AMCG00003100


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00003100
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030139.1
NCBI id CM030139.1
chromosome length 23121578
location 11253483 ~ 11272674 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00003100
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K24309 TET2_3; methylcytosine dioxygenase TET2/3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00003100 True 11031 mRNA 0.39 11 11253483 11272674

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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AMCG00003104 ccar1,LOC107708455,LOC107747452,LOC107582549 coding downstream 29050 11207473 ~ 11224433 (-)
AMCG00003097 NA coding downstream 78452 11170540 ~ 11175031 (-)
AMCG00003106 hnrnph3,LOC108438202 coding downstream 86581 11138197 ~ 11166902 (-)
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AMCG00003101 NA coding upstream 166691 11439365 ~ 11455653 (-)
AMCG00003103 fam21c coding upstream 183566 11456240 ~ 11478384 (-)
AMCG00003105 hells coding upstream 279017 11551691 ~ 11562305 (-)
AMCG00003114 gbf1 coding upstream 526981 11799655 ~ 11802872 (-)
G140588 NA non-coding downstream 145879 11107396 ~ 11107604 (-)
G140567 NA non-coding downstream 216172 11011138 ~ 11037311 (-)
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G140537 NA non-coding downstream 323511 10926118 ~ 10929972 (-)
G140521 NA non-coding downstream 434324 10818769 ~ 10819159 (-)
G140704 NA non-coding upstream 59755 11332429 ~ 11333684 (-)
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G140756 NA non-coding upstream 352751 11625425 ~ 11626381 (-)
G140764 NA non-coding upstream 513740 11786414 ~ 11789926 (-)
G140763 LOC106513751,LOC103376442,LOC107375490 non-coding upstream 523302 11795976 ~ 11797014 (-)
AMCG00003049 NA other downstream 922111 10301800 ~ 10331372 (-)
AMCG00003017 NA other downstream 1646167 9596943 ~ 9607316 (-)
G140015 NA other downstream 2015753 9236658 ~ 9237730 (-)
G140006 NA other downstream 2405643 8847032 ~ 8847840 (-)
G139933 LOC108443181 other downstream 2758887 8485361 ~ 8494596 (-)
AMCG00003110 LOC107699307,LOC108442385,LOC108263686,LOC107727357,LOC105890865,LOC104955882 other upstream 335789 11608463 ~ 11622649 (-)
G140758 NA other upstream 368142 11640816 ~ 11647619 (-)
G140757 NA other upstream 421332 11694006 ~ 11733762 (-)
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AMCG00003144 NA other upstream 1578347 12851021 ~ 12855341 (-)

Expression


Co-expression Network