clcn2a (clcn2a,clcn2,LOC108280323,LOC107710554,LOC107732945)


Basic Information

Item Value
gene id clcn2a
gene name clcn2a,clcn2,LOC108280323,LOC107710554,LOC107732945
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047615.1
NCBI id CM018561.1
chromosome length 21248730
location 20129253 ~ 20281067 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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>TU383073
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Function

symbol description
clcn2a Enables chloride channel activity. Predicted to be involved in chloride transport. Predicted to act upstream of or within transmembrane transport. Located in cell junction. Is expressed in several structures, including eye; gill; heart; liver; and pleuroperitoneal region. Human ortholog(s) of this gene implicated in idiopathic generalized epilepsy 11 and primary hyperaldosteronism. Orthologous to human CLCN2 (chloride voltage-gated channel 2).
clcn2 Enables voltage-gated chloride channel activity. Involved in regulation of aldosterone biosynthetic process. Located in plasma membrane. Implicated in idiopathic generalized epilepsy 11 and primary hyperaldosteronism.

NR:

description
PREDICTED: chloride channel protein 2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU383073 False 3390 lncRNA 0.40 4 20129253 20243398
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XM_034314812.1 False 8517 mRNA 0.44 22 20256343 20281067

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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gng12a gbg12,gng12a,gng12,LOC107705318,LOC107700509,LOC105895117 other upstream 909024 19204658 ~ 19220229 (+)
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G323534 NA other downstream 157635 20438702 ~ 20440561 (+)
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G323615 NA other downstream 740122 21021189 ~ 21157280 (+)

Expression


Co-expression Network