G347896 (LOC108255572,LOC108255614,LOC108255576,LOC108255575,LOC108255573)



Basic Information


Item Value
gene id G347896
gene name LOC108255572,LOC108255614,LOC108255576,LOC108255575,LOC108255573
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047618.1
NCBI id CM018564.1
chromosome length 20251756
location 919384 ~ 1701550 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


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>TU412245
gcaaaatattcatCAAATCCCCTTTCAAGAATTAGAAAGTGTAAATCTGTTCTCTGAAAACTTCACATCtgcctccttcctcctctcaccagagttcttcttcttccagaCCACAATtccagcaacaacagcaacgaGAGCAACGAGAGCCGCGACTACAGCAACGATGATAGCAACCGGTGCTCCATCTGATCCTCCATCTGATCCTCCACCTGTTAAATCAGCACAGAGTCTTTATTATCTGCTGCAGCAATAAATCAGCTTTCACTGTAAATCTGTAGTTTTAGAGGAAAGTGTTTCTCCGACCTCTCACAGGCAGCACTAACTCCTTCTCCAAGCTGCTGTGCTGAATCACGCAGGTGTAGGTGTGTTTCTGCAGCTCCTCAGCTGGAACTGTCAGAATGCTTCTCTTCTGGAAGCTTCCATCCTGGTTGGGTAACGTCTCTCTGAGCTCCACGTTCTCATACACGTCCTCTCCGTCCTTCTGCCAGGAGATCACCACTGCTTTGGGGAAGAAACCTGTAGCATGACACACCACCTCTCCAGAAACACTCTCCTTCTGCAGAGGTGGTGTGTCATGCTACAGGTTTCTTCCCCAAAGCAGTGGTGATCTCCTGGCAGAAGGACGGAGAGGAGCTGCAGGAGGACGTGGAGCTCAGAGAGACGTTACCCAACCAGGATGGAAGCTTCCAGAAGAGAAGCATTCTGACAGTTCCAGCTGAGGAGCTGCAGAAACACACCTACACCTGCGTGATTCAGCACAGCAGCTTGGAGAAGGAGTTAGTGCTGCCTGTGAGAGGTGGAGCACCGGTTGCTATCATCGTTGGTGTAGTCGCGGCTCTCGTTGCTCTCGTTGCCGTTGTTGCTGGAATTGTGGtctggaagaagaagaactctgGCTTTAAACCTGTTCCAGCCAAAGCCGCCTCTGAAGGAGATTCTTCCTCCAACAACTCTTAAAGtgtgactgtgtgtcttcctgctgaactgagagagagagaggaggagaggaagatgaggaacacacacacacacacacatgcatgcacacacatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacattattccaGTGGGTAATCTTGGTGTATgattttcttggtgtttggatGGAGGAGCTTTTTATTGTGAATctgttgttattgctgtaaaATGGGATTATTAGGGATTGTTAGGGTTTTAATTTTTTGCTCTGTGTAAATTCTCGTAGTTTTCTGTGTGATTgggtttgatgtgtgtgtgtgtgtgtttgtcgcTGTGCTGTTCTGTGCCACTGAGCTCAGCGCTGTAGGATCCTGCTTTTGGGGGAAACCAGGTTTTGGAGTAAAGATGGTCAGTGATGGCGTCATAGCGAGTCACTTTCCATTCTTCCTCTGGGATCTCCGTTAAGCTCACagcaatgaaacacacacaagcagattTAAACCTGTTCTGTGCAACACGTCTGGATGTGAACACAGCTTTACACTCGccttattttatattcagtacaacctcacacacacttcctgatacacacacacacacacagtgattctGAGCTTCTTTACTCATGATTTACAACATGATTTACTGTAGAATTGAATTCAGATCATAACGTTAGTACATGAGAGGTTTGATTTACATCTTTTAGCTTTTAATCCAGTGAGATTTTCCTCAGTAGCTGTTTGTGGAGCTGATTTGTGCTTCGTATCAGACAGAAACTGGGGCTTCAGATGTGATTGGTGTTGAACAGATTGGACTAAAGTGGAAAAGAACAGGAGTGAACACAGCAGAAGCAGGAGCTCATGCTGGATGATCAGCactcagagaaaacacaaatcaaCTAAATGACACGGCACTGAttccattatttaattatttaactcgatttaaagcaaataacaaTCCATTAAACACGTTTTCACATCTGTATGACCCAAATCTCCCACAATGCATCTGTTCTGTCAGTGTAACAatctgaatgaataataaagtgtattttcttcattctgtgctctgagttttattttataactgtgTTCTTTTAAAGCACATGATCTCAGGATCACTTGTACACTTACTGTCAtgtgcttcacacacacacacacacacacacacacacacatctctcttgAGTTTAACATGACAATGAGAGGTAGATTTCATCTCAGAACAGTCTTGAGAGACATTTTCCAATTTaagcagtttattattttaatcttaattCAAAGCACATTTGAGTTTTCTGCTTTCAGCACTGACCAAAAATGTTCACAATCTGGAGTTTTAGAATGTCTAGAATTTACAGTttcaaatgtgtaaaatatggaAACATGAGCCAGATGAATTTTGCCCCTCAGGCTGATCTTTAAGgcactgtatgtttttattagtCTCAGGACAATCAGTAATTATACCACATcatacactgtgtgtttccaGATCTTTcaccacaccaacacacactcaacactgacATGTCAGAGTTATTAGCTATAATAGCTATTAGCTATTAGCAactgtcttcacttcctgcttgttcATGGGATGTCTTGCCTTCAGGTTTCCTTCAGCAGCTGAAATGCATTTTGGAAATAAATCactgtccatctgcactgtcaAGCTCCATCCAGTCCTTTTGAAGCAtctggctgaatgtgagcagataaAATAGACAGCAGATGAAACTTCAGATTTCGTCCTGCTGCTTTTATAAGCAGTCCTTTCATCAGTACATACAAAGGACCCTGTTCCACTGGCAGACGTACACACCCAGGCCATAACATGAGGTTTTctgcttcagatcatgagcagttccttcccttctccacaCTCTTCTCCTCCCATCATTCTGCATCAGTCtgtgacatgaaaatgaataaggaatatttctgaaatgtctGTAAAAAGCCTCTAAAGCAGTGCAACAGGCATGTGGGACAAATTATTAATCAGTGATCTCATTCAGATGTGTGCTGCAGTTGCTCGGTGAGTTTCATTTTACTTTCAG

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


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TU412225 True 4249 lncRNA 0.40 9 925489 1467707
TU412226 False 1364 TUCP 0.47 7 1157791 1410675
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TU412231 False 311 lncRNA 0.38 2 1056423 1073701
TU412236 False 1882 lncRNA 0.40 3 925489 1389316
TU412240 False 1844 lncRNA 0.40 5 925489 1359907
TU412244 False 698 lncRNA 0.41 2 1447814 1467707
TU412245 False 3024 lncRNA 0.43 8 925489 1466231

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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Expression



Co-expression Network