rnf11a (rnf11a,crgm2,LOC108259033,LOC107757048,LOC108441179,LOC103044796,LOC107694828,LOC107583209,LOC108258879,LOC108260578,LOC108260581,LOC108260584,LOC108260582,LOC108280851,LOC108260580,LOC108260664,LOC108260583)


Basic Information

Item Value
gene id rnf11a
gene name rnf11a,crgm2,LOC108259033,LOC107757048,LOC108441179,LOC103044796,LOC107694828,LOC107583209,LOC108258879,LOC108260578,LOC108260581,LOC108260584,LOC108260582,LOC108280851,LOC108260580,LOC108260664,LOC108260583
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047620.1
NCBI id CM018566.1
chromosome length 19313417
location 14106206 ~ 14180614 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU445072
GAAAAAAGTCAtgtatagatttaaaaaaaaaaacaagttattcATCTTACCATGGGGATCATGCGGCAGGATCTGATGCAGTTGTTGCCCCAGCCCCACATGTTCATGTAGTCAGCGTACTCGCCTCTTCTCATGAAGTACTGGTTGCCCATGTAGTTGGGATGATCGTACACCATCCAGCAGCCGCTCTCCACCCTGCACGAGTGGCAGCGGCTCAGGTAGGTGGACATATCAGAGCAATCACCGCTGCACTCATAGGAGCGGCCCTGGAAGTTCCTGTCCTCATAGAAGATAACCTGTAGGGCAAATTAGAGAAAGGAAGCTCAAACTTAACATGAAGGACACCATAATGATATTGCTttgttgagctttttttttttttttttaaaatctttatatttatagaaaCCAGTTTGCTTACTCTGCCCATGGTGATGATGCGAGTGTCTGCGTGTCCCAGCACTTGCCTGGTGGTGAACTGACATTGAGCATCGGTTTAACCTCTGCCATTTATACCTGACCAAACTCAAAGAGCGCATACCTCCTATTGTAAAAAGTCCTGACCAAGCAAAAGCACAGAGGCCACCAGAGTGTTTTTGCTACATGTCACATTTCCAGTCTCCAGAAGACTTTAGAACGAGCCCCACAAGCAAGACAAAACTGCTgagctttttttcttccttttttttaccCAATGTGTTCTTTTGGCCCATACAATCTCTGGGTATTATAAGTTTCCTACACAGAAACCCAGCTATGGAAAACATATTTCTGTTGGGTAGACCCTTCTGCCAtttgaacaacaacaaaaaaaacatattacatCGTGCTAACAAGATTTAACAGGTGATTGTCAGAGGTGTTAAACAATAAGCATGGCTTGCTAAGCTCACATCTAATGTACCTAGCTAGCATTATGAGCGTCAAGTGGCTGCAGCACTGTAATCATCTGTCAGTAACTCCAGTTGgcatttttaatacttatttTTGTGTCGGCGTTCtgcataggttttttttttttttttctgcatggaaGCATCATCAGAAATGCACGGCCTTGATCGTGCAGAGCTCAGCGGGAAAAGTGGTCACAGCCCATGTGTGTTTGAGGAAAAGACTGACCTATAGCAGCCGTAAAaatggtcattaaaaaaaatgcattttacatttattaaaaaaaacaacatttttattcctAATTAAAATAGAATTATATATGAGTTAGATTGGGGAAAGAAAtactaattttttaattttattgaatattgaaGTTATACTTGTTCTATGTTTTTACTGTTGGTGGTATGTAAGACCCATACCTCgcttaattaataataataatccctaGAGAGCTGTGGCTCATGACCaatataaaaatgcaacaataatgaatgaatgaatgaatgaattaattaattaattaatatttattccttcattatatattatttatgatcAGTATCTCACTGGACAGGGTTTTTGCTGATGTAGGTGATGAAAACTGCAATTaactaatattttattagatatgtgatatatgatatggtaggttctctctctctctctctttctctctctctttctctctctctatctctctctctttctctctgtttgtgtttcttgaTGAAAGGGCTGACACGTGCCATGGGTCAAAGGATAAGAAAGCTCTGTGTGTGGGGGGAGCAGCACGAGGTCAGGCTTCTCCCTCAAGCTTAACCGCAGCGTGCCAAAGGTCAAAGGTTACAAAAACTGTGAGGCatggcagctgtgtgtgtttgtgtgtgagtgagtggtaCAGAGCCTGTCTTTTCTTACTGCTTCACGCAAGCGCAATATAGATGTTTGTCTCACACCTTCCATCCGTCATGCtcatcacacatatacacacacacacacacacacagctcacagctGTTGTCTCTGGTTCAAGTTTAATAGGGGGATCACACAAATAGTCAAGTCAGGTCAGCACGGACATTTACACActccgctctgtgtgtgtagctgctcACTGGTGGTCACACATTGTTATACCGAACCTGTTCTCCATCTAGTCTTCTACTCCTGATTTTTCTCACGAGTCTGTGTGTATCGTTGCAtttcatgtgacatcacactgtataatggcagccattttgtggaGCGAATATGGGACTGACTGCATCATTAagaagtgtttatatttatttatactgataCTCGACTGCACTAATAGACATTACATCCTCAACAAGCAACTTGTCACACTGCCTTGTAgctgtgctagctagctagctacaactGGGGTGTTTATTTCAGCAGCTTATATTGCTAACATCAGCAAAAATGAGTTAGTTAGCTGATATCTATTAGCTTATAAGGACAAAAAAATTCTCTTCGTGATGAAACACCCCAGGAACCTTCTTtacttcttttaatgctgtattTGACTAAAAGATGTTACTCATAATTTCTGagctctgactaggaaaaagtttatctcacagcatcagcagtaaacaaagatAAAACTAAGATCAATCATAATACAGACATACTctcttgttaaatctataactcTtttgaggaggtaaatattcatcactcatcacagctAGCTGGCCCGTAAGAAAGTGAAATgacgaacatggaggcgtccaattttttccccatgttgTAGCTCAATCAGTCAGAATTGAAGTTCCAACTTCCCAATTCTGAGGTAAGCCGAATGCAAAAAAAGGATAAGAAAGGCTACCATAACtcacataaccactctttacagtggtgaaaagcatctcagaatgcacaaaatgtcaaaatttgaggctacaacagcagaagtccacattaagttccactcctgtcagccaggaacaggaatctgaggctacagtgggcgcCGAAACTGGAGCGCTTCAGGTTGGAAAAGCAAAGTGGTGAGAGATATACTGATATAAGCGAGATGCTACTAGAAATTTATtgcaaaaaaagacaacagaACCGACTCTCAGACCCTGTCATGATAAAGAAGTTACAAAAATATTCGGCACATTTCCCAAACGCCGAACCACAACAGCTGTAATGACGCAAAGTTGTACTCATCAGGTGTAAATAAGGCATtctgtgtgattaaaaaaagagtgaCTATGAGAAGTCAGAGACAcgatgaagaagaagaggctAGGGGAAAATCATTTGGAGGAATTTATATCCAGACAGTGGTTTGTTTCAAtgcagtttgttatttttgaaatgttgaaaatgCACGTATTTGCCATATCATTAGCTTGTATGTGCATATGTGAGCATCTGTTTCAAATCTTAATCTAACTCTTAATCTAAAAAGCCTTGATGAAGAGCATGATGACGAGCTGCTctctttttgtgtgtaaatatgtggtTGTGGTAATTGAACACAGATCtctaaacacacatactgtatcagatgcaagatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggacctgcTTGGTGCCAAAATACCCAATGTTAGTCTTTCTTCAATCTCTACAATCTGCCTAAATGATTATGGCTCCACCGCAAGACTCAGTGGTTGTTTGTGCGATTGGACAGGCTTGCGTGTgcatccttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgctgtctaattaaattaaattgagtTAGAGCAGCATTTAGGTTGACCTGGTGGAGATTTGGAGTTTTTATGCAACTTCTATACACTAAGACTGTTTCATAgtttgtgcaagtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgcatgagagagagacagaataagaaGAAGAGGTGTGTGGGAAAGAGTCAGACTTGGTCTTTCCTTCTGGACAGAtctatgactgtgtgtgtgtatcatggGTGATAAATGAAGGGAAATGAAAGAGTGTGAGATTTGGGAGTGTTGGGAGAATTCTGTGGTCTGGCAGTTCACTGGCGTCAGACAGATGCTTTCATTTTTCTCCTTCAAACTGCAAAAATATACACCCACCGAGACAGAGGGGATGGTCAGAGAGCATTTTAGGTAAAGGAATGCCACGAAACTGTCTCCTCCCTCCATTTCTcttctccctcttttcttttttttgaccttccttttttctttcatcctcATTTTTGTCAGGCCGGGTTCGTACAGTGGGGCCTGGGAATTGGAGCCGTAATTAGAAGGAGATGCTCTGTGAATGTAAACCTGagaaaaatacaacacataaagagagacagagggagagagagagagagagagagagagagagggcgagagTTTAGTAAGAATGTCTCAGActatatgtatgtttttgttttcatcctAAACTCTATACATTGTATCTATCTAAAATCTCAGATGTAAACATGTCTACTTGATCCTAACAGCGATGGCACAGAAGGAAGGATATGTAGCTATGCATAACTGGTGGAGTTGTGTGCGTCTTATCACGTATAGGTGCCACTAAACTTTTAGGAACGTGTGCGTAAACTGGAAGACTTAAACTTTATACAGCATGTATTAAAGAAAAGTCGTTTGCTGATCTCTGTATTGATTTAGTTTGTTACTTCATGTCAAAACTAGTTCTTACTGACacgaaggctacggtaactgaaataaccactctttacaaacatggtgagcTGAAaggcatctcaaaatgcacagtATGCCAAAATATGaagttacagcagcagaagaccacagtgggttccactcctgtcaactGATAACCATGCTTTCATAGAGGTGAAGAAAAAGAACGTTTGTAAGGACGTAGCGGAGATCGTTGGTGCTTCTGGTGAGTGGACGTAGCTTGGACGAAGCTTACATAACATAGAGataagttttacattttaagtgtgttttaaataaaagtaagtcATATACTGTAGTAAACTGTGCTGTAGGTTACTACCATTTCTCatcggaaaagaaaacaaaaaaaaatctggatggATGgtacacgcccacaagagacaacagTAGCACTTTCTGCGACACGAGCAACTTGTCACAGATAGTGTGAACACAAGGTCAAATGTATCGTTCATACTTCGCATCAGTATTCAGGTATCCCaatatcctgtgtgtgtgtgtgggggtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtctgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtttgtgtatgtgaagAAATGATTGAGTGTTGGTTAGAGGATATACAGAAGCTGACCAGACTGGCTTAAGGGCAAACCGAGGCCTCATTTATGATCATTTATTGGCCGaatgattacatttaaatgtgGTTGATGAAAAGTGATCACATATTTAGCCAATTTTCTTCCCAAATgtgcaatacacacacagaggaagaagCCGTCCATGTCTGATCGAGCCTCTCCTCGTGAAGGTGTGCCCTGGCTAGGATTGATGGGCTCGTGTCACAGCTTGTGGCTGTGAATATCCTGCTGAAGCACAGCGCTCTTTAATTAGAGACAAATTGAAAATGTGAGAAGCGAACGTGCCATGCCTGACATGTCTGTCTAATATATATTGCACTCCACACTTAGGTCtgctttcgttttttttttccgttttaTAGGAACAGCACGATGCAGGGATTAAGGTTTTCTTTAATCCGCTCTAAAGCACCTCATTAAACTCGTCAGATCTTTAACAAGTTGAAATAGGAATACGCGTGTAGAAATAGGAAACACTAAGTTTGTAGGGATGCACCCAAATCTTGGGAGAAATagtaaaaatgctgaaaaaatgccgttgttctgtttctgttttaaaaattataggTGCGGTTTGTAATTTGTATAAAACACTTCCTAGATTTATAATAAGCCTATAATTTCTTAAATATCGTAGGAAAACTGTGATTCAGTATTATCATGCAGTGTAAAGTGgccaatttttattcattccagGCTTCTGTTTACAGTTTTCCGGCCCTGAAATTGGCTCCGCCTCCATCCCCAACAGAACTGCTCAGCcacttttctttaaacatttaaagctcACAGGACATTTACCTTATGTTTTTAGCAACGGGGGTGGAATTGATTAGGGGAAGGAAAAGGCGTCTCAGTGTTTGTATTATAATTGCAATTCATCGctgaaattttttaaactgcacctttaaatacacaaacatgacaATTTAATGCAAATCACTATGTAAATAGCAACTTGTTGAGTCAGgtgtgttgccagattgggcaaGATTCCTCTTCTAATCAGTTTATTCCTTTGGCAGGTAGTTGCATTTCACAGCTTGTTTTTCTTCCTAGTATGTCCTGAATTTCAGTTAAGGCCAAGAACCTTTGTTCCGATGCATCCTTGCTGTGGGTTTTTCTAAAAACTCTGACGTGGACTTTGCAGATAAACCCATAAGGCAGATGATAATGTTTGGGTAAAGATGttcatttgttgtgttgtgttgtgttttgtcgTGGAACTTGGTTCCTGTGCTGCTGTTTTCTTCGCTCTCGAGTTGCTAGATGTTGTTTTGTGCGAATTTAAGATCTCAGATCAGCGTAAAAATCACATCTCTACTCCGAAACTCTgtattttctactatttttcTGCCTTACATATAACGTACTGTACATGAAGCTCTTAATCCACTTGGCTGTGAACCTTCACCTGCAGTcgttttgttgtgtgtttgtgtgtttgaatgttacACTGAGAGATGTTTGGATGATACAATCATCTTTGAGAGAGCTGAAGCTTTAAAGTGATTCTCCTTCCTTTTTgtaatggtttttgtttttgatttgtttttttgaaagagacaaaaaaaaggactGAAAATTCACGTCATTAAGTGCTTCTCAGTTTTGATACTGCTTGATGTAATGTCTTTTCTATCTGTCGGCAAAACATAAAAAGATATACAAATTCCTTTTCTGTTCTGCGTCACCCCGTGAGACATCTatgctaaaagaaaaaaaaagactggtgatttgtatttttcattatttgttcaTGTGCAGGGCTGAAAAGAATCCGGTACATTGTACTAATCTGTGTGATTATATAAGCACTAATGTATAGAGGCTGAGTACAGAACACTTACACGCCATGGattcacatattttatttactgttttccTGTGATAACCAGGTCATTTCATATGTTTACACATGATCTTGTGTTATTAACGTCATTatcacaagaaaacaaacatttaaaaaaaaaatcctgttatAACACCAATTTGATCTCTCATCATCTCAGATTGTTGTGTCATTATCTCGGGAAAACAACGTTTTGTTCAAGATCTTAAACGATGCCATTATCAAGAGCATTTCGATTTTTccagatattatattatgtcATTGCTAAGGAAATAGTTTTGTTCTTTTACGATCTCAGATGGTTTTGTGGAAAACCTTTTGTTCTTTAGAGATTTTAGACTGTTGTGTCTATCTTGAGAAAACATTGTTTAGTTTTTTCACGATCTCAGGTTGTTTTATAGTTGTCTCGGGAAAGCATTTTGTTATATCTCAGATGCAGGTGTTGTCATGAAAAAAACAACGTTTTGTTCTTTCAACATCAGAGATTGTTGTGTCGTTATCTCGGGAAACCggcattttgttattttaggaTCTCAGATTGTTGTGACATTATCTTGGGCAAAATGTTTGGTTTTTCTGAGATATCTGATTATTGTGTTGCTATCTtggaaaaacaatttttttttgttcttctcgAGACCTCAGACTGTTGTTATCTCTGAAAAACATTTGGTTACTTTAAGAACTCAAatagtttgtttgttgttatattggaaaaacagcattttgttcTTTCAAGGTCTCAGATTATTGCGACGTTATCTCAGAATAAAAACAATGCTGGGTTCTCTTTGAGATCTGAAATTGTTTTGTCGTCttgggaaaatgttttgttcattcAAGATCTCAGATTGTTGTATTGTTATCTCTGGAAAGCAATGttttgggtctttttttttttttagatttcagactgttgtgtcattttcttaagaaaacattttgttttttgaaaatctTAGATAATTGTGTTGTTCTGTTGGTTCTTTTGAGATCTCAGATAATTAGTTTGTTATCTTGGTAAAAGAATAGTTTGTTATTTCGTGATCACAGATTGTTGTTGTTATCTCGGGAAAATGTTTAGTTTTTCAAGATCTCAGATTGTTGTTATCTCGGGAAAACAGTGTTTACTTTTTCAACATCTcagattgttgttgttttctctgGAAAGCAGTGTTTACTTTTTCAACATCTCAGATTGTTGTGTTGGTATCCAGGGTAAACAATGTTTTCATTCAGGGTTTGAGATCGTCTGAGATTTAAGATCTCagatttttctctgtctctggaaaacagtgattggttgtttttTAAAGATCTCAGATTGTTGTGTTGTTATCTTGGGAAAACAATGCTTCTCAGATTTCAGATCTCAGATTGTTGTGTCTTTATCTCTGGAAACCAGCACTCGTTATCTCTTTGTAATGGTATTAAATAACTCCTTACCTTGTGAGCGCAGGAGAAGTGAGTAACTAAAATATGTGAATCATTTTTAGGGCttgctttaataaaatattgctaTAGAACTAATCTCTTATGCCTAAAAAAGCCTGAATTCAGCCTGAGGCGAacataataaaaagaaagttaGCTTCCACAGATATGATTCTGTCTCAGACGAGAGCAGATGTTGcttaatgaatgtgtgtggaGGGAAAACAGAAGTCTGTCTGGCTGAGCGTAGCTgaagtcttttttttttcaatgcaaaatgacaaaatagtgATTTAATGGACTCATGTGAAGTACAAtcatctttgtttttctttttaacagaaTATATGACATGGTTTGATGCCAAGTTTGCTTCAGTAATGTGTAGTACTGAATCTGGGCTGCTAGATAGggattttaaatgtgtgtgtgtgcattttgtaCATGTGCAGTGATGGCACAGCTTTTAGGAATATGTAAACACCATGatgaagatgaatatgatgaggctgatgatgataaatgaatatataagtaaataaataaataaacaaata
>XM_026932239.2
agCGTTTCCACTTCCGCTCTAGCAGTTTGTAAACATAGCGAAAGGAGAGATGGAGTCGACAAGAGGTCTCACCTAAAAATATTCCTCAGATtagatttccacacacacacagagggtgaagagtgtgtgtgaggcgtgAGGAGCGGACCTGCAGGGACATCTGGATATTCCGTTTAAACCGGAACtggctttttattttcctttcaggGAAAAAATATCTAACGCTTATCTCCAGCTAGCTGCTGCTGTTTGTGTCCTGACTAGCTGcttacagagacacacacacacacacacacacacacacagacacacagacagacagtcagagagagagaaacagacagacggCGGTAAATTTGTGACTTATCCGGAGTTTATTTGTCGCTGgttttgtctcctgctcggctCGATGGGGAACTGTCTCTCCTCTCAGAGTGCTGATGATCTGTCCCTGCTCAACGAGTCTGAGGGAGCCAGTCTCCCCGGAGAGCCTCCACCTCCctatcagGAGCGTGTGCAGGTGCCCGTGTACCACCCCACGCCCAGTCAGGCCCGTCTGGCCACCCAGCTGACGGAGGAGGAGCAGGTCCGGATCGCTCAGCGCATTGGCCTCATCCAGCACCTCCCACGCGGCATCTTCAACCCGGGCTCCGAACCCTCCGACAAGAAGATCAAAGAGTGTGTGATCTGTATGCTGGACTTTGAGTACGGAGACCCAATCCGGTTCCTGCCGTGCATGCACATCTACCACGTGGACTGTATCGATGCGTGGCTCATGCGCTCCTTCACCTGCCCCTCCTGCATGGAGCCGGTGGACGCTGCGCTGCTGTCCTCCTACGAGACCAACTGAGCCGCGCTCACTGCCATCCGAGACACGCCAGCACGGGGAACATGCCAGTCGAGTCAGCCGGGGGGGTCGTGAGGGGGGATTAAGAGGGcaggaggggtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtctgcgtatgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtttgtgtatgtgaagAAATGATTGAGTGTTGGTTAGAGGATATACAGAAGCTGACCAGACTGGCTTAAGGGCAAACCGAGGCCTCATTTATGATCATTTATTGGCCGaatgattacatttaaatgtgGTTGATGAAAAGTGATCACATATTTAGCCAATTTTCTTCCCAAATgtgcaatacacacacagaggaagaagCCGTCCATGTCTGATCGAGCCTCTCCTCGTGAAGGTGTGCCCTGGCTAGGATTGATGGGCTCGTGTCACAGCTTGTGGCTGTGAATATCCTGCTGAAGCACAGCGCTCTTTAATTAGAGACAAATTGAAAATGTGAGAAGCGAACGTGCCATGCCTGACATGTCTGTCTAATATATATTGCACTCCACACTTAGGTCtgctttcgttttttttttccgttttaTAGGAACAGCACGATGCAGGGATTAAGGTTTTCTTTAATCCGCTCTAAAGCACCTCATTAAACTCGTCAGATCTTTAACAAGTTGAAATAGGAATACGCGTGTAGAAATAGGAAACACTAAGTTTGTAGGGATGCACCCAAATCTTGGGAGAAATagtaaaaatgctgaaaaaatgccgttgttctgtttctgttttaaaaattataggTGCGGTTTGTAATTTGTATAAAACACTTCCTAGATTTATAATAAGCCTATAATTTCTTAAATATCGTAGGAAAACTGTGATTCAGTATTATCATGCAGTGTAAAGTGgccaatttttattcattccagGCTTCTGTTTACAGTTTTCCGGCCCTGAAATTGGCTCCGCCTCCATCCCCAACAGAACTGCTCAGCcacttttctttaaacatttaaagctcACAGGACATTTACCTTATGTTTTTAGCAACGGGGGTGGAATTGATTAGGGGAAGGAAAAGGCGTCTCAGTGTTTGTATTATAATTGCAATTCATCGctgaaattttttaaactgcacctttaaatacacaaacatgacaATTTAATGCAAATCACTATGTAAATAGCAACTTGTTGAGTCAGgtgtgttgccagattgggcaaGATTCCTCTTCTAATCAGTTTATTCCTTTGGCAGGTAGTTGCATTTCACAGCTTGTTTTTCTTCCTAGTATGTCCTGAATTTCAGTTAAGGCCAAGAACCTTTGTTCCGATGCATCCTTGCTGTGGGTTTTTCTAAAAACTCTGACGTGGACTTTGCAGATAAACCCATAAGGCAGATGATAATGTTTGGGTAAAGATGttcatttgttgtgttgtgttgtgttttgtcgTGGAACTTGGTTCCTGTGCTGCTGTTTTCTTCGCTCTCGAGTTGCTAGATGTTGTTTTGTGCGAATTTAAGATCTCAGATCAGCGTAAAAATCACATCTCTACTCCGAAACTCTgtattttctactatttttcTGCCTTACATATAACGTACTGTACATGAAGCTCTTAATCCACTTGGCTGTGAACCTTCACCTGCAGTcgttttgttgtgtgtttgtgtgtttgaatgttacACTGAGAGATGTTTGGATGATACAATCATCTTTGTGCACCTTTTGAATTTGCTCGGCCAGCAAGAAGCCAACGTCGAGAGAGCTGAAGCTTTAAAGTGATTCTCCTTCCTTTTTgtaatggtttttgtttttgatttgtttttttgaaagagacaaaaaaaaggactGAAAATTCACGTCATTAAGTGCTTCTCAGTTTTGATACTGCTTGATGTAATGTCTTTTCTATCTGTCGGCAAAACATAAAAAGATATACAAATTCCTTTTCTGTTCTGCGTCACCCCGTGAGACATCTatgctaaaagaaaaaaaaagactggtgatttgtatttttcattatttgttcaTGTGCAGGGCTGAAAAGAATCCGGTACATTGTACTAATCTGTGTGATTATATAAGCACTAATGTATAGAGGCTGAGTACAGAACACTTACACGCCATGGattcacatattttatttactgttttccTGTGATAACCAGGTCATTTCATATGTTTACACATGATCTTGTGTTATTAACGTCATTatcacaagaaaacaaacatttaaaaaaaaaatcctgttatAACACCAATTTGATCTCTCATCATCTCAGATTGTTGTGTCATTATCTCGGGAAAACAACGTTTTGTTCAAGATCTTAAACGATGCCATTATCAAGAGCATTTCGATTTTTccagatattatattatgtcATTGCTAAGGAAATAGTTTTGTTCTTTTACGATCTCAGATGGTTTTGTGGAAAACCTTTTGTTCTTTAGAGATTTTAGACTGTTGTGTCTATCTTGAGAAAACATTGTTTAGTTTTTTCACGATCTCAGGTTGTTTTATAGTTGTCTCGGGAAAGCATTTTGTTATATCTCAGATGCAGGTGTTGTCATGAAAAAAACAACGTTTTGTTCTTTCAACATCAGAGATTGTTGTGTCGTTATCTCGGGAAACCggcattttgttattttaggaTCTCAGATTGTTGTGACATTATCTTGGGCAAAATGTTTGGTTTTTCTGAGATATCTGATTATTGTGTTGCTATCTtggaaaaacaatttttttttgttcttctcgAGACCTCAGACTGTTGTTATCTCTGAAAAACATTTGGTTACTTTAAGAACTCAAatagtttgtttgttgttatattggaaaaacagcattttgttcTTTCAAGGTCTCAGATTATTGCGACGTTATCTCAGAATAAAAACAATGCTGGGTTCTCTTTGAGATCTGAAATTGTTTTGTCGTCttgggaaaatgttttgttcattcAAGATCTCAGATTGTTGTATTGTTATCTCTGGAAAGCAATGttttgggtctttttttttttttagatttcagactgttgtgtcattttcttaagaaaacattttgttttttgaaaatctTAGATAATTGTGTTGTTCTGTTGGTTCTTTTGAGATCTCAGATAATTAGTTTGTTATCTTGGTAAAAGAATAGTTTGTTATTTCGTGATCACAGATTGTTGTTGTTATCTCGGGAAAATGTTTAGTTTTTCAAGATCTCAGATTGTTGTTATCTCGGGAAAACAGTGTTTACTTTTTCAACATCTcagattgttgttgttttctctgGAAAGCAGTGTTTACTTTTTCAACATCTCAGATTGTTGTGTTGGTATCCAGGGTAAACAATGTTTTCATTCAGGGTTTGAGATCGTCTGAGATTTAAGATCTCagatttttctctgtctctggaaaacagtgattggttgtttttTAAAGATCTCAGATTGTTGTGTTGTTATCTTGGGAAAACAATGCTTCTCAGATTTCAGATCTCAGATTGTTGTGTCTTTATCTCTGGAAACCAGCACTCGTTATCTCTTTGTAATGGTATTAAATAACTCCTTACCTTGTGAGCGCAGGAGAAGTGAGTAACTAAAATATGTGAATCATTTTTAGGGCttgctttaataaaatattgctaTAGAACTAATCTCTTATGCCTAAAAAAGCCTGATCTAGAAACAGTTTAGGAACACAGAACCTGAATTCAGCCTGAGGCGAacataataaaaagaaagttaGCTTCCACAGATATGATTCTGTCTCAGACGAGAGCAGATGTTGcttaatgaatgtgtgtggaGGGAAAACAGAAGTCTGTCTGGCTGAGCGTAGCTgaagtcttttctttttttttttctttttttttttttataggacATGTATACTACATGTTTCATTGCAAGTCATCTGAAGttgaatatgtttaaaaatgtagctCTAGTACagacttttctctttttttttcaatgcaaaatgacaaaatagtgATTTAATGGACTCATGTGAAGTACAAtcatctttgtttttctttttaacagaaTATATGACATGGTTTGATGCCAAGTTTGCTTCAGTAATGTGTAGTACTGAATCTGGGCTGCTAGATAGggattttaaatgtgtgtgtgtgcattttgtaCATGTGCAGTGATGGCACAGCTTTTAGGAATATGTAAACACCATGatgaagatgaatatgatgaggctgatgatgataaatgaatatataagtaaataaataaataaacaaataaataacaattctTCCA

Function

symbol description
rnf11a Predicted to enable metal ion binding activity. Orthologous to human RNF11 (ring finger protein 11).

NR:

description
PREDICTED: RING finger protein 11-like

GO:

id name namespace
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU445072 True 9061 lncRNA 0.38 6 14106222 14180614
XM_026932239.2 False 5111 mRNA 0.39 3 14106206 14115530

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
get3 asna1 coding downstream 480 14096792 ~ 14105726 (-)
best2 LOC108258279 coding downstream 11351 14087985 ~ 14094855 (-)
LOC113537289 NA coding downstream 33001 14068175 ~ 14073205 (-)
tpt1 tpt1,LOC107598740,LOC107691594 coding downstream 63538 14036430 ~ 14042668 (-)
LOC113537776 NA coding downstream 67220 14038854 ~ 14038986 (-)
prdx2 prdx2,LOC107757043 coding upstream 164728 14345342 ~ 14353154 (-)
ctsh ctsh,LOC107690365,LOC107556249 coding upstream 180850 14361464 ~ 14370687 (-)
aplf NA coding upstream 230758 14411372 ~ 14430546 (-)
etaa1 NA coding upstream 295924 14476538 ~ 14482864 (-)
actr2a actr2,LOC108423375,LOC108441254,LOC107660226,LOC104930021 coding upstream 373877 14554491 ~ 14567086 (-)
G375864 NA non-coding downstream 20765 14078964 ~ 14085441 (-)
LOC117596131 NA non-coding downstream 245432 13853076 ~ 13860774 (-)
G375615 NA non-coding downstream 269673 13836098 ~ 13836533 (-)
G375614 LOC108259021,LOC107655163,LOC107580539 non-coding downstream 271226 13832468 ~ 13834980 (-)
LOC117596119 NA non-coding downstream 275635 13829181 ~ 13830571 (-)
G376038 NA non-coding upstream 141570 14322184 ~ 14340390 (-)
G376048 NA non-coding upstream 202594 14383208 ~ 14455469 (-)
G376050 snrpb2 non-coding upstream 205724 14386338 ~ 14387875 (-)
G376055 NA non-coding upstream 281528 14462142 ~ 14466508 (-)
G376093 NA non-coding upstream 351753 14532367 ~ 14532684 (-)
G375826 NA other downstream 75327 14027294 ~ 14030879 (-)
pibf1 pibf1 other downstream 90055 13982745 ~ 14016151 (-)
klf5a LOC108259069 other downstream 125955 13972336 ~ 13980251 (-)
G375428 NA other downstream 666671 13439219 ~ 13439535 (-)
gyg2 gyg2 other downstream 785676 13307713 ~ 13320530 (-)
dand5 LOC108258523 other upstream 93713 14274327 ~ 14276537 (-)
meis1a meis1 other upstream 279669 14460283 ~ 14524516 (-)
G376143 NA other upstream 501773 14682387 ~ 14684328 (-)
ifngr1 NA other upstream 516625 14697239 ~ 14712646 (-)
b3gnt2a LOC108259010 other upstream 559518 14740132 ~ 14749734 (-)

Expression


Co-expression Network