AMCG00000032


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00000032
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030141.1
NCBI id CM030141.1
chromosome length 22147039
location 231336 ~ 254441 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00000032
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>TU185240
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>TU185241
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>TU185246
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>TU185248
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>TU185251
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>TU185252
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>TU185253
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04612 Antigen processing and presentation

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00000032 False 1337 mRNA 0.37 5 233879 246914
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TU185253 False 1565 lncRNA 0.38 7 232086 254441

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00000028 NA coding upstream 75529 146945 ~ 155807 (+)
AMCG00000030 NA coding upstream 84402 141021 ~ 146934 (+)
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AMCG00000029 NA coding upstream 202672 27600 ~ 28664 (+)
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AMCG00000034 NA coding downstream 63123 317564 ~ 336417 (+)
AMCG00000038 LOC102299462,LOC102207316,LOC108269999,LOC100697238 coding downstream 137737 392178 ~ 418905 (+)
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AMCG00000040 NA coding downstream 247054 501495 ~ 569704 (+)
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G147288 NA non-coding downstream 102331 356772 ~ 356988 (+)
G147292 NA non-coding downstream 131849 386290 ~ 386953 (+)
G147313 NA non-coding downstream 216254 470695 ~ 473507 (+)
AMCG00000025 NA other upstream 126974 55439 ~ 104362 (+)
AMCG00000026 NA other upstream 193561 28694 ~ 37775 (+)
G147311 NA other downstream 195211 449652 ~ 498511 (+)
G147416 NA other downstream 808644 1063085 ~ 1116950 (+)
AMCG00000073 mta1,LOC107679789,LOC107666257,LOC107600838 other downstream 1781582 2036023 ~ 2058770 (+)
G147726 LOC104962440 other downstream 2149289 2403730 ~ 2403972 (+)
AMCG00000094 NA other downstream 3436331 3690772 ~ 3699093 (+)

Expression


Co-expression Network