LOC113524085


Basic Information

Item Value
gene id LOC113524085
gene name NA
gene type coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047623.1
NCBI id CM018569.1
chromosome length 15305753
location 1916290 ~ 1932126 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>XM_026910211.2
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>XM_026910212.2
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Function

GO:

id name namespace
GO:0016757 transferase activity, transferring glycosyl groups molecular_function

KEGG:

id description
K00737 MGAT3; beta-1,4-mannosyl-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_026910211.2 True 5506 mRNA 0.41 3 1916290 1932126
XM_026910212.2 False 5373 mRNA 0.42 4 1916290 1932126

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC113524042 NA coding downstream 41253 1872919 ~ 1875037 (-)
LOC113524043 NA coding downstream 55333 1858882 ~ 1860957 (-)
LOC117596466 NA coding downstream 92521 1821683 ~ 1823769 (-)
LOC117596405 NA coding downstream 106437 1808522 ~ 1809853 (-)
LOC113524064 NA coding downstream 147541 1766704 ~ 1768749 (-)
hspbp1 hspbp1,LOC107550267 coding upstream 2380 1934506 ~ 1951096 (-)
LOC117596454 LOC108273013 coding upstream 30604 1962730 ~ 1970432 (-)
jmjd8 jmjd8 coding upstream 47132 1979258 ~ 1982556 (-)
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G398953 NA non-coding upstream 108175 2040301 ~ 2040923 (-)
G398890 LOC108272981,LOC108272980,LOC108272984,LOC108273047,LOC108272983,LOC108414567,LOC108412175,LOC108413798 other downstream 35232 1730090 ~ 1881058 (-)
st13 st13,f10a1 other downstream 324556 1565795 ~ 1591734 (-)
LOC113524069 LOC108261293,LOC108261210 other downstream 399976 1462119 ~ 1516314 (-)
LOC117596459 NA other downstream 454220 1457832 ~ 1462070 (-)
LOC117596427 NA other downstream 598654 1276278 ~ 1317636 (-)
mmd mmd,LOC107567562,LOC107696363,LOC107695694 other upstream 422783 2354909 ~ 2377631 (-)
G399028 NA other upstream 440170 2372296 ~ 2426606 (-)
G399490 nup85,LOC106601803 other upstream 1029587 2961713 ~ 2964157 (-)
G399489 LOC100526730,LOC108272862,LOC108261293,LOC108272815,LOC108272567,LOC108280065,LOC108261153,LOC108279530,LOC108261103,LOC108272472,LOC108280069,LOC108257281,LOC108261104,LOC108257289,LOC108257310 other upstream 1085164 3017290 ~ 3295273 (-)
LOC113525117 NA other upstream 1215173 3147299 ~ 3196563 (-)

Expression


Co-expression Network