LOC113537388 (arhgap6)


Basic Information

Item Value
gene id LOC113537388
gene name arhgap6
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047620.1
NCBI id CM018566.1
chromosome length 19313417
location 7357271 ~ 7478509 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU440604
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>TU440605
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>XM_026931841.2
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>XM_026931842.2
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Function

symbol description
arhgap6 Enables phospholipase activator activity and phospholipase binding activity. Involved in activation of phospholipase C activity; negative regulation of focal adhesion assembly; and negative regulation of stress fiber assembly. Located in cytosol.

GO: NA

KEGG:

id description
K20631 ARHGAP6; Rho GTPase-activating protein 6

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU440604 False 1934 lncRNA 0.33 2 7357311 7378538
TU440605 False 351 lncRNA 0.59 1 7477880 7478230
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XM_026931842.2 False 6328 mRNA 0.43 13 7357271 7421800

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mid1 mid1,LOC103030906,LOC106575281,LOC106574413 coding downstream 54707 7253751 ~ 7302564 (-)
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LOC113537489 NA other upstream 782926 8261435 ~ 8267272 (-)
timmdc1 timmdc1 other upstream 842359 8320868 ~ 8329026 (-)

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