slc6a6b (slc6a6,slc6a6b,LOC107719944,LOC107562730,LOC107676359)


Basic Information

Item Value
gene id slc6a6b
gene name slc6a6,slc6a6b,LOC107719944,LOC107562730,LOC107676359
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047614.1
NCBI id CM018560.1
chromosome length 21552800
location 14765186 ~ 14789849 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026932607.2
ACTGTCAATCAGGGCTTACTCTTAGCTGCACGCACATTTAGGCTGTGGCAGCAGAGGCATGGTGACAGCGGACAGAGAACAGCACACACCATTCTAACGCAGTCATGAAGGAGATCATGGCACAAAAAGAGAAACTTCAATGTCTGAAAGACTTCCATAAGGACACTCTGAAGCCATCCCCAGGGAAAAGTCCTGGTACCCGACCTGAGGATGAGGCTGAGGGCAAACATCCTCAGCGGGAGAAGTGGGCCAGCAAGCTCGACTTTCTTCTGTCTGTGGCTGGAGGCTTTGTTGGTTTAGGAAACGTCTGGCGTTTCCCATACCTCTGCTATAAGAATGGAGGAGGTGCATTTCTCATCCCATACTTCATTTTCCTGTTTGGTGGAGGCCTACCTGTGTTTTTCCTGGAGGTGGCTCTTGGCCAGTTCACCTCTCAGGGAGGAATCACTTGTTGGGAAAAAATCTGCCCCATTTTTACTGGTATCGGCTACGCTTCCATTGTGATCGTTTCCCTACTCAACATCTACTACATTGTGATTTTGGCTTGGGGCTTGTACTACCTGTTCCAGTCCTTCCGGCCTGAGCTTCCTTGGGCCAGCTGCAATAATGAGTGGAACACGGAACACTGTATAGAGGACACACTCCGCAAGAATATGAGCTTAGGGGGGCCTTCCAATACTACGAACTTCACGTCACCAGTCACTGAGTTCTGGGAGCACAACGTCCTCAGTATTTCTGATGGCATCGATAATGTGGGCCCTGTTAAATGGGACCTGGCTCTGTGTCTCCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTTCTTCTGCATCTGGAAGGGTGTGAAGTCCACAGGAAAGGTTGTGTACATCACAGCAACCTTTCCATTTGTCATGCTGGCTGTGCTCCTGATCCGGGGTGTCACACTTCCTGGGGCAGCCGAGGGCATCAAATTCTATCTGTATCCAAATGTCACCCGTCTACAGGATCCTGAGGTTTGGATTGATGCAGGGACACAGATTTTCTTTTCCTACGCCATTTGTCTGGGAGCAATGACATCACTGGGGAGCTACAACAAGTACAAATACAACTGCTACAGGGACTGTTTGCTGCTGGGAGGCCTGAACAGCGCTACCAGTTTTGTGTCTGGCTTCGCAATATTTTCCATCCTGGGCTTCATGGCACAAGAGCAAGGGGTGGACATTGCCGATGTGGCAGAGTCAGGTCCTGGCTTGGCCTTCATTGCTTACCCTAAAGCTGTGACAATGATGCCTCTGCCTACATTTTGGGCCATTCTCTTCTTCATCATGCTTCTGCTACTAGGTCTCGACAGTCAGTTTGTTGAAGTGGAAGGACAGATCACTTCACTGGTGGATTTGTATCCATCCTTCCTACGGAAGGGTTACCGTCGAGAAATCTTCATAGCTATAATATGCTTTGTGAGCTACCTTCTGGGACTTACCATGGTCACTGAGgGTGGCATGTATGTGTTTCAACTCTTTGACTACTATGCAGCCAGTGGTGTGTGCCTTTTGTGGGTTGCATTCTTTGAATGCATTGCAGTAGCCTGGATTTATGGTGCTGATAATTTCTATGATGCAATTGAGGACATGATTGGATACAGACCAAATCCTTGGATGAAGTGGTGCTGGACTGCAATCACACCTTTGCTTTGtgtgggatgtttcattttctctttggTCAAATACAAGCCTCTGACGTACAACAAAATCTATGAGTATCCGGACTGGGCCATTGGTTTGGGATGGGCCCTCGCCCTCGCATCCATGGTTTGCATACCTATGGTAGTTGTGATCAAGATCATCCAGTCTGAAGGCCCTCTCATTGAGAGGATTAAAGCAGTGGCAGCTCCGGTGCGAGGCAGTACAAATTCATGTCCTCAGGAGTACCGACCGAAGGGCTCAGAAATGGCACATCCCCTTGACCCCAATGGGAACAACGGCTTGATCAAGCCCAGCCACACTATCGTAGAAACCATGATGTGAGCGCTCTCTGTGAGAGAATCCAATCACCTGCtttccattttatatatataaatacatatatattaaatacaatgTTGACACAGTCATAGGACCAGGTTTACATATCTGCACTAGAAgttctttcccttttctttttttttttttttttttatagaggaAGTCAcccttttttttgtcagtgtctacttttaatatttttatcataacattgttattttactgttataacTGTTGCTGTAATTAGATGAAAGATTGATTTCCATACACAAACACCAGTATCGAAATAgtcaaacatttcttttttcttttcttgttttttttcttttctgtaaataatgacgtttaaatgatttgttgttgGAGTGGACAAACAAGACCAATTAAGTGCTGCAAATGAGAAAAGTTTATAGTGTTCAAAAAGTAATATTAGTGTACCTAGACAAAAAGTGTCTTGTTGGACATTTTTTGGTAAGGCATCTGTGCATATCTAGACAGCAAGCGTAAAATTGAAACTAATTGGACATCTACACTCAAACATTACGTTCACAATGGAACAGAGACACTACGCTATTTTCTGGTGCAAGTTTAACACACTGAAACCACCACTGCACATGAGGAATGAGTTAACACATCGAAATTACTGTAAGCATCTTTGAAAGCACAAATGGTCACACTAATTCTTACCATACTGATCTAGTACAATAAGCTTTAACTTTTAACATCTCCACCATTTATTCTCAAGGgtctgtattcagagttgacaACTTAAGTCCAAGAGAGCCATCAATATTTACGATGGGAAGGTTAAGTACATCAGAAATGGGCTGCACAGGTTGATCTGCCTGCATGAAGTTCATATCTACGTGGTTGCAGGATTTTTTCAAAGCAGTAGCTTCTGAGACATGGTTTTTCAGTAGTGTCTAGACCGCCGACTTTAATCAGAAGAACTTGCATTTAAGCCTGAATTAAAACAAGGGTAGAAATTGCGCATTgaagaaatacatttaaaatgaaaaacaaaaagacgaATACCATGATATCTGAATGAGAAAAtataaagcactgaaataaatctaataggagtctagtatattggcaatatattatatataacaggATACTAGGAACAATCACTGTAAATTTTGTTTagtttaacaatatggctttcAACCTCATTATTCAGAAgcttataaaataacatttgatCCGGCAACTCCTATTATTttgtactttatatttttttatgttgtgcACATACAAATTGTGCATACAATTTAATGAAGACAGTTAAATAAAGCACAGCATGTATgactaattaaataatgtgaCTATTTTTGTTAATTCGATATGCTGTCCTATAAAAAcgttttaaaaaagtgaattttgttttttgggggtAATCATAGCCCAAAACACAAATTTCAATGTAACATCAAACTGTGTGGCAGTGGCCCtgacagtggcactggacttaatactgctgcTCACTCAAGCCGATATTGTACTTACAGTATATCCAAGGTTAAGAATCATGCGTAACCAAGACACACCACTGTTTTTGGTGAACTCCACCCCGCATGAGTAACTCTCACACCCATACTCAAATAGCATATTCGAGCATATTAATCTTGTGCATATTAGCATATTAATCTTGTGGTTATGTCTGTGTTCTGGACACCAGGATGCACAATTTTGGCATTAAATCCTCACTAAGCGTgtgtaactcaactctgaatacagcccaggTACAGCATATTTTTGCGTGGTTCTTAAATTGATGTAATTAAGCGCTCAAACAAATTCATTTCTACCCACATTTCAACACTCCCTAAATATCCCACAGTCAATTGTTTTTAACCAGCTTCATAAGAATGGATCAGGGCCTAGACacatactgatactggtatGTTCGAATTTGAAATTGCTCTTGTCCAAGCATTTGTGTCACACCAATACAAAGGTAGTATTTTATGGTCCAAGCTGTTTgtacatgtcattcttttattttcctttgcCTTTTGTATTCTTAATATTAAGATTGTACTTAGCTTCTGTcagcaattattatttttttataggaCAAAATTTTATATAGAGCTTTTAATCAGTGCAATTGGTGGCAATTGTATCGTGCAATACTTTGTAGAATGAAATGCATTGTTCCTGTCTTTTAAAAAGATGCTACTTGCAGTGAAATATCTTTATAACAAAATATCAGGCACAATTAATCATTGCAAGGTAACAccgaactaaaaaaaaaaattgtacttaCTGTGATACTTTtcatattttagtattttaaaaagaaattatattatttttctattggTTTATCTGTTAGATAACATACATTAAtcttaatgattaatgatttttaatagcCCAGTTTGGACTGATATATcatataattaacattaattactgCTTCTGAAAGCAGAACTGTGTTCAAACTAAACTATTTGCTTGCAAGCAAGCTGTAACTAGGTTTGAAAAGCTCTAGAATATTCCGTTTAGTCTCAGGTCTGATCCTAATGCAGAAACAGACTTGAGAGGTTTCTCTAAATCTTTTACACCTACATGGTTTGGCAAAGTGTCGGTGTTATTAattcatgaaaacatttttaaaaattctttttttaaattcttgatTAAAACATGGAAgcgaaaatgtatttaaaagttTTTGGAGTAcctaaaaactttttttttatttcttaataaacatttatttttgaaaaaaagaaaagaaaaagcctcCTGCTTTTGCTGAATATTGCCAGAACTAATTTCTTTCCAAAATTTGAGGTGAaatcaaatcattaaaattgtttGAATATAACTCAATCATACCTTTGGGTTCATGAAGGCTTTGGACTGACgcactaccacacacacactctttaattTAAGGTGACCCAACAACAATGCTGTTGCCAAGCCAGGGTATTTTAACACATGCCTGGCTTCCTAAAATATGGCTTGTGAGGACACAACCAGAAGTGCCATGTTAGGTAATGGAAACTTGGTCCCAGATAAAACTGAACATTGTATAAATGTGCATCTTCATTATGTTCACTGCGTTACTGTTTCAGGGGTCACTGAGAGTTGCACTGATCCTTTTCCCCAGCTGCTGCTGTAGTAGTGATCTTATTTGAAACAGACTGATAGCACCCAAGGGATGAGAAATCTGGAGAGTTTGCAAAATATCACAAAACTTCCCAAGCTTAACTTGCAGAAGGAAGAATCGTTTCTTTCTCAGGGTACATATGATTAATGAGTCGGATTCCCAACGGAGATGGAAATATCTGCTTTTTTATTATAAGGCCACGGAAATTATAACCATCCCATTGTGGCTTAGTCATTTTTCAATTCTTGTGCTAAAAAtaattgggattttttttttttttttaaattttattattattattattatttattcgaATTAATTTGTTCTAATTTGATTTAAAGCACACTGGGGTACATTTTGACCACTTCTGGACTAAAATATTAGTCTGTATCTATTCATTTGGCAAAATAGAATCCAGGCATATAGTTATGATATTGTATAATGTTCTCACTCAAGGGTTTGGACATGCCTcagatttaaactcacaaccttctgctTACTAGCAGGGCATGCCCACTGCCTATATGACAGTTTGGCTATTTTGgaaatcatttgttttaataaatgtggaTGATCTACCAAGTTAGACTGATGGCAACAGTAGTGATGTATTGGGTGTTGGATAGAGAGTTTAGTTTAGCAAATTAACTGTCTACAGTGTTTCAACGTGTGTGTAGAAACATCAGCACTACCCAGCCCTTTATtcctataccacagcactgttgaattcttgattctgattggtcataaagtgttgattaatttactcTATCAGCAATAGTGCAGtggcaaggtttatattaatgcacccaTTCTAATAGGCctacagtaacaacttacaaGGAACTTACTACACATAATAAAGTGAGGagatttctgtgaggagatgtttgtttaacatttttggaaggagtctccagtgtcagcactttgtgacagtcaaaaggaaagctgtaactttaaatttccagacagagaagctggtgaaggaattatagctactataatgtaagtgataagtggAAGTAACTTCTTTTATGGATAGTCCACAATATTTAAGTAACTGCGAATAGATACACGTtctttaaatactaaaataaaattgtaataattggcaaattgctgtggtgtaagaggaataaaataaaacacttcagaatgtgctggtataggaaagtaatccactttggggtggtaacagaaaCTGTGCTAAGATCACATCAACCCCTTGTTGATTGGTTTCCAGTGACAATCGTgtcacattttattccttactctgtaaatgttttacagatACACCACCACCATTTTCATTCCCCAATAAAGCACTGTGATAATGTGATCCAAGCAGCATCCAAGCAGCATCTTGATTCTCAGACGCTATAATCTTTGGTTTCTCAGAATAAGCATTACTGACTTGCATCAAATAATCAATATACCTGGCTTCTCTGTTTAGCATTGATTTCAGTGATAGTTGGAGGATTGGCTTTAATAATGTTTTCCCCTTTTATGTATAGTAACACAGATTATTATactatatctattttttttcgGCGGCAAATTACAATACACATTTTAGGATTACTATTACAAATACGTAGTGTTTTACTCTATAATGTAATAGAAAGTATTTCTACTTTGGCCATTTGTGAgcgaaataaataaacaaagaaataaaagaataaagacaaaaatgaagaTTTGACTTGCAATGATCAAAGTTCagattcttttttaaaagaaatcttATATCTTTAAATTTCATActtgtaaaatatgtaaaaagaaATTACTGATATGGAAACATATATTATTGATATAAAGcacattatttatatactgtTACCCCAAGTCCATTAACTATGCATAACaaattttgttgtatttttaatttcaaatgccaattttaaaatatagctATAATCAATCACATACCATTGGAAAGATTATTTcgtaaaacattttatgtaaaaatgtttagatCCTTTTCTCAGTTTTTGAAGGAGGTACATGCAGATCATTTCatacactgtatttatatatataaaattttattttattcactgttttatttttgatttgttgGTGCATATTgaacaatatatttttctcagcctttttaagttgttttcttttctttctttaataatcCATAAAAATTAAACTATATATTGCTAACAAAGTCTGACAAATGACAATATAGTAACAAGATGTTGATGACCTGtaatcacaataaaaaaaaaaaaa
>XM_026932608.2
CTTTAAGAAGACGCTCGTGTCTCTCCTCCTGTTGCACCGAGAGGCTGGCCGGTGTTTTTCCACTCATGCCGATGTCTATTGGTCACCCATTTTAAGAGACAAAGGTCGGAAAGAAAGgcttataaattaaatttccCCCGACACATCCAATTCAGCATCGCACGAGACACAAGACAAGGCATttgtaaaggaataaaaagaaaaatcagaggAGCATGGCACAAAAAGAGAAACTTCAATGTCTGAAAGACTTCCATAAGGACACTCTGAAGCCATCCCCAGGGAAAAGTCCTGGTACCCGACCTGAGGATGAGGCTGAGGGCAAACATCCTCAGCGGGAGAAGTGGGCCAGCAAGCTCGACTTTCTTCTGTCTGTGGCTGGAGGCTTTGTTGGTTTAGGAAACGTCTGGCGTTTCCCATACCTCTGCTATAAGAATGGAGGAGGTGCATTTCTCATCCCATACTTCATTTTCCTGTTTGGTGGAGGCCTACCTGTGTTTTTCCTGGAGGTGGCTCTTGGCCAGTTCACCTCTCAGGGAGGAATCACTTGTTGGGAAAAAATCTGCCCCATTTTTACTGGTATCGGCTACGCTTCCATTGTGATCGTTTCCCTACTCAACATCTACTACATTGTGATTTTGGCTTGGGGCTTGTACTACCTGTTCCAGTCCTTCCGGCCTGAGCTTCCTTGGGCCAGCTGCAATAATGAGTGGAACACGGAACACTGTATAGAGGACACACTCCGCAAGAATATGAGCTTAGGGGGGCCTTCCAATACTACGAACTTCACGTCACCAGTCACTGAGTTCTGGGAGCACAACGTCCTCAGTATTTCTGATGGCATCGATAATGTGGGCCCTGTTAAATGGGACCTGGCTCTGTGTCTCCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTTCTTCTGCATCTGGAAGGGTGTGAAGTCCACAGGAAAGGTTGTGTACATCACAGCAACCTTTCCATTTGTCATGCTGGCTGTGCTCCTGATCCGGGGTGTCACACTTCCTGGGGCAGCCGAGGGCATCAAATTCTATCTGTATCCAAATGTCACCCGTCTACAGGATCCTGAGGTTTGGATTGATGCAGGGACACAGATTTTCTTTTCCTACGCCATTTGTCTGGGAGCAATGACATCACTGGGGAGCTACAACAAGTACAAATACAACTGCTACAGGGACTGTTTGCTGCTGGGAGGCCTGAACAGCGCTACCAGTTTTGTGTCTGGCTTCGCAATATTTTCCATCCTGGGCTTCATGGCACAAGAGCAAGGGGTGGACATTGCCGATGTGGCAGAGTCAGGTCCTGGCTTGGCCTTCATTGCTTACCCTAAAGCTGTGACAATGATGCCTCTGCCTACATTTTGGGCCATTCTCTTCTTCATCATGCTTCTGCTACTAGGTCTCGACAGTCAGTTTGTTGAAGTGGAAGGACAGATCACTTCACTGGTGGATTTGTATCCATCCTTCCTACGGAAGGGTTACCGTCGAGAAATCTTCATAGCTATAATATGCTTTGTGAGCTACCTTCTGGGACTTACCATGGTCACTGAGgGTGGCATGTATGTGTTTCAACTCTTTGACTACTATGCAGCCAGTGGTGTGTGCCTTTTGTGGGTTGCATTCTTTGAATGCATTGCAGTAGCCTGGATTTATGGTGCTGATAATTTCTATGATGCAATTGAGGACATGATTGGATACAGACCAAATCCTTGGATGAAGTGGTGCTGGACTGCAATCACACCTTTGCTTTGtgtgggatgtttcattttctctttggTCAAATACAAGCCTCTGACGTACAACAAAATCTATGAGTATCCGGACTGGGCCATTGGTTTGGGATGGGCCCTCGCCCTCGCATCCATGGTTTGCATACCTATGGTAGTTGTGATCAAGATCATCCAGTCTGAAGGCCCTCTCATTGAGAGGATTAAAGCAGTGGCAGCTCCGGTGCGAGGCAGTACAAATTCATGTCCTCAGGAGTACCGACCGAAGGGCTCAGAAATGGCACATCCCCTTGACCCCAATGGGAACAACGGCTTGATCAAGCCCAGCCACACTATCGTAGAAACCATGATGTGAGCGCTCTCTGTGAGAGAATCCAATCACCTGCtttccattttatatatataaatacatatatattaaatacaatgTTGACACAGTCATAGGACCAGGTTTACATATCTGCACTAGAAgttctttcccttttctttttttttttttttttttatagaggaAGTCAcccttttttttgtcagtgtctacttttaatatttttatcataacattgttattttactgttataacTGTTGCTGTAATTAGATGAAAGATTGATTTCCATACACAAACACCAGTATCGAAATAgtcaaacatttcttttttcttttcttgttttttttcttttctgtaaataatgacgtttaaatgatttgttgttgGAGTGGACAAACAAGACCAATTAAGTGCTGCAAATGAGAAAAGTTTATAGTGTTCAAAAAGTAATATTAGTGTACCTAGACAAAAAGTGTCTTGTTGGACATTTTTTGGTAAGGCATCTGTGCATATCTAGACAGCAAGCGTAAAATTGAAACTAATTGGACATCTACACTCAAACATTACGTTCACAATGGAACAGAGACACTACGCTATTTTCTGGTGCAAGTTTAACACACTGAAACCACCACTGCACATGAGGAATGAGTTAACACATCGAAATTACTGTAAGCATCTTTGAAAGCACAAATGGTCACACTAATTCTTACCATACTGATCTAGTACAATAAGCTTTAACTTTTAACATCTCCACCATTTATTCTCAAGGgtctgtattcagagttgacaACTTAAGTCCAAGAGAGCCATCAATATTTACGATGGGAAGGTTAAGTACATCAGAAATGGGCTGCACAGGTTGATCTGCCTGCATGAAGTTCATATCTACGTGGTTGCAGGATTTTTTCAAAGCAGTAGCTTCTGAGACATGGTTTTTCAGTAGTGTCTAGACCGCCGACTTTAATCAGAAGAACTTGCATTTAAGCCTGAATTAAAACAAGGGTAGAAATTGCGCATTgaagaaatacatttaaaatgaaaaacaaaaagacgaATACCATGATATCTGAATGAGAAAAtataaagcactgaaataaatctaataggagtctagtatattggcaatatattatatataacaggATACTAGGAACAATCACTGTAAATTTTGTTTagtttaacaatatggctttcAACCTCATTATTCAGAAgcttataaaataacatttgatCCGGCAACTCCTATTATTttgtactttatatttttttatgttgtgcACATACAAATTGTGCATACAATTTAATGAAGACAGTTAAATAAAGCACAGCATGTATgactaattaaataatgtgaCTATTTTTGTTAATTCGATATGCTGTCCTATAAAAAcgttttaaaaaagtgaattttgttttttgggggtAATCATAGCCCAAAACACAAATTTCAATGTAACATCAAACTGTGTGGCAGTGGCCCtgacagtggcactggacttaatactgctgcTCACTCAAGCCGATATTGTACTTACAGTATATCCAAGGTTAAGAATCATGCGTAACCAAGACACACCACTGTTTTTGGTGAACTCCACCCCGCATGAGTAACTCTCACACCCATACTCAAATAGCATATTCGAGCATATTAATCTTGTGCATATTAGCATATTAATCTTGTGGTTATGTCTGTGTTCTGGACACCAGGATGCACAATTTTGGCATTAAATCCTCACTAAGCGTgtgtaactcaactctgaatacagcccaggTACAGCATATTTTTGCGTGGTTCTTAAATTGATGTAATTAAGCGCTCAAACAAATTCATTTCTACCCACATTTCAACACTCCCTAAATATCCCACAGTCAATTGTTTTTAACCAGCTTCATAAGAATGGATCAGGGCCTAGACacatactgatactggtatGTTCGAATTTGAAATTGCTCTTGTCCAAGCATTTGTGTCACACCAATACAAAGGTAGTATTTTATGGTCCAAGCTGTTTgtacatgtcattcttttattttcctttgcCTTTTGTATTCTTAATATTAAGATTGTACTTAGCTTCTGTcagcaattattatttttttataggaCAAAATTTTATATAGAGCTTTTAATCAGTGCAATTGGTGGCAATTGTATCGTGCAATACTTTGTAGAATGAAATGCATTGTTCCTGTCTTTTAAAAAGATGCTACTTGCAGTGAAATATCTTTATAACAAAATATCAGGCACAATTAATCATTGCAAGGTAACAccgaactaaaaaaaaaaattgtacttaCTGTGATACTTTtcatattttagtattttaaaaagaaattatattatttttctattggTTTATCTGTTAGATAACATACATTAAtcttaatgattaatgatttttaatagcCCAGTTTGGACTGATATATcatataattaacattaattactgCTTCTGAAAGCAGAACTGTGTTCAAACTAAACTATTTGCTTGCAAGCAAGCTGTAACTAGGTTTGAAAAGCTCTAGAATATTCCGTTTAGTCTCAGGTCTGATCCTAATGCAGAAACAGACTTGAGAGGTTTCTCTAAATCTTTTACACCTACATGGTTTGGCAAAGTGTCGGTGTTATTAattcatgaaaacatttttaaaaattctttttttaaattcttgatTAAAACATGGAAgcgaaaatgtatttaaaagttTTTGGAGTAcctaaaaactttttttttatttcttaataaacatttatttttgaaaaaaagaaaagaaaaagcctcCTGCTTTTGCTGAATATTGCCAGAACTAATTTCTTTCCAAAATTTGAGGTGAaatcaaatcattaaaattgtttGAATATAACTCAATCATACCTTTGGGTTCATGAAGGCTTTGGACTGACgcactaccacacacacactctttaattTAAGGTGACCCAACAACAATGCTGTTGCCAAGCCAGGGTATTTTAACACATGCCTGGCTTCCTAAAATATGGCTTGTGAGGACACAACCAGAAGTGCCATGTTAGGTAATGGAAACTTGGTCCCAGATAAAACTGAACATTGTATAAATGTGCATCTTCATTATGTTCACTGCGTTACTGTTTCAGGGGTCACTGAGAGTTGCACTGATCCTTTTCCCCAGCTGCTGCTGTAGTAGTGATCTTATTTGAAACAGACTGATAGCACCCAAGGGATGAGAAATCTGGAGAGTTTGCAAAATATCACAAAACTTCCCAAGCTTAACTTGCAGAAGGAAGAATCGTTTCTTTCTCAGGGTACATATGATTAATGAGTCGGATTCCCAACGGAGATGGAAATATCTGCTTTTTTATTATAAGGCCACGGAAATTATAACCATCCCATTGTGGCTTAGTCATTTTTCAATTCTTGTGCTAAAAAtaattgggattttttttttttttttaaattttattattattattattatttattcgaATTAATTTGTTCTAATTTGATTTAAAGCACACTGGGGTACATTTTGACCACTTCTGGACTAAAATATTAGTCTGTATCTATTCATTTGGCAAAATAGAATCCAGGCATATAGTTATGATATTGTATAATGTTCTCACTCAAGGGTTTGGACATGCCTcagatttaaactcacaaccttctgctTACTAGCAGGGCATGCCCACTGCCTATATGACAGTTTGGCTATTTTGgaaatcatttgttttaataaatgtggaTGATCTACCAAGTTAGACTGATGGCAACAGTAGTGATGTATTGGGTGTTGGATAGAGAGTTTAGTTTAGCAAATTAACTGTCTACAGTGTTTCAACGTGTGTGTAGAAACATCAGCACTACCCAGCCCTTTATtcctataccacagcactgttgaattcttgattctgattggtcataaagtgttgattaatttactcTATCAGCAATAGTGCAGtggcaaggtttatattaatgcacccaTTCTAATAGGCctacagtaacaacttacaaGGAACTTACTACACATAATAAAGTGAGGagatttctgtgaggagatgtttgtttaacatttttggaaggagtctccagtgtcagcactttgtgacagtcaaaaggaaagctgtaactttaaatttccagacagagaagctggtgaaggaattatagctactataatgtaagtgataagtggAAGTAACTTCTTTTATGGATAGTCCACAATATTTAAGTAACTGCGAATAGATACACGTtctttaaatactaaaataaaattgtaataattggcaaattgctgtggtgtaagaggaataaaataaaacacttcagaatgtgctggtataggaaagtaatccactttggggtggtaacagaaaCTGTGCTAAGATCACATCAACCCCTTGTTGATTGGTTTCCAGTGACAATCGTgtcacattttattccttactctgtaaatgttttacagatACACCACCACCATTTTCATTCCCCAATAAAGCACTGTGATAATGTGATCCAAGCAGCATCCAAGCAGCATCTTGATTCTCAGACGCTATAATCTTTGGTTTCTCAGAATAAGCATTACTGACTTGCATCAAATAATCAATATACCTGGCTTCTCTGTTTAGCATTGATTTCAGTGATAGTTGGAGGATTGGCTTTAATAATGTTTTCCCCTTTTATGTATAGTAACACAGATTATTATactatatctattttttttcgGCGGCAAATTACAATACACATTTTAGGATTACTATTACAAATACGTAGTGTTTTACTCTATAATGTAATAGAAAGTATTTCTACTTTGGCCATTTGTGAgcgaaataaataaacaaagaaataaaagaataaagacaaaaatgaagaTTTGACTTGCAATGATCAAAGTTCagattcttttttaaaagaaatcttATATCTTTAAATTTCATActtgtaaaatatgtaaaaagaaATTACTGATATGGAAACATATATTATTGATATAAAGcacattatttatatactgtTACCCCAAGTCCATTAACTATGCATAACaaattttgttgtatttttaatttcaaatgccaattttaaaatatagctATAATCAATCACATACCATTGGAAAGATTATTTcgtaaaacattttatgtaaaaatgtttagatCCTTTTCTCAGTTTTTGAAGGAGGTACATGCAGATCATTTCatacactgtatttatatatataaaattttattttattcactgttttatttttgatttgttgGTGCATATTgaacaatatatttttctcagcctttttaagttgttttcttttctttctttaataatcCATAAAAATTAAACTATATATTGCTAACAAAGTCTGACAAATGACAATATAGTAACAAGATGTTGATGACCTGtaatcacaataaaaaaaaaaaaa

Function

symbol description
slc6a6b Enables taurine:sodium symporter activity. Acts upstream of or within taurine transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in several structures, including blastomere; cardiovascular system; nervous system; optic vesicle; and presumptive neural retina. Orthologous to human SLC6A6 (solute carrier family 6 member 6).
slc6a6 Enables alanine transmembrane transporter activity and taurine transmembrane transporter activity. Involved in alanine transport; amino acid import across plasma membrane; and taurine transport. Located in plasma membrane. Part of apical plasma membrane; basolateral plasma membrane; and microvillus membrane. Biomarker of multiple system atrophy.

NR:

description
PREDICTED: sodium- and chloride-dependent taurine transporter-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0015849 organic acid transport biological_process
GO:0015734 taurine transport biological_process
GO:0006836 neurotransmitter transport biological_process
GO:0035725 sodium ion transmembrane transport biological_process
GO:0005887 integral component of plasma membrane cellular_component
GO:0005328 neurotransmitter molecular_function
GO:0005369 taurine molecular_function

KEGG:

id description
K05039 SLC6A6, TAUT; solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, taurine) member 6

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026932607.2 False 7368 mRNA 0.37 14 14769594 14789849
XM_026932608.2 True 7467 mRNA 0.37 14 14765186 14789849

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC113537808 lsm3,LOC107676354,LOC107562728,LOC100705055 coding upstream 84325 14674490 ~ 14680861 (+)
podxl2 podxl2 coding upstream 103445 14630530 ~ 14661741 (+)
mcm2 mcm2,LOC107718478 coding upstream 136579 14616988 ~ 14628607 (+)
ccdc51 ccdc51 coding upstream 149292 14613763 ~ 14615894 (+)
LOC113538112 LOC108255148 coding upstream 155022 14599257 ~ 14610164 (+)
cand2 cand2,LOC107557972,LOC107691187,LOC107719941,LOC107720354,LOC107657311 coding downstream 223016 15012865 ~ 15023674 (+)
LOC113538136 LOC108255245 coding downstream 239285 15029134 ~ 15040134 (+)
ssuh2.1 LOC108255262,LOC108436692 coding downstream 255695 15045544 ~ 15062000 (+)
si:dkey-49n23.1 si:dkey-49n23.1,LOC108255172,LOC108436691,LOC107719940,LOC107571036 coding downstream 275028 15064877 ~ 15126398 (+)
dock3 dock3 coding downstream 348502 15138351 ~ 15368130 (+)
LOC113537908 NA non-coding upstream 2012 14760831 ~ 14763174 (+)
G307976 NA non-coding upstream 166574 14598393 ~ 14598612 (+)
LOC117599878 NA non-coding upstream 174365 14583567 ~ 14590821 (+)
G307971 NA non-coding upstream 175954 14589025 ~ 14589232 (+)
G307588 NA non-coding upstream 616741 14148141 ~ 14148445 (+)
G308018 NA non-coding downstream 9124 14798973 ~ 14800142 (+)
LOC113537967 NA non-coding downstream 603760 15393609 ~ 15407641 (+)
G308404 NA non-coding downstream 622250 15412099 ~ 15413822 (+)
G308707 NA non-coding downstream 1084156 15874005 ~ 15875206 (+)
G308737 LOC105913228,LOC107592839,LOC107701594,LOC108431596,LOC107691887,LOC100331190 non-coding downstream 1203546 15993395 ~ 15994043 (+)
gpd1b gpd1,gpd1b,LOC107698578,LOC107727040,LOC107721242,LOC107694423 other upstream 240210 14514592 ~ 14524976 (+)
asic1b asic1,asic1b,LOC107721241,LOC107569540 other upstream 288369 14179783 ~ 14476817 (+)
ippk ippk,LOC107755999,LOC106566243 other upstream 1072274 13674354 ~ 13692912 (+)
G306480 tuba1c,LOC103148207,LOC106920718,LOC102311436,LOC101065103 other upstream 2302650 12457601 ~ 12462536 (+)
G306103 NA other upstream 3249373 11515059 ~ 11515813 (+)
dag1 dag1,LOC107757307,LOC107592827,LOC108415278,LOC108415277 other downstream 967041 15756890 ~ 15799890 (+)
amigo3 amigo3 other downstream 1699512 16489361 ~ 16501684 (+)
LOC113537865 LOC108280979 other downstream 2471130 17260979 ~ 17263663 (+)
snrpe snrpe other downstream 3897548 18687397 ~ 18692014 (+)
G310681 LOC108254836 other downstream 4297176 19087025 ~ 19087806 (+)

Expression


Co-expression Network