AMCG00006579 (yaf2,LOC108439407,LOC105018284,LOC106573089,LOC106561625)
Chromosome Information
Item |
Value |
chromosome id |
CM030134.1 |
NCBI id |
CM030134.1
|
chromosome length |
29342575 |
location |
10087275 ~ 10107285 (-) |
genome version |
AmiCal1_2021_bowfin_Genome |
Sequence
>AMCG00006579
acaGGAAACCTCGTCCAGTTTCCCAGTTGGTTGCACAGCAAGTAACCCAGCAGTTTGCTTCCCCAACACAaccaaagaaagagaaaaaagataaaacagaaaaagaaaaaaatgaaaaggaaaccaCACTCAAAAAGAACAGTCACAAGAAAATGAGGCCAAGATTAAAAAACGTGGACAGGAGCAGCGCCCAACACTTGGAAGTCACAGTAGGAGACCTGACTGTTATTATCACAGACTTTAAGGAGAAAGCAAAGTCAACACCAACTTCCAGCGCTACATCTGCCGACCAGCACAGTCAAAGCGGCTCTAGTTCCGACAACACTGAAAGAGGGATCTCCCGGTCGTCCTCGCCGCGGGGAGAAGGATCGTCAGTGAATGGAGAATCCCACTAAAACCTCGCGCCCCGGTCCCTGCCCCCAGCCCCCTGCTTCCCCGTCCCTGAGATTTATTTAGTctgttttgaacatgcaaatGTTGTAAAACCTACACCAAGATATACAAGTCCAGATTTCAGCCAGGATACACCACATTTTCATGGCATACAGACATGGTGGTTTACATTGTGGAAGCCTTCCAGAATGTTCTCGGCACTGATCGGTAGATTGTCCTCAAAGAGATGTGGAACATTGAGTGCACTTTTAAAGTAAATACTGTAATGTTACTTCACCCTTGCTGCTTATtcagtgaaaaatgaaaatctgtccCATGTTCCCAAAACGTACAGACTTTTCCAGGTCCATGTAAATGTGGTAGTATTTTACATCGAATCAGTGTTACATTGTCAATATACACttaatttcattcatttctttccctttccaCCGTGGACTCTATATTGTGGCATGAATTGGGTAAAAGTTTTAAGGAAGTATTTCAGATTTGCCGAATATGCATTACAGGAGAAAATGTGAAGCAGCTATCTGTAAGTGTACAGTGACATTGATCAATCAAATTAACTGTAATAGCAAGagcttttttttctcagtgGCTTAATGCACCTGCTGGTACTTGGTGTGGTATAATGGGAAattgttctttaaaaacagaaaagagaaaaaaaaaaaaaaaaactttaaaacacatttgtatacaGTTTTGCCAACGTTTTACAGCACATGTTATTCTAATAGATCATATCACTGTTATGTTGCTGGTTTTACCAAACTGTGCTGTTATATGTATATGAACATCTCagttaattacattgttttactgTCAGAACAAAAATTTATAAGTAAAAGAATGAAATGATGAATTAATTGTTTAGAGATTGATCTATCTTGATCTGCTtctcattcattttatattatagatGCTAGCTTGTCATTATTTACAGTGGTTTATATTATAGACatgatcacaaaataaaattaaaattatagactccTTAGTAAAATGCATCCTAAATATGGAGTTATTACGGTGtctactttattttttccatggtTGGTTAAAATTGGGAGTGAAGCACTAACAGATTTGGGAGGGTGGTCAAGGTCTTCATTATTCAGTGTGTTTACAAAGCAAAGCAAGTTGCTGCATTGATAGGAATGTATTAAATGCTGTCATGTTACTTTtgtgaaacaatttaaaaagacttgTGAGTACTGAATAGAAACTAATGATTTATATTCTAGTTTCAGTTTAATAATGATTCATTTGGATATTTAGGTATATTGCAATTTAAGTGACTGTTATTGAGGGCAATGATGAAatggaagatttatttttctcaaagcTGAAGAAAACTTTAAGGTATCATTAAcctgtatattattttcaagTAACATGACTTAAATTAACAAGTAGTGGTCAGCAGAGGTGGAGTGAAATAAATAGTGCTCAGACATTACTATTGCAAAcctaaaagaataaaataaaaaataaaaaacttattTCATAAGTATCTATTTAAatgaggaataaaataaatgataatggaatgtgattaaaaaataataaaaaagacaa
>TU138641
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Function
symbol |
description |
yaf2
|
Predicted to enable DNA binding activity and transcription coregulator activity. Acts upstream of or within forebrain development and negative regulation of apoptotic process. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in forebrain; head; and midbrain. Orthologous to human YAF2 (YY1 associated factor 2).
|
NR:
description |
PREDICTED: YY1-associated factor 2 isoform X1 |
GO: NA
KEGG: NA
RNA
RNA id |
representative |
length |
rna type |
GC content |
exon number |
start site |
end site |
AMCG00006579 |
False |
1974 |
mRNA |
0.35 |
2 |
10087275 |
10089638 |
TU138641 |
True |
2935 |
TUCP |
0.43 |
3 |
10087278 |
10107285 |
Neighbor
Expression