G130251


Basic Information

Item Value
gene id G130251
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030137.1
NCBI id CM030137.1
chromosome length 27060302
location 22654917 ~ 22741107 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU163266
TTGTATCCATTTTAATATCACCAAATAGACAGCTTGTCACAGAAaggacaacaaaaacattttcacaggtTGCTATGGAAATACAACTGCTGGGTTACATGAATAGCCCCTTTCAGCCCAGACACTGAACTGTACAACACTCTGAATTTCAGGAAAACACCTAAACAGACTTTTGTCAGCAACACTGTAATGTATTCCCAGATTCAAATTCTGTTCTGATGAGGCAAATCCTAAAACCGCTACTGCACACACTGATCAAACTCAATGGAGAATAATAAATAGGTATGTAACATacagaaataagaacaaaagcaaaaacatttctcTAGCCGAGTTCTATGCTTGGACTTGAAAGGAACAGTATTCAATTCACCGAAGACAGTTTCATGTGCATGGTAGCTGATGTAACAGATttcaaagaaagacagccaaagaaacaaaagatgATCCACACCTTTATCTTTATacttcagattgtttttttttcccagtagCACAATGGCATGATACAGTAAAAGGATGCATGAAAAGGACAGAGTTGTTCAAGCACATGGGAGAGGTAGGGGACTTCTCAGTTGGGCTGTTTATCCAACTGCCTGGTTTCAAATACTTAACAGCACCTACACAAGATATACAGAGTCACACAGGGAGACCCAAGGAAGAGAAGGTGTGATCTGTCTTGGGAGCCCTATTGTAAAGCACTCCCTAGGCCAGCTTCACAAAGACCCTATTACTGTGTGAAAACAAGAAGTATTAAGGGGGGGTCACATTCACTCTCTTATTTGTTCTTTCACATTTTCTACacaacaatgaaacaaagagCATGGGGCTGGATGTACTAAAAGACTGTGCATATGAAGCTGTTGCAACCCTAACTTGTTGGGCCTGTACACGTGTGCCTTAAAAACATCTGCTTATTTGagcatatttataaaaatggaACATACACCTCTTCTATGAATGTACAGGTATttgtcattcaaaataaataatcagaaatgtaagaGTATTAAAGGTCAGTCCTTTATAATGAAGaatagtaaaatattaaacCATCTGAATGAAAAGATATATGAAATTTGCTGGCTATTAGGGAAGTGTACCTACTTTCAACAGTTAATGAATGGGTACATATTGGAACACATACAGGGAATCCTTGAACAACGCTGTAGTGACTATCCTGGAAATCACCACTTTCAATGTGCGTTATTGTAAACTTAGAAATCGATGTAAAAGTCTGAGTTATGTCCCGGAATATAAAAACAAGTATGTAATTCGAccgtaaaaaaatattttgccacTATCGAATTGAGCAATCACGTCTCATTTAACACTCAAATGAATCGATGTCCTGCTTTTCCTGCTTTTAGCTGCATTGTCTTAAGAATCACTGTTAACATGCTTAGAAGCCATGATAACTATATGTCACTTTATGATTAAGGCAATATAAAGAGATCATAATATGTCCTGCAGATGCTTCTGGGAGATATCATCTGGCCACAGCCAAAGCAAACTTTTATGAAGAAGGCGATTTTGGAGCATGTTTTGCTCCACGCTCCCAAATGTATACCTTCACACAACTGGGAGTCTTGTTCGAATCATGTTATCATGAAACTGGTGGGCATTATTCGGATAATGGGCAGTAAAGTGTACAGAGTTATGGCggaaatgcattgtttaaaaccACATTAAATCAAGCACTATGTGTATATTCAAAATCATGTCTACGTTTCACACTATTTCAGCCTTGAATCTGTTTtgtactgattttgttttaaattgtccaaaaaacatattttacatatataactGTGTTGCATAAAAGTAGATATGAGAGattgaattaatttatcattattattatttgtcatttttgttgtaaggagatattacatatatttatatcagtATTATGCATGCTGTcatcattaacatattttctcttaGTACATAggatttcaacatttattttgcaaactgcGCAACTGAGACACAGCTTATGGTATTTCTGCGCTGCATCTGGCCTTTCTTAGTACATCTAGCCCATGGTGTTTTAAACTCTAAGCCAATTTGAGGACCTTGATGAAGACAGGTCTCAtttctataaaatgtatgtatattcagTTTCCGCAAACTTCCTGACCCTAATAATCTGGATATACAAGTACTCTCTCCATTAAAATATAAGGCCTGTTTAAATGGAGGAagaacattttcttattttcaattGCCAGGAACTTCTCACCTATATCCTTTAGAAATGTTCAAACAGAAGGGTAGATTTTTGTCAGTAAAacagtagattttttttaaggttgaAACATCAGCCCCTCTCTCTAGACAGAATTGTTTTGCATAGTGACAGAGATGGGGCCAGATTTGGAGATGCAGCATATGTTACAATTAGGGAAGTGAATGAGTCACCTTTTGAATTCTTCAGTCTAAATGAATGGATTTCTTGGGCATATTCCAAACCCAAACTTTGACCAATCAATACTTGATGGAGGCTAATTGTTTGATAGATCAAATCTTTATTCTTACTAACCTGACACTATTCTTTTATGTTGATATTGGTGGGATTTGTCACAGGCCTTAATCAATGGAATAAGAATTCTCATAACTACAGTATATCTGTGTTTCAATTAAAGCCTCATGAATTTCTTGTGAAGTAAAAAGAGAGGACATTTGCATGAACAATGTCAGGCCTAAGTGGCACACAGTAATTCCAGCATTGAATCTTGTGTTCCAAAAGATAAGTATTTTGTGTTAAGAGGGGATATTGCAGTTGAAAATCTGAATTTCCATTGTGGTGAATCTGTTTAAATACCAATTAAATctgattaaaacacattactgATATACTCAAATAGAATACTGGTAGGTTGGTATTCCTTCTGTGTTTGATTTAGTTTGAAATAGATATCCACAACTGGCAGAATGAGTTTTCTGAAgcacagaattatttattttaaatatgatcgAGATAAAAGCGCCattccaataattcagtttttccAAAAAACTTTACATTAAGGTGTCATTAATACTTTCATTGGTAAATAATTTATAAgatataaattatcaataaacctttataagatatgatgtatcttttatatttaacacaaatGAAACTGGATAGTGATATGCAAGCTACcaaaacatgattttgtttaaaatctttattataaatgataaaccatatattttaaaggtttattggtaatttagaaatgtaattattaatagttcctaactgttttataagcAATTTCCAATCATGTATAAATGACACCTTAATATAAAGATTGACCAACATAACAATGCCAATATTTGGAAAAACTAGTGATTTTATCCATTTGGAGCAAAAGGTTTATCACCATAGATTTATTTGGTTGAGAAAAGCCTTTCTCCCCCTTTTGCCTTTGTTTCCCTTTGGGTCTAGTGTTGGAAACCTAAAATGTAACGAACACACAGGCTGGAAGGATGAGACCAGTTTATTGCCATTTCCCTTTTGTTATACAAAGCTTTTGTAATCATTCTGCTACTAACTATCACAACATAATTTCATGcaatacttatttttcttattctcttttaAGAGTAATAACATAATTTGTGTATCATTTAACGCCGCATGTCAATACAGATactgcattatttttcagaGGGTCAGAGGTTACTTGTGAAAccatggaaaaaacacaaaatgaggAAGTGCttccaaatatattatttcgttggtttctttctttccccaGTGGCAAGCATCACATGTTCACACAAAATGCACTTTCACAAGAATCTACTGTGAGTTCATTGTCATTCCATTAGATATCacagcaaaagaaaatcaatttctTCAGTACTGGGTATGTcagtattaaaaatgaaatttaaattaaaactctcTACCTCATACCTGCTACCACCTGGTAGACTGTAACTAAGTTTAGCTCTTGACCTTAATAACTtaacattaaactgcattattaGAAGCAATGCATATGTTCATATGCAGAATTGTAGATGATTTTCTATAAAAATGTTTCCTATAAAATGTGCAGCTTTAAAGAACCCAATCTGAAGTCTATCCTTTACAAATGTCTgaatttacagtgagggaaaaaagtatttgatcccctgctgattttgtacgtttNNccactgacaaagaaatgatcagtctataattttcatggtaggtgtattttaacagtgagagacagaataacaaaaaaaaatccactgcTCTTTGATGACCAGCAGGCCCAAAAATATCCCTGAAGCCTGGGGCTCTAGTCCACACTCATGCTGATGAAGATTAACATGCCTCAGTCAACTGGCTATAAGCTAT
>TU163267
TTGTATCCATTTTAATATCACCAAATAGACAGCTTGTCACAGAAaggacaacaaaaacattttcacaggtTGCTATGGAAATACAACTGCTGGGTTACATGAATAGCCCCTTTCAGCCCAGACACTGAACTGTACAACACTCTGAATTTCAGGAAAACACCTAAACAGACTTTTGTCAGCAACACTGTAATGTATTCCCAGATTCAAATTCTGTTCTGATGAGGCAAATCCTAAAACCGCTACTGCACACACTGATCAAACTCAATGGAGAATAATAAATAGGTATGTAACATacagaaataagaacaaaagcaaaaacatttctcTAGCCGAGTTCTATGCTTGGACTTGAAAGGAACAGTATTCAATTCACCGAAGACAGTTTCATGTGCATGGTAGCTGATGTAACAGATttcaaagaaagacagccaaagaaacaaaagatgATCCACACCTTTATCTTTATacttcagattgtttttttttcccagtagCACAATGGCATGATACAGTAAAAGGATGCATGAAAAGGACAGAGTTGTTCAAGCACATGGGAGAGGTAGGGGACTTCTCAGTTGGGCTGTTTATCCAACTGCCTGGTTTCAAATACTTAACAGCACCTACACAAGATATACAGAGTCACACAGGGAGACCCAAGGAAGAGAAGGTGTGATCTGTCTTGGGAGCCCTATTGTAAAGCACTCCCTAGGCCAGCTTCACAAAGACCCTATTACTGTGTGAAAACAAGAAGTATTAAGGGGGGGTCACATTCACTCTCTTATTTGTTCTTTCACATTTTCTACacaacaatgaaacaaagagCATGGGGCTGGATGTACTAAAAGACTGTGCATATGAAGCTGTTGCAACCCTAACTTGTTGGGCCTGTACACGTGTGCCTTAAAAACATCTGCTTATTTGagcatatttataaaaatggaACATACACCTCTTCTATGAATGTACAGGTATttgtcattcaaaataaataatcagaaatgtaagaGTATTAAAGGTCAGTCCTTTATAATGAAGaatagtaaaatattaaacCATCTGAATGAAAAGATATATGAAATTTGCTGGCTATTAGGGAAGTGTACCTACTTTCAACAGTTAATGAATGGGTACATATTGGAACACATACAGGGAATCCTTGAACAACGCTGTAGTGACTATCCTGGAAATCACCACTTTCAATGTGCGTTATTGTAAACTTAGAAATCGATGTAAAAGTCTGAGTTATGTCCCGGAATATAAAAACAAGTATGTAATTCGAccgtaaaaaaatattttgccacTATCGAATTGAGCAATCACGTCTCATTTAACACTCAAATGAATCGATGTCCTGCTTTTCCTGCTTTTAGCTGCATTGTCTTAAGAATCACTGTTAACATGCTTAGAAGCCATGATAACTATATGTCACTTTATGATTAAGGCAATATAAAGAGATCATAATATGTCCTGCAGATGCTTCTGGGAGATATCATCTGGCCACAGCCAAAGCAAACTTTTATGAAGAAGGCGATTTTGGAGCATGTTTTGCTCCACGCTCCCAAATGTATACCTTCACACAACTGGGAGTCTTGTTCGAATCATGTTATCATGAAACTGGTGGGCATTATTCGGATAATGGGCAGTAAAGTGTACAGAGTTATGGCggaaatgcattgtttaaaaccACATTAAATCAAGCACTATGTGTATATTCAAAATCATGTCTACGTTTCACACTATTTCAGCCTTGAATCTGTTTtgtactgattttgttttaaattgtccaaaaaacatattttacatatataactGTGTTGCATAAAAGTAGATATGAGAGattgaattaatttatcattattattatttgtcatttttgttgtaaggagatattacatatatttatatcagtATTATGCATGCTGTcatcattaacatattttctcttaGTACATAggatttcaacatttattttgcaaactgcGCAACTGAGACACAGCTTATGGTATTTCTGCGCTGCATCTGGCCTTTCTTAGTACATCTAGCCCATGGTGTTTTAAACTCTAAGCCAATTTGAGGACCTTGATGAAGACAGGTCTCAtttctataaaatgtatgtatattcagTTTCCGCAAACTTCCTGACCCTAATAATCTGGATATACAAGTACTCTCTCCATTAAAATATAAGGCCTGTTTAAATGGAGGAagaacattttcttattttcaattGCCAGGAACTTCTCACCTATATCCTTTAGAAATGTTCAAACAGAAGGGTAGATTTTTGTCAGTAAAacagtagattttttttaaggttgaAACATCAGCCCCTCTCTCTAGACAGAATTGTTTTGCATAGTGACAGAGATGGGGCCAGATTTGGAGATGCAGCATATGTTACAATTAGGGAAGTGAATGAGTCACCTTTTGAATTCTTCAGTCTAAATGAATGGATTTCTTGGGCATATTCCAAACCCAAACTTTGACCAATCAATACTTGATGGAGGCTAATTGTTTGATAGATCAAATCTTTATTCTTACTAACCTGACACTATTCTTTTATGTTGATATTGGTGGGATTTGTCACAGGCCTTAATCAATGGAATAAGAATTCTCATAACTACAGTATATCTGTGTTTCAATTAAAGCCTCATGAATTTCTTGTGAAGTAAAAAGAGAGGACATTTGCATGAACAATGTCAGGCCTAAGTGGCACACAGTAATTCCAGCATTGAATCTTGTGTTCCAAAAGATAAGTATTTTGTGTTAAGAGGGGATATTGCAGTTGAAAATCTGAATTTCCATTGTGGTGAATCTGTTTAAATACCAATTAAATctgattaaaacacattactgATATACTCAAATAGAATACTGGTAGGTTGGTATTCCTTCTGTGTTTGATTTAGTTTGAAATAGATATCCACAACTGGCAGAATGAGTTTTCTGAAgcacagaattatttattttaaatatgatcgAGATAAAAGCGCCattccaataattcagtttttccAAAAAACTTTACATTAAGGTGTCATTAATACTTTCATTGGTAAATAATTTATAAgatataaattatcaataaacctttataagatatgatgtatcttttatatttaacacaaatGAAACTGGATAGTGATATGCAAGCTACcaaaacatgattttgtttaaaatctttattataaatgataaaccatatattttaaaggtttattggtaatttagaaatgtaattattaatagttcctaactgttttataagcAATTTCCAATCATGTATAAATGACACCTTAATATAAAGATTGACCAACATAACAATGCCAATATTTGGAAAAACTAGTGATTTTATCCATTTGGAGCAAAAGGTTTATCACCATAGATTTATTTGGTTGAGAAAAGCCTTTCTCCCCCTTTTGCCTTTGTTTCCCTTTGGGTCTAGTGTTGGAAACCTAAAATGTAACGAACACACAGGCTGGAAGGATGAGACCAGTTTATTGCCATTTCCCTTTTGTTATACAAAGCTTTTGTAATCATTCTGCTACTAACTATCACAACATAATTTCATGcaatacttatttttcttattctcttttaAGAGTAATAACATAATTTGTGTATCATTTAACGCCGCATGTCAATACAGATactgcattatttttcagaGGGTCAGAGGTTACTTGTGAAAccatggaaaaaacacaaaatgaggAAGTGCttccaaatatattatttcgttggtttctttctttccccaGTGGCAAGCATCACATGTTCACACAAAATGCACTTTCACAAGAATCTACTGTGAGTTCATTGTCATTCCATTAGATATCacagcaaaagaaaatcaatttctTCAGTACTGGGTATGTcagtattaaaaatgaaatttaaattaaaactctcTACCTCATACCTGCTACCACCTGGTAGACTGTAACTAAGTTTAGCTCTTGACCTTAATAACTtaacattaaactgcattattaGAAGCAATGCATATGTTCATATGCAGAATTGTAGATGATTTTCTATAAAAATGTTTCCTATAAAATGTGCAGCTTTAAAGAACCCAATCTGAAGTCTATCCTTTACAAATGTCTgaatttacagtgagggaaaaaagaacctgatc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU163266 True 4357 lncRNA 0.34 2 22654917 22741107
TU163267 False 4141 lncRNA 0.34 2 22729969 22741107

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00001273 map3k2,LOC102792173,LOC107706666 coding downstream 156973 22471226 ~ 22497944 (-)
AMCG00001267 NA coding downstream 511582 22136819 ~ 22143335 (-)
AMCG00001266 atic,pur9,LOC106575709 coding downstream 551824 22085991 ~ 22103093 (-)
AMCG00001262 NA coding downstream 694533 21953204 ~ 21960384 (-)
AMCG00001263 pard3bb,LOC107596552 coding downstream 942998 21707427 ~ 21711919 (-)
AMCG00001281 NA coding upstream 40784 22781891 ~ 22784507 (-)
AMCG00001280 NA coding upstream 63167 22804274 ~ 22823565 (-)
AMCG00001282 ihh,ihha,LOC107688738,LOC107716791 coding upstream 91349 22832456 ~ 22846805 (-)
AMCG00001283 NA coding upstream 199545 22940652 ~ 23010915 (-)
AMCG00001286 NA coding upstream 315584 23056691 ~ 23095610 (-)
G130215 NA non-coding downstream 139505 22502951 ~ 22515412 (-)
G130105 NA non-coding downstream 400763 22253751 ~ 22254154 (-)
G130101 NA non-coding downstream 421152 22233162 ~ 22233765 (-)
G130033 NA non-coding downstream 570420 22001727 ~ 22084497 (-)
G130055 NA non-coding downstream 571999 22079082 ~ 22082918 (-)
G130276 NA non-coding upstream 55527 22796634 ~ 22823118 (-)
G130278 NA non-coding upstream 118290 22859397 ~ 22859676 (-)
G130351 NA non-coding upstream 428709 23169816 ~ 23175342 (-)
G130364 NA non-coding upstream 539101 23280208 ~ 23280419 (-)
G130367 NA non-coding upstream 542369 23283476 ~ 23283727 (-)
G130244 NA other downstream 40631 22607142 ~ 22614286 (-)
AMCG00001274 NA other downstream 190041 22451586 ~ 22464876 (-)
AMCG00001270 NA other downstream 352469 22259443 ~ 22302448 (-)
AMCG00001268 NA other downstream 434501 22202046 ~ 22220416 (-)
G130004 NA other downstream 832097 21789208 ~ 21822820 (-)
AMCG00001291 NA other upstream 768724 23509831 ~ 23555714 (-)
G130470 NA other upstream 982285 23723392 ~ 23725279 (-)
AMCG00001306 NA other upstream 1653419 24394526 ~ 24400546 (-)
AMCG00001303 NA other upstream 1663680 24404787 ~ 24419606 (-)
G130622 si:ch211-114n24.6,tuba4a,LOC107387629,LOC107659949,LOC108255233,LOC107659977,LOC107678212 other upstream 1693982 24435089 ~ 24439649 (-)

Expression


Co-expression Network