G6437


Basic Information

Item Value
gene id G6437
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030121.1
NCBI id CM030121.1
chromosome length 57050121
location 37315636 ~ 37318149 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU7887
GGTAACACTATTGTGCCTGTATAAATCCTAAAATACAAGTGttaacatatataaaatatagtaaaggcTTGAGATAATTATACTGTCTACTAATACTTTTTTAggtagaaacaaaaacacactcgCTCCTTTGTCCTTCAgataatgtgaaatgttttttcagagCATCCAAAATAAGTGTATTTTCCTGAATATAAGTCCAACAcccccaaaagaaaaagaaaataacaaaagactCATCAgtggtttataaaataaacataaatatttgagTTTGATTGGTGAAACCACTCCTTTTTGAATAGATTATTTTGCCTTACAATTTCAGTCCTCAAGGAGAAAAAGGGCTCTGCCAAATTGGCGCTGGCATGTTAACCACAGTCATCAGTTACTTCACATATACTCAATACAATGCTTTATatcctttttagttttttctaaagCTGGTAATTCTGCAGGTTTGCTTAACTAATCTATAAATCTTTCATGCTATTCTGCCCATTCAGAGCCTAATCTTTTCTGAGCCGGTACATTTTCATGAGAAATGAGAATCTTGTGAAATCCACTAGTCTAATAATTGGGATAtaatgcaccccccccccataaaataaactacattgcCAGATAAAAGCAAACCAAGGCAGTTCTAGGGTTATAACCTTTGTGGGAAAAGTTGATAATTTGTTTAAAGGCATTTAGAGGATAACTACTGATAATCTAGGCCATCCTTGTACATGGAgtttataataaacaatattgagAGAGAAGGGTTTTTGACTGCCAGTGACATTGTAAGTatacacaataatgtgttttgttttgttatgattttgacactatatgaaatgtaatggTTAATTATTTTAGGGTGACTGACATTCTCAAGAAAACTGCTTCAAGGGGAAGCCTTAAACATGAACGATTGGTAACATTAGCGCTATATTTGAAATTGGTGTCAAAATTACTTAGATTGGGCAAATCAGTAgttgtgtatgtaaataaaataaagtgattgCTACTGTTGTAGCTTTGTTCATCATATATTGAGATTCAAATGCAGATGGATAGTTTATTTTTGCCTGGGAGGTATGTAAATGGCAACATGCAGACAGCCTGTCATGATATACTCTGAATGCACAAACTTAAGTGATGACCCTGATTTGTACCTCCAATTAAATCTGCACTCCATTGACAATGGCAGTGGAAAATGATGGGGACAAAtggaattttaaatgaaaatcagaTATGAAATATGCTACTGTTATTTTCTATGATTATTAGTAACCTAGGTTCAGTCTGGCGGAGTCTATGTGATCATTTTGATAAAGATACATAAAAAGGAATATTGCTTCTTTAGAAATGTACTTTCTATTTCAAGTATCTCCTCTAGgtgcttatttaaaataaccgCAAACCTTCAGGTTATCACCTCCAGGTTTTCAACTAGCTTCTGTCTATGGTTTGGGATTATAGATTGTCTTGTTTTAGACATTTAAGATGGTCTACAACTCAGTGTCATACAGGACTCTTGAGGACATCGGTTTACTGATTACCTTGCAGTGGTGAGATTTGCTGTGAAATTGCAATCAGCTGCAAGATGAATGCTTGTTTGGAAATACTTAGCATTGGAAGGTGAAATAATGATTCTTAGTTGTTTCCATTTGTATGCCTTGGCCTGTTCTGCTGCATTGCTAGCAGTTTAGCTATATAGTTGTTCTGGATACTGGTCTGTGCTGCGTttgttatgaattatgaatgatTGATAAATGATCATCCTTATGTCCTCAGATATCAGCAAGTTTTGTAGGTGCCCCCTTAGTTGTGAACTAATGTGTAGGGGTCATTTCTGTATCCCTGaccttgtgtgtgtgcgcgtgtctGTTTGTGTACTACCATTTCTCTCTCATTATGTTTTCTTCGTAATTAATGTAACTGGAAGTCTCTTTCCATAGTAAGAGTTGAAGCAAATAAAATCCAAAGTAGAAAAAATGGTTTACTAATTTTCTGTAAATTGTGTTCTTTTCTAAAGCTTCTATTTTAAGAGAGATTTCATGGTGCTCATTTTGGTGGGCTGGGTTGTGTGAGAGAGATCTCAAAAGTAGCTGACCGTGTTCACTTTAAAACCAATTTAATGAAGACAATCCTTGCTGATGGCGATTATGCTGTCGTGCTTCCTGACTACATTGCCTTTTTCTTCCTGTTGGAGCAATAAATTACATTCCTATAAACGTCTGTGTTACTTGAACAGTTCCCTTTGTCACACAGTTGATAGTATGATTCAAACCATAAATATATGATGTCACCCAGATAACATTCAAAAGAAGCATAGATTCCTCAGCTTCTCTATATGAATTAAAGGGACCTTGGGCTGAAAAACATTCCATTTTATAATGTAAGTGATAGATTATTGTGACGCAATACACATTTAACATCTATCCCCAATGATTGTGTTTACAAGTGCTGTAAAATTGca
>TU7888
GGTAACACTATTGTGCCTGTATAAATCCTAAAATACAAGTGttaacatatataaaatatagtaaaggcTTGAGATAATTATACTGTCTACTAATACTTTTTTAggtagaaacaaaaacacactcgCTCCTTTGTCCTTCAgataatgtgaaatgttttttcagagCATCCAAAATAAGTGTATTTTCCTGAATATAAGTCCAACAcccccaaaagaaaaagaaaataacaaaagactCATCAgtggtttataaaataaacataaatatttgagTTTGATTGGTGAAACCACTCCTTTTTGAATAGATTATTTTGCCTTACAATTTCAGTCCTCAAGGAGAAAAAGGGCTCTGCCAAATTGGCGCTGGCATGTTAACCACAGTCATCAGTTACTTCACATATACTCAATACAATGCTTTATatcctttttagttttttctaaagCTGGTAATTCTGCAGGTTTGCTTAACTAATCTATAAATCTTTCATGCTATTCTGCCCATTCAGAGCCTAATCTTTTCTGAGCCGGTACATTTTCATGAGAAATGAGAATCTTGTGAAATCCACTAGTCTAATAATTGGGATAtaatgcaccccccccccataaaataaactacattgcCAGATAAAAGCAAACCAAGGCAGTTCTAGGGTTATAACCTTTGTGGGAAAAGTTGATAATTTGTTTAAAGGCATTTAGAGGATAACTACTGATAATCTAGGCCATCCTTGTACATGGAgtttataataaacaatattgagAGAGAAGGGTTTTTGACTGCCAGTGACATTGTAAGTatacacaataatgtgttttgttttgttatgattttgacactatatgaaatgtaatggTTAATTATTTTAGGGTGACTGACATTCTCAAGAAAACTGCTTCAAGGGGAAGCCTTAAACATGAACGATTGGTAACATTAGCGCTATATTTGAAATTGGTGTCAAAATTACTTAGATTGGGCAAATCAGTAgttgtgtatgtaaataaaataaagtgattgCTACTGTTGTAGCTTTGTTCATCATATATTGAGATTCAAATGCAGATGGATAGTTTATTTTTGCCTGGGAGGTATGTAAATGGCAACATGCAGACAGCCTGTCATGATATACTCTGAATGCACAAACTTAAGTGATGACCCTGATTTGTACCTCCAATTAAATCTGCACTCCATTGACAATGGCAGTGGAAAATGATGGGGACAAAtggaattttaaatgaaaatcagaTATGAAATATGCTACTGTTATTTTCTATGATTATTAGTAACCTAGGTTCAGTCTGGCGGAGTCTATGTGATCATTTTGATAAAGATACATAAAAAGGAATATTGCTTCTTTAGAAATGTACTTTCTATTTCAAGTATCTCCTCTAGgtgcttatttaaaataaccgCAAACCTTCAGGTTATCACCTCCAGGTTTTCAACTAGCTTCTGTCTATGGTTTGGGATTATAGATTGTCTTGTTTTAGACATTTAAGATGGTCTACAACTCAGTGTCATACAGGACTCTTGAGGACATCGGTTTACTGATTACCTTGCAGTGGTGAGATTTGCTGTGAAATTGCAATCAGCTGCAAGATGAATGCTTGTTTGGAAATACTTAGCATTGGAAGGTGAAATAATGATTCTTAGTTGTTTCCATTTGTATGCCTTGGCCTGTTCTGCTGCATTGCTAGCAGTTTAGCTATATAGTTGTTCTGGATACTGGTCTGTGCTGCGTttgttatgaattatgaatgatTGATAAATGATCATCCTTATGTCCTCAGATATCAGCAAGTTTTGTAGGTGCCCCCTTAGTTGTGAACTAATGTGTAGGGGTCATTTCTGTATCCCTGaccttgtgtgtgtgcgcgtgtctGTTTGTGTACTACCATTTCTCTCTCATTATGTTTTCTTCGTAATTAATGTAACTGGAAGTCTCTTTCCATAGTAAGAGTTGAAGCAAATAAAATCCAAAGTAGAAAAAATGGTTTACTAATTTTCTGTAAATTGTGTTCTTTTCTAAAGCTTCTATTTTAAGAGAGATTTCATGGTGCTCATTTTGGTGGGCTGGGTTGTGTGAGAGAGATCTCAAAAGTAGCTGACCGTGTTCACTTTAAAACCAATTTAATGAAGACAATCCTTGCTGATGGCGATTATGCTGTCGTGCTTCCTGACTACATTGCCTTTTTCTTCCTGTTGGAGCAATAAATTACATTCCTATAAACGTCTGTGTTACTTGAACAGTTCCCTTTGTCACACAGTTGATAGTATGATTCAAACCATAAATATATGATGTCACCCAGATAACATTCAAAAGAAGCATAGATTCCTCAGCTTCTCTATATGAATTAAAGGGACCTTGGGCTGAAAAACATTCCATTTTATAATGTAAGTGATAGATTATTGTGACGCAATACACATTTAACATCTATCCCCAATGATTGTGTTTACAAGTGCTGTAAAATTGcatgaattattgttttcaaaacaaataaatcttgGATTTATGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU7887 False 2473 lncRNA 0.35 1 37315677 37318149
TU7888 True 2514 lncRNA 0.36 1 37315636 37318149

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00004204 NA coding downstream 27301 37278386 ~ 37288335 (-)
AMCG00004196 cnih3,LOC107553421,LOC106607867,LOC107601529,LOC107732540 coding downstream 262863 37050001 ~ 37052773 (-)
AMCG00004195 NA coding downstream 309685 36971391 ~ 37005951 (-)
AMCG00004194 NA coding downstream 354934 36921065 ~ 36960702 (-)
AMCG00004184 LOC102789059 coding downstream 594150 36697723 ~ 36721486 (-)
AMCG00004202 NA coding upstream 168808 37486957 ~ 37512998 (-)
AMCG00004201 NA coding upstream 206630 37524779 ~ 37528763 (-)
AMCG00004200 NA coding upstream 228226 37546375 ~ 37555523 (-)
AMCG00004207 vsnl1,LOC105894450,LOC103457788,LOC103023468,LOC103027217,LOC108440966 coding upstream 289872 37608021 ~ 37632390 (-)
AMCG00004211 NA coding upstream 644128 37962277 ~ 37978111 (-)
G6384 NA non-coding downstream 287392 37028028 ~ 37028244 (-)
G6374 NA non-coding downstream 394780 36912238 ~ 36920856 (-)
G6326 NA non-coding downstream 534945 36780478 ~ 36780691 (-)
G6309 NA non-coding downstream 549827 36765572 ~ 36765809 (-)
G6243 NA non-coding downstream 758305 36556106 ~ 36557331 (-)
G6445 tnfrsf21,LOC102783898 non-coding upstream 94540 37412689 ~ 37416547 (-)
G6462 NA non-coding upstream 180049 37498198 ~ 37498446 (-)
G6491 sf3b6,SF3B6,pm14 non-coding upstream 249182 37567331 ~ 37569793 (-)
G6574 NA non-coding upstream 936860 38255009 ~ 38255371 (-)
G6588 NA non-coding upstream 1148264 38466413 ~ 38466664 (-)
AMCG00004188 srp9,LOC107553440,LOC107601484 other downstream 528514 36783743 ~ 36787122 (-)
AMCG00004189 NA other downstream 536574 36769048 ~ 36779062 (-)
AMCG00004178 NA other downstream 774795 36495772 ~ 36540841 (-)
AMCG00004143 mut,LOC107726528,LOC107697172,LOC107726757 other downstream 1901190 35344663 ~ 35414446 (-)
AMCG00004132 NA other downstream 2351751 34954706 ~ 34963885 (-)
AMCG00004203 NA other upstream 5861 37324010 ~ 37381953 (-)
G6441 NA other upstream 49836 37367985 ~ 37368822 (-)
G6792 hs90b,hsp90bb,hsp90ab1 other upstream 2523786 39841935 ~ 39849123 (-)
AMCG00004302 NA other upstream 4746840 42064989 ~ 42067664 (-)
AMCG00004313 NA other upstream 5058577 42376726 ~ 42531006 (-)

Expression


Co-expression Network