AMCG00001164


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00001164
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030137.1
NCBI id CM030137.1
chromosome length 27060302
location 17440716 ~ 17486990 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00001164
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taaaattgaatatttaaaactatttttctaAAACCTGATGGGtgcatttcatattaatatatctCAATAAATATCATGT

Function

GO: NA

KEGG:

id description
K24437 TSEAR; thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00001164 True 10079 mRNA 0.41 16 17440716 17486990

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00001160 NA coding downstream 120187 17314065 ~ 17320529 (-)
AMCG00001155 LOC107586362 coding downstream 440154 16998617 ~ 17000562 (-)
AMCG00001151 NA coding downstream 506140 16894843 ~ 16934576 (-)
AMCG00001150 NA coding downstream 567989 16857154 ~ 16872727 (-)
AMCG00001145 NA coding downstream 1041286 16395035 ~ 16399430 (-)
AMCG00001167 ube2g2 coding upstream 407 17487397 ~ 17496135 (-)
AMCG00001163 NA coding upstream 36462 17523452 ~ 17537225 (-)
AMCG00001166 LOC103370188,LOC102799206,LOC101480403,LOC102206624,LOC102301787 coding upstream 57593 17544583 ~ 17593861 (-)
AMCG00001172 NA coding upstream 242008 17728998 ~ 17729801 (-)
AMCG00001171 NA coding upstream 270088 17757078 ~ 17768452 (-)
G129213 NA non-coding downstream 109035 17331460 ~ 17331681 (-)
G129125 NA non-coding downstream 445308 16923711 ~ 16995408 (-)
G129126 NA non-coding downstream 499434 16940667 ~ 16941282 (-)
G129065 NA non-coding downstream 560231 16876311 ~ 16880485 (-)
G129042 NA non-coding downstream 866117 16520181 ~ 16574599 (-)
G129273 NA non-coding upstream 223907 17710897 ~ 17761905 (-)
G129286 NA non-coding upstream 291926 17778916 ~ 17782649 (-)
G129358 NA non-coding upstream 485019 17972009 ~ 17976917 (-)
G129370 NA non-coding upstream 570150 18057140 ~ 18057666 (-)
G129394 NA non-coding upstream 753466 18240456 ~ 18265272 (-)
AMCG00001156 NA other downstream 253086 17126359 ~ 17187630 (-)
AMCG00001127 NA other downstream 1531590 15519616 ~ 15909126 (-)
AMCG00001118 hibch other downstream 2007247 15364067 ~ 15433469 (-)
AMCG00001119 ftcd other downstream 2008386 15409170 ~ 15432330 (-)
G128741 NA other downstream 2260394 15179241 ~ 15180322 (-)
AMCG00001165 LOC100709166,LOC105019893,LOC103392195,LOC107668404 other upstream 27396 17514386 ~ 17521270 (-)
AMCG00001193 NA other upstream 1037743 18524733 ~ 18532689 (-)
AMCG00001196 RPL37A,rpl37a,zgc:171772,rl37a,LOC107564751,LOC107567628 other upstream 1068245 18555235 ~ 18558217 (-)
G129566 NA other upstream 1401775 18888765 ~ 18889757 (-)
AMCG00001251 NA other upstream 3753492 21240482 ~ 21270383 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location