCCAGCCTCTAACCTCTGTACTTCCATGCTAAAGTCAGTGAATCCTTTAATTCTAGCATGTTAGCAAGCAGAGTGTTTCTTTGGCAGGTTTTAAATTTATTGGCATTTCTTGTTTAAAAACATCGCCATGTTCACACAAACATTGTTTATCGGAATTAACTAGCTAAATGTGTTCACAATCTACAAGCACTCGGGTCCTTTTCGGGCTAGCATAGCGGCTAGGTGAACAGAAACGTAGCAAAATCGATGGAAGAGGCTTCAGAGGTTGTGTTTGTAAAGGCTGTATTCATGGATTTCATCGAGAAAGTGTATGTTTGTGCTGAAATCTGGTTTTCATGTATTTTACAtccatttttacacaaaaaggGAACTATGTGTATATATCAGTGCTGTGTTTGTtcattgtttccttttttttttttttttatttgtcttcatgAATCTTTCTGGTTGTTGTATATTATTTGAAACTGTATCAAACTAATGaattcttattgtttttttttttttttaaattattttatttgacagCGATAACCAGGAGGGTTAGAGTAAAACTTTTTACGTTACGTGTTGGGTAAAATTTTTACAGACTACATGTACACACTTAGACCGCGATAAAATACTGTGTTAATACGACTCAAAGCAATGCTTTTTTAGCGCAGAACATTTGCATCATAGTGTGTTGGGTGTTgagttgttgatttttttcttgttgtagTCGATACTGTGGTTGTTCATGGGCGTGCAAGCTCTGCTCACCTggagctctcactctctctctctctctctctctctctctctcatctttaTCCTCTGCATTCTTCTCAGTTTCGTCCATTTGatggtaataaattaaaaataactacaataatgctcaaaaaataaagtaaaaaatgagTCAA

Function


symbol description
camkv Predicted to enable calmodulin binding activity and calmodulin-dependent protein kinase activity. Predicted to be involved in peptidyl-serine phosphorylation. Predicted to be located in cytoplasmic vesicle membrane and plasma membrane. Predicted to be active in glutamatergic synapse and postsynapse.

NR:

description
PREDICTED: caM kinase-like vesicle-associated protein isoform X1

GO:

id name namespace
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KEGG:

id description
K08812 CAMKV; CaM kinase-like vesicle-associated

RNA


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Neighbor


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si:ch211-213o11.11 LOC108281028 coding downstream 432595 2621512 ~ 2629721 (+)
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LOC117599925 NA other upstream 642350 1496860 ~ 1499172 (+)
erc2 erc2,LOC107582387,LOC108414413,LOC107694874,LOC107699320 other upstream 646877 1448442 ~ 1494645 (+)
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LOC113539599 tmem110,mustn1,LOC108435844,LOC107746891,LOC107656046,LOC107755187,LOC103359875,LOC107091502 other downstream 2262123 4451040 ~ 4469196 (+)
ptprga ptprg,LOC107752167,LOC106583020 other downstream 3021727 5210644 ~ 5471561 (+)

Expression



Co-expression Network