LOC113532648 (ptprh,LOC108256157)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113532648
gene name ptprh,LOC108256157
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047616.1
NCBI id CM018562.1
chromosome length 21037487
location 8768745 ~ 8821311 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

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GCAAAGGTTGAAGTGCGTGGATATTCCCAGCAGCATTAAAAAGAGAAGTGCCATTAAAACAATATATGATAATTCATTGAGTCAGGGGAGAGAAAGGGTGTGTGTCTACAAAAAGAAACGAAAGACAAAGGTGATTTTTAGACTGTAGTGTGTCAGCAGAGAGCCCCATTAAGCTTTCGGCACTGCTTGAGCTGGTTTCATCATGAGAGGAATTGTGGTGTTGCTGTCTCTGTGTCACTTTGTGGCTCTTGTGTGGGGAACCTCAACTTCAATGCCTATACCGGTTTCAACATCTATTGCTACCACTAAAACCACAGGACTACCCACCCCACCATCTCTTACTAATGTTGACACGGTCTCTGTAACAAATCGCACTGAGACGACACTAACATTGGAATGGAATAAagtaaacaacaacagcaattacatttacacactaagCTACAATAGCCAGAATAAAAGTATCAATGGATCAATGGAAAGTCCTGTAGTGACATACAGAGTCATAAATCTTACTGCTGGGACTGAATACAACTTCATTCTCTACACTGTATTTGGAGAAGCTCTGAGCACTGGATACAACTTTACCGAAGTCACTACTCCCCAAAGTGTTACCAACATTACTGTAAAGAATCGCAATGAGACTGCATTAATACTGGAATGGAATAAagtaaacaacaacagcaattaCAGTTACACACTGAGCTACAACAGTCAGAACACCAGCATCAATGGATCGGAAGAAGGTTCTGCAGTGACATACACAGTCTTAGATCTAACTGCTGGGACTGAATACGTCTTCATTCTCTACACTGTATTTAAAGGACTTCAGAGCATGGGCCACAGTTTTACCACTGTCACTACTCCCCAAAGTGTTACCAACATTACTGTAAAGAATCGCAATGAGACTGCATTAATACTGGAATGGAAtaaagtaaacaacaacaacaattacagTTACACACTGAGCTACAACAGTCAGAACACCAGCATCAATGGATCGGAAGAAGGTTCTGCAGTGACATACACAGTCTTAGATCTAACTGCTGGGACTGAATACATCTTCATTCTCTACACTGTATTTAAAGGACTTCAGAGCATGGGCCACAGTTTTACCACTGTCACTACTCCCCAAAGTGTTACCAACATTACTGTAAAGAATCGCAATGAGACTGCATTAATATTAGAATGGaataaagcaaacaacaacaacaattacagTTACACACTGAGCTACAACAGTCAGAGCACCAGCATCAATGGATCGGAAGAAGGTTCTGCAGTGACATACACAGTCTTAGATCTAACTGCTGGGACTGAATACGTCTTCATTCTCCACACTGTATTTAAAGGACTTCAGAGCATGGGCCACAGTTTTACCACTGTCACGACTCCCCAAAGTGTTACCAACATTACTGTAAAGAATCGCAATGAGACTGCATTAATACTGGAATGGAAtaaagtaaacaacaacaacaattacagTTACACACTGAGCTACAACAGTCAGAACACCAGCATCAATGGATCAGAAGAAGGTGTTGCAGTGACCTACACAGTCCCTGATCTTACTGCTGGGACTGAATACACCTTTACTCTCTACACTGTATTTAAGGGAGTGGAAAGCAGAGCCTACCACATTACAAGTGTCACTGTTCCAAATAGTGTCACTGGGTTACACTGTCAGTATTCATCAGGGGGCTATGGTCTAACTCTTGTTTGGGATCCTCCAAATGGCGGGAGGACATTTGTACAGGTCAACATGAGCAGCAAAAGCTTTAGTCACATAGGGGAAAGACTGTATATCGATGGACTACTGCCTGCCCAGTGGTACACCCTTACTGTGTCCGCACTCTTTGGGCCTATGCAGAGTGTCCCAGTTTCAATCACCTGTCAGACTGACCCAAGAGGAGTCATAGCAGGTGTTCTAACATCCCTCCTGCTGGCCATTCTGATCCTCTGTATTGGTATCTATATATGGCATCACAAGCCAGAGCTATACAGCAGGTTTAAATCCTCTAATGAGACCGAACTGTCCAGTAATAAGTACAAaccAATTCACCTGAAGAAGTTTCCAATGCACTTTAGCTCCATGAGTTGTGATCAGAACCGTGGTTTCAGTGAGGAATATGAGGATTTAAGTACAGTGGGTACAGATCAGAGTTGTACAGTTGCTACACTTCCTGAAAACAAGAGCAAGAACCGATTTACCAATGTACTGCCCTATGATATATCTCGTGTGAAGCTTGCTGCACAGACTGGCTCTGATTTGGACTACATCAATGCTAACTACATTCATGGTTATGGCAAGAAAAACAAGCAGTACATTGCTGCTCAGGGTCCTCTCCCCTCCACTGTCAGTGACTTCTGGAGAATGGTGTGGGAGCAGAAGTCCTCAGCCATTGTCATGCTGACCAACTGTACTGAGGGAGGAAGGaTTAAATGTGAGCATTATTGGCCAGTGGACGACATGCCCTGCCTCTATGGAAACCTGCGGGTCTCTGTCCAGTCAGAGCAGAAAGAGAGTTGCTGGACTCGACGAGAATTTGTTGTCAGAAATCATGGCCTGATCATGGAGTTCCTAAAGGAACAGAAGAGTTGATTCAGTTCCGTTGGATTGTTCGTCAGCACATCGAGACCTTCCCATTTAGTGGACCTACCGTGGTACATTGCAGTGCTGGAGTGGGTAGGACAGGTACTCTAATTGCCCTTGATTTGTTACTGCAGCAGATGGACAAAGAGGAAGTGGTCAGCATTGCTGACTGTGTACGTTGCATGAGGCTTTCCCGGCCTCTCATGGTACAGACTCAG

Function

symbol description
ptprh Predicted to enable protein tyrosine phosphatase activity. Predicted to be involved in protein dephosphorylation. Predicted to act upstream of or within dephosphorylation. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human PTPRH (protein tyrosine phosphatase receptor type H).

GO: NA

KEGG:

id description
K18034 PTPRH, SAP1; receptor-type tyrosine-protein phosphatase H

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XR_004576949.1 False 2811 misc_RNA 0.44 17 8768745 8815560

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G329111 LOC108426559,LOC103029568,LOC107664665,LOC108256430,LOC107550021,LOC107755710,LOC107742253,LOC107655802 other upstream 102909 8615073 ~ 8665836 (+)
LOC113532774 vps13b other upstream 218507 8388187 ~ 8550238 (+)
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Expression


Co-expression Network