XLOC_000591


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_000591
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 46719096 ~ 46726957 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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>TCONS_00003138
CGCCATTCTTACACAACCTGTCTTTCTCTCACTGATGAAACCACCGTTATCAGGTGAGCCCACACTGACAATAAACTTTTGGAGTCACACAAGCGAGAGGACAGTGAAGCATCTGCTGTCTATAAGGCTAAAATTACAGGTTATGAAAAGAGGACTTCTGGgagaacaaaaaaatgaaaagtgtTCGTGGACAAAAGCTTGTAGCCTCCCACATTATAATATTTACTTATGTTGTTTGCTCTGTCTGTATGcctttcaccttttttttttctcttttgtcagGTACTTCATGAGAATATAGACATTTTTAGGCTATTCTATACATTTCATGCACTACAAATTCACATTTCTTATATTTCTTTTATAGGCAATAATAAGGTTAAATCAGTGGTGTACTTACAGTCACTTGAGTCTGTCACAGCTCAGTGTCATGCCGTGTGCTCTACATTCCTTTCCtggagaaaacaaaaataaagacattCATGAAGCACAAATTTGGGCTTTTTTTGGATTATTTTTGCGTTAGACATACAGTGCTCAGAACTATTGAGtacaccacattttgaaaatgaatattttgatccatttctcagtctCAGGCTGTGTATTTTGCTGcacttaaacaaaacagatttttttaacagatatatgtattaaaataatattttagtcaccaaacatatttagatataaaaatatgcaattcaattcaagctaaatattgcaaaaattaaatgacaacctACATAATTTCAACAAAAACCTTCAAAttcttttgcttttcttgatttctcctctttaaaatttaatatgttctatatcatataaatttgggtgtactagtttgtggaccgttattttgttagataagc

Function

GO:

id name namespace
GO:0140058 neuron projection arborization biological_process

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00003132 False 4522 lncRNA 0.33 2 46719096 46726957
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network