eya1 (eya1,LOC107657823)


Basic Information

Item Value
gene id eya1
gene name eya1,LOC107657823
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047616.1
NCBI id CM018562.1
chromosome length 21037487
location 14796644 ~ 14848084 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
eya1 Predicted to enable protein tyrosine phosphatase activity. Acts upstream of or within adenohypophysis development; otic vesicle morphogenesis; and otolith development. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in several structures, including adenohypophyseal placode; brain; ectoderm; head; and lateral line system. Human ortholog(s) of this gene implicated in branchiootorenal syndrome and branchiootorenal syndrome 1. Orthologous to human EYA1 (EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1).

NR:

description
PREDICTED: eyes absent homolog 1 isoform X1

GO:

id name namespace
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GO:0021984 adenohypophysis development biological_process
GO:0004725 protein tyrosine phosphatase activity molecular_function

KEGG:

id description
K15616 EYA1; eyes absent homolog 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network