G8370


Basic Information

Item Value
gene id G8370
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030121.1
NCBI id CM030121.1
chromosome length 57050121
location 50127772 ~ 50135731 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU10333
ggcattgttttctttcaaaatgacagtaaaaaacaagagaaaacaaaaatgcaagcATCAGTTCACAAGTACATCTTAATTTACacacatttgcaaaaacaaaccgaaaatataaaaaaatcataattaatgGATTGAATGTTTTAACAGTCTTTTACACAGGTACCACTGGTTAGAagagatctttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacttgtgggGGGTTAGAAGAGAGGAGTTGAGATGTAATGTATAGCTtgtggtgtgtatgtgttgggGGCGGGGTATGAGAATAAACTGCAgatcaaaatattacatttaaatgtgttcattttttcattgctttacttctatttgtttatttaagtttaagTCAATGAAATTCTACTAATCATTATATGGTGTCAATAGAATTGTATGTGGTATCAGGtagtcagaattaagcatataaaataaactaaccccccttttgtttatttaggtctggatttaaaaaaaaaatgccaatcgcaaagcaaaaacacagaatGTAACGGCTGCATTTTATTTCGTACAGACATCCTGCTTCTTTCCAATGGAAACCCatgatcaaatgcatttttttattttgttttatgtgattAGCCTCTGTGTCAAAGTCAGTTTAATCTGAATGTCATTTATGAGCCGGACTGAATGGCAAAGAACAGGGGGTCAAGTGGTAAGATTGGTACAATTCGCACCTctacctctgtctctctgacccCCTCTTTTCCTGAATTGAACAGTTccacacaaaaagaaagaatgaaaaaggcaCAGTTTTACTCTTTTCTATAGTCTTACCTCCCACTATCCATTTTTCTTTCCTCACACACATTGTGTTTCCTGAATTCAATATGTCACAGTCAAACCTCGCTCTGTGAATATGTATAGACCATACAAACACTGTTCTGGGTCAGGTGTAGTAATGGAGAAGAGATTGTCACTTCCTTTTCTCGCCTTATCGGAAACTTTCCAAGGCAACCCCACTGGtagcttttgttatttgttCTAGGGCTTAGCGTCCCAAAATGTATCAGTTTATCAGACTACTGACCTTGACAGCTGAATCCAATGCCCTGTATTTCAGTGAACCACTCCGGTTTAGGTCTGTTATATAACAGACGAGGCTTGACTGAAAGACACACTAATAGTCAGGTGAGTAGTTTTGTGCTTTTGGAagtatttgttaaaaacaagATTCAATGAATAAAAGTCAACAGTAGTATAAACGAAAAAgccatctctctttctttaaaCACACTTTCATGTAGACTGTGTATCCAAAAGGCTTCTAATTCCCCATTTCTTTCAAGTTGTGAACTCAATTATTTCTATACTGCAGTATAGTTTTCTTTCCAAGtagtgtatttaatgttattgcaAACATGATATTGGCTCTTGGTTGTCTCCCAAACTGGAGCCCAGGGCACTACCTCTGAGCCCACGAGCACAATGCAGCCCGGCACCCAAAGACAGGCGCAGGAATCATTCTGCTCGGCAGTCAAAACCTCAGTcataaaaatgcaacatttcatCTCAAGATTAACTCTAGTTTTGGGTTGAAGCCCGttctcttaaaacaaaaacaaataaaaatatttcagtgctaCTAATCTCtcaacaaaacataattattgaagaacaaaaaaagtgtgACATCCCGCAATCCGAAGGTATTCTAGAATACGATGCTATCTTTTTGACGAACAAGGCTCAAACTTGTCTTTTTAAGCTGAGCCACTACTTATTCTAGACttttacagtataaatatttacaaacattaCAAGCTTGACAGTAGTCCATAGCAATAACTGACATATTTGCGCTGATTTTAAGGATTCGCCTCAGTGGCGCAGTAACAGCATAGAAGAACACTTTTGTGGTCGACTAGGGGTCCTTGTCTGCAAAACAACTTCCTCCAGAGacccttaaacacacacaactctGTGCTGTGGAGAACTTAATTTCTCCCTCACTTTCTTCTGGACTTCTTGTTTCGATATTTAGTTTTCTGTCTCTTCCTGTTAATGCCAGAAGAGCTGACACAGTGGAACTGAGAGACCAGGTGACTCGGACAAAAGCCAATCAGTAAAAGGTTACATAGAAATTTAAAGCTGTCTCGACAGGTTTGGGCTTGGTGgatgtatttttccattaatttcccAACTTTTATGGCAGTACCTCTTGTGCCATGGTTTTTCCAACCTATCCAACAGCTGCCATGCATTGGCGCTTGGAGTCCCACAAAGCTGAGCTGCTTTACAGTTTGCTCCAATAGGTCAAATTACATGGGAGCGAATATCGTCCACACTGACACAGCCCTTTACGGTCTCTGGGGTACCCCAAACTAATTTCACctgaatatatttcacatttctccGCATGCTGGGGATACCTAGAGagtctttcttttcattcatcCGTGAATTAaccaggatttaaaaaaacaaaaaacaaccaccaaaaaAACTGACAAGTAGTCAAGACGTCTCTTAAAACAACAATGAACATTCAGAGATCATGTTCCCGACATTATGAAGGCATTCACTGGGTGATGAGTTGCCACTTCAATATTTGCTTCTCTGTTCATCAAAACCAAAAGAGAACGTTTGCAAATAATCTATTACAGCaaattgtatatgtgtgtagaTTGTATGTAATGTGTGCTTCCACTTTAGGGAGCCCAGTAAAGATACATTAGCGTGTACTGGAGCTAAAAGGTTTTGTGTTGATTATGCATCAAGAAGGATGAATAGGAGGGTGGGAAGGTTCCCCTAAATCTTCACagataaggaaaataaaaactgccaaGCTAGGCTGGGAAAGCAGACATCGCAGGTTCCTCAGGGAAAactgcttgttttgtttattaaaccaACACACTGCAAGCAAACGCAGATGCGTCAAGTAGCCTCCTGCTGGTTGCTATATTCACACATGGATTTCCAAATTAAGAGTATTTTCCAAGCCCCCATGCAAAAGACTTTTGTTACAGTAATGATGcattaaatacaacaaaagtGGTGGGGTTGTGGACGGTATATTTATGCCAAATCCTCATACAATTTTGTTAATAACTAAATACAGTAAAGACATTGTGTCATGGCCAAGCTACGTGATTAAATGTCAAGTAAAAAGGAGCTGGTTTTGCAAGATGTCTTTAAGCAGTTTCTTCATCTGGGGCATCTATGCGTGTTTGGTAAAAGGCACTGTGTCTCCAGTCATGTCTTCAGTGTGGGGAGTTGGCGACGGTCAGTCCCATTGGGGCGCACAGTGTTTATTGTTAATCAGCTCACTGCGAAGGAGGGTCAGGTTGCTGGGATAGTAGAGCAGTAGTCGGTAGGATATGAACATGGAGGACGATTATCAAGGCAGGCAGGTGGGATTTTGTGACAAACCTGTCTTTTCCATTCGTTATCGTATCTCAACTACTCAAAAACTGtgtctgtaaaataattgtatgagCAGGTGAAAGCGaactaaaccaaaaaagtaacaaattTAGAAAATCTGCCACGACTAAAGTTATTGTTGGGAGTCTTTTAAACTTTTTCTTGaaaggttattttaaataactaaatatatatatatatatatatattttttttttttttttcataagaacaacaaaaaaatcatcatcACTTATACTTATTGCCAGGAATGGCACTTGAGCTGAAAAGGGGGGGATGACATATTCAAACAATCTATTTTCCCTGTCTAGGATAGTATTTCAGTAGTTCTTCTCTGACAATGGCCAATATAAGCCTCATAATTTAAATCTTGGAAGTGGACTAGGCAGGGttgtgaatatatttacaaaagctCAGTCTTGATCTCGATTTGCTGACAGGTATCACAAAATCACACCTTGCGCACGGCCTGAGGTACAGAAAGAGCCACATTCGGTTTCCTTACAGCTCTTCTCTTCCTGGTCTCAGTTCCGCAGGTCGATGTACTTCTCACACTTTACTcTGGTTATTAGGCGGTTTCTTGTCACCATTGACTCCCTGCAGCAGCCCAGCCTGCTCGTTTGACTTTTCTGCCTTCAGCTCCACGACGATGTCATCTTTACTGGCCTTCTCCTTCGTTCTGAGGAGACAAATCAAGCGGTGTCATTGCCAGGCCTGCCTGAATGTCTCCGTAGTTGGTTTTATCAACTGCTTcgtgtgaaatgtgtttttagcaGGGGATAATCAAAAAATTGTGTATCGGCTGCATGTTATCTTCTGTGGCTATGACTTGTGGGATTTGTCTTCATGCTGGCCAATGAAGCGTGATTAATGAATGCAGTAGCGGATAAGTTGACACTCACAAATCCTGCTTCCCCGAGCGGCCACAGGGGATCTTGCCCTTCTTGTACAGGAAGTAGAGCACACTGCCCAAGATGGCAAGGAGAAGGATGCACACAATGATGACCACGATGATGACGCCATTACCCTCTAGAAAAGCAAAGACAACAGAGGTTAGTTTTGTGTATCTGTATCAACTGCTCACCGTGTGCTGCAGATGCCGATATTGTGGAAGACATTGTACGaactttgaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatggatatatatatatatatatatatggatttttatataaaaatccaGTCTATAAGAATTGGATTTCTGTTTCCTTGGTATATTAGAGTTTTGAGTGTTGAACATATTGTTTGCCTCTCCGCTCTGTACTTGTAGTTAAAACTAGTCATgagcaattgtgtttttttttttttactggtttGAAAATAATGGCGTAATTGAATCTGTGAAGCAGGTGGGCTGTTTTGGTCTTAATTCACTAAACTGAACAGCAGGGATTCAGATAAATACAAGCAGCCAAGCTTTGAAAACCACATCAGTCAGACAGAAGTGAGCACTGAAGCGGCAGATCGGTGCGCCTGTGTCTGACAGTCTCTAATCTCTGTTGAAGGCTCGCTCACTCTGAGCACCAC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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU10333 True 7491 lncRNA 0.39 3 50127772 50135731

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00004456 c1qtnf5 coding downstream 79698 50042259 ~ 50048074 (-)
AMCG00004447 NA coding downstream 286252 49839535 ~ 49841520 (-)
AMCG00004445 NA coding downstream 294032 49831199 ~ 49833740 (-)
AMCG00004446 NA coding downstream 304862 49820555 ~ 49822910 (-)
AMCG00004444 NA coding downstream 331588 49775924 ~ 49796184 (-)
AMCG00004460 cbl coding upstream 8979 50144710 ~ 50157745 (-)
AMCG00004461 cbl,LOC102793573 coding upstream 34345 50170076 ~ 50182056 (-)
AMCG00004465 NA coding upstream 52961 50188692 ~ 50197647 (-)
AMCG00004466 NA coding upstream 95543 50231274 ~ 50234343 (-)
AMCG00004470 NA coding upstream 146014 50281745 ~ 50285988 (-)
G8350 NA non-coding downstream 89417 50033396 ~ 50038355 (-)
G8347 NA non-coding downstream 107748 50019824 ~ 50020024 (-)
G8346 NA non-coding downstream 111987 50015539 ~ 50015785 (-)
G8345 NA non-coding downstream 113020 50014390 ~ 50014752 (-)
G8343 LOC107718271,LOC107690455,LOC107585544 non-coding downstream 114391 50013144 ~ 50013381 (-)
G8500 NA non-coding upstream 533215 50668946 ~ 50674553 (-)
G8505 NA non-coding upstream 545899 50681630 ~ 50681962 (-)
G8524 NA non-coding upstream 558843 50694574 ~ 50694803 (-)
G8541 NA non-coding upstream 585448 50721179 ~ 50722312 (-)
G8550 NA non-coding upstream 613287 50749018 ~ 50752724 (-)
AMCG00004457 rnf26 other downstream 55831 50066398 ~ 50071941 (-)
G8340 NA other downstream 119078 50005132 ~ 50008694 (-)
G8310 NA other downstream 178180 49948861 ~ 49949592 (-)
AMCG00004429 NA other downstream 702590 49411207 ~ 49425182 (-)
AMCG00004420 NA other downstream 1142461 48940024 ~ 48985311 (-)
AMCG00004467 trappc4,LOC106612982,LOC107561742 other upstream 74252 50209983 ~ 50225826 (-)
G8501 NA other upstream 535335 50671066 ~ 50673375 (-)
AMCG00004480 LOC107565095,LOC104942062,LOC107576893 other upstream 575108 50710839 ~ 50720925 (-)
G8542 foxred1 other upstream 588136 50723867 ~ 50725353 (-)
AMCG00004481 NA other upstream 595232 50730963 ~ 50738516 (-)

Expression


Co-expression Network