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species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

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symbol description
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TU378999 False 1034 lncRNA 0.36 2 14080249 14127006
XM_026925244.2 False 5473 mRNA 0.37 5 14114777 14127012
XM_026925245.2 True 5473 mRNA 0.37 5 14114774 14127012
XM_026925246.2 False 5447 mRNA 0.37 5 14114802 14127012

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rnf126 rnf126,LOC107569633,LOC107754583,LOC107596227,LOC107750906,LOC105909243 coding upstream 64878 14006357 ~ 14015371 (+)
twsg1a twsg1,tws1a,LOC106579643 coding upstream 76549 13988603 ~ 14003700 (+)
ankrd12 ankrd12,LOC108280287 coding upstream 95193 13949726 ~ 13985056 (+)
ndufv2 ndufv2,LOC107596229,LOC107754586,LOC107696125 coding upstream 132457 13932646 ~ 13947792 (+)
rab12 rab12,LOC107696134,LOC107750912 coding upstream 245434 13820665 ~ 13834815 (+)
sirt6 sirt6,LOC107667852 coding downstream 217582 14344594 ~ 14372193 (+)
ralbp1 ralbp1,LOC107696059,LOC107667860 coding downstream 311351 14438363 ~ 14450439 (+)
LOC113533212 LOC108280212,LOC108427118,LOC568754,LOC107558277,LOC107667866,LOC107729992,LOC107600185,LOC107750900,LOC107696035 coding downstream 354664 14481676 ~ 14487383 (+)
gna11b gna11b,LOC103033252,LOC108280682,LOC108427217,LOC105889474,LOC107600186,LOC107667855,LOC107696027,LOC107558284 coding downstream 423297 14550309 ~ 14594321 (+)
chico chico,aes,LOC108280588,LOC108427216,LOC107558286,LOC107667856,LOC106574496 coding downstream 475757 14602769 ~ 14628849 (+)
G320004 NA non-coding upstream 61213 14018829 ~ 14019036 (+)
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LOC117595740 NA non-coding upstream 169969 13904527 ~ 13910280 (+)
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G320032 NA non-coding downstream 10650 14137662 ~ 14140523 (+)
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G320057 NA non-coding downstream 61728 14188740 ~ 14189014 (+)
G320070 NA non-coding downstream 79843 14206855 ~ 14207067 (+)
G320095 NA non-coding downstream 113970 14240982 ~ 14241203 (+)
LOC113533270 mtcl1 other upstream 182335 13837433 ~ 13897914 (+)
sema6ba si:ch211-168n16.1,LOC108280795,LOC108433102,LOC107713651,LOC107600229,LOC107757803,LOC107662975,LOC107698499,LOC105903857 other upstream 925722 13021142 ~ 13154527 (+)
G319170 NA other upstream 1277230 12765055 ~ 12803019 (+)
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per2 LOC108280459,LOC108439864 other upstream 2615480 11399884 ~ 11464769 (+)
rab31 rab31 other downstream 259226 14386238 ~ 14466753 (+)
tle2c zgc:136336,LOC108280589,LOC108427215 other downstream 510769 14637781 ~ 14666508 (+)
ly97.3 LOC108280687 other downstream 700230 14827242 ~ 14828778 (+)
LOC113533366 NA other downstream 936709 15063721 ~ 15066371 (+)
LOC113533365 LOC108280254 other downstream 955226 15082238 ~ 15101461 (+)

Expression


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