AMCG00007645


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00007645
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 24484012 ~ 24495209 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00007645
agtttaccacttacctttgtaccatttcaggttattcactggacttgaactgcttaaatgtcaataaaaactggaaaaatgggggtgttctaaaacttgtgaccggtagtgtatatctGAAAAACATAGGCCTGCGAAGTTCAGCCTGTTGGATTGCTGTCTCTATCAGTGTTTCAGGCATGACACATGTTCTCCCAGATGCCATATTCATTCCAACTACAACATGGTCATTCCCTGCCCACAGTGTATAGGATAAGTTAATGCATAACTCGCTCCAGTTTCCCAGGGACAGAATAAGCACTTCTCACAGCTCGTCAGAGCTCCACACCATACTGCTATTATGACCAGTCTAGGTTGCTGACTGACTCTTGGCCACTTTGTGCCCTGCTCTTTCTTCTTGGCTTAATTTCTCAGTATTCTCATCACTTGTGAACAGTTATTTTGATAAATGATTTCATTATTCAGGCATGCATgcagaacacatttatttaactttcaaaCTGTGTGTTTAAACACAACATTTGTGAATTCAGTAATATTGGCTGAGATTTGTTTCAATGACCACGTTCCGCAGTGGTTTATTTCTTAGTGTTTTGACCATTACATCAATTGCATCACATGCaaattgtttattgaaaatCTAAATGAACACAGAACAGGAACAATGCTGAATAGAAGGCGTTTGCTTTGTTGAGGAGCATCATGCTTCTGATCTTTCATAAAGGATAGTCTTTGTGTGGAGAGATGAATTGCACCCTTCATCCAGAGCAGGCCTTTGTTGATCCCTGGGCCTAGGGCATCCATTTGGGCTCAGGGTTTATTGTGAGGGCCTCTAGCCTCCTTGATTTTACAGATTGACAGGGGCACTCCAAGAAACATTAAATCTGATAAGGACTCTGAACAGTATGATCTAGAAACAGCTTGACTGGTAACGCCTGCTCATCACATGGCTGGGTGCTTCATGGCagcattctttttatttttcaggtcaATAATTAACTATTCAATGAGATGCAGAGTTTATAGTTGGTCTGAAAAAGCTGTTTCCATATTGTTCTCATCAGATACAGTCCACtacagtattatttttagaCCTGTCAGGAAAAGCACTACAGAGTTTTATAGCCTGACCTTGCTGTGTATTGATTTCAGTATATCCAGTATTCAGTATAGCCTCTGCATCCTACTTGTATCATGTAGTATTGATCCACATTTTGGAAAGTGTTTACCCATCGAATCAATAGCAGTTTGTCATTGTTTGCCTCCCTTGAAAATTATGTTACAGATCAGTAGGTAAGGCCATGCATAGCCCTGGAGCCCACAGTCAGATTGCAATGGGAAGTCTGGTCTCCCAGTCAGTGTGTTCGCTCTGTAATCACCTTCTGTTGCCTCTTTCCCTGGTACTGAAAACACAGGAATATTCCTGTCTGATGGGTTGGGAGATTATTAACGCAGCCACTTATTCCCAACTGTTTTTGTATAGGACAGCCTAAAGGCCTTTTGCAAGTTGTACACTTTTTAGTACTGGAATAATCCTCTCACAAAAATGCTGGTCTAACCATAATTAAACACTCTGAATACCTTTACAAGTATGGTGTTTGAGTCAGTGtttgaggggagggagggatgtTTGGATTGAGATCGGTGACCAATCCTCTTATTTGTAAGCAGAATGGCAGCGAACAGGCACTGGTGTTGATGCACAATGACTGGTTGTCAGATTACTAAACATGAGTGTCTCAAGGAAGTTTAAAGTTGAAGAGCCTTAAAAAAGATacctatttaaaaatgcaataaactctaaaaataaagtatttagcTTCTTTCAAAGTATTAATGGTAGTATGTAGGATTGAGGTAGTATTTGGTTAACTGTAATTACAgcctcaattaaaaaaaaaatatatatatatattaagtatacattttgtgGTGTGGGATATTAAAACGTAGAGATGGAAataatctttcattttaataaataagctTAACATAGTTATGAAAcctataaaaacataaattagcaTGTGCTGTCCGATAGGGTATAATTATGCATGGACTACTTGGTAAACAGGCATTTAATGAAGGAATTGCATACTGTGGATATGTCAAATGATTTTTCAaggtgtatatttttgtttgaattgtgtgtaaatatgtacaaaataaataaacctacaATGGCCAGCATTTTCAGTCACCTCTGGTGGCAGTATTCTTTGAAGACAAGTGCGCCTCTTAGTGGAATGATATGGAACTGCAGTGAATATATGCATGaatggttaatttaatttattttaatgtctgctAGATGGATCCATTGAATTTTCTGTTGGGTCATTTAGGGAAATTagaatatatgtaaaataaccatgacaaaatacaaatttgcattttcatacaAGAACATAATTGCTATACTGGGGAGAGGACAACCAACAAGACCTGCTATTAATTACTAGTGATATAAGTATTctaaaaagggaaataaaattgattttggGATGGCACCATGTTTGGGGTAAAGAGGAGCAGCCCTTCTTCTTGTGTCTTAAGTGAAGAGAGGGGTCAGTCTGGGTGATCACTTGACTAGACCTCCCTCTGACAGCTCTGTGGGGGATGGATTCCTGTTAATGTTTTCTGGCTCTGGAGAGACCTCGACTGTGCTGGTGCAGAGGCCTTCATAGCAGATTACACAACCATCTCCCAGCCCTCACGGTGCTACAAACACAGCTGTGCCTGCCCTGCCACTGTCAGTCACCTggagttaaagaaacaaaaacaaaaaggaaaaaaaacatggtgaGATCCACTCATAGGCAGATAAAAGAGAAATCAAAGGCATGCaaaaataagtgtcagaaaCCAGAAGAAAATATCTTCCAATGACATGTTATTTGGCAACCTTTGTTCACATTAATTCTGATAATACACTAGACAGATACTAAATCGTGTGCTGTTTCATGTCGTTTTTGAGTTAAACTTGGCATGGCCTAGTGGTTAAACATGGTATTTTAgagttccttttattttatctccCCTCTCCCACTCCTTGCCCCTAACAGTGGGGCCCCAGTGGAGTAGTTCCACTGCTTGCCGGTTTCTCTGATACATGGAGGATTGCAGCCTGCCTGGTTTATCTGGGCTGTCAGAGCCTTGGTGTGTCATCTGCCCACCTGGCAGCTTCAAAAAATGAGTTGGGATTTGAATTTTTGAATTTTATCCTCCCATCAGCCAGCCCCCACTTCCAATGTGTGTTGACCTTGGCGGGGTTGACAGGGTACTGTGAGGTGGCCTACTTTGAGCATCTGTGGAGCTCCGAGAGACTGCTAGCCCTCCATGTTTGGCAGCACACAGActcccctctgtccctctcccggTGAGCCCACTGTCATCACCTCTGTTAGTTCAGGAAGGCACCTGCAGCAGGCAGGACAGGGGGTAGGGAGGCACACAGTTATAGTATTGTGCGTCTCCAGGCTTCAATCACTCCACTAATTAGACAACAAGCCGGGGGCCGTGATTTAACTTGCACAGCAAGTTCTTGCTGCATCGAACCCACCAGCAGACTGCACCAGCACAACAGCCCTCCAGTTCTCGCTGTCAGTGGCCAGAAACCTTCAGGCTTCAGGCTTCAATGAAAGTCTCTCTTTTGGTGGGTGTTTTCTGTGAGACCCAGTGAGCTCAATTTGAAGCAGATTTCCAAACCTCAGGTAATATCTAGGATTGTGGAGGAGTCTGGATTAGGGTGGATGATGGGAGGAATGTGTGCTAAgagatttgtagtttttattactTCAAAAGTGAGCTGTTACAGAATCTTACTTCTGTTCCTACCTGTTGCAAGAGATCTGCTGAAGCCATCGTCTTTTCATTTCACATAGCTCAAGAATCGGCCTGCTAACCAAGCCAGAGAAAATGCATAACCACCTGCTAAGTGGCAGTCCCCATACCTTTgttgtgtgtacatgtatgtattgtatcCATGGCATGAAAAGTTATCATTGAGTGGTGTGATCATTGGTGATTTCCCTGACGGATGACGGGTAGCACATGCGTGCGACGTTTGTGACCGTGTGCTGGTGTTTATCCCTAGATGTGAACGAGTGTGCAGGGCAACCCTGTAAGAATGGCGGAACCTGTCGCGATCTGGATGGAGATTTTACGTGCAAATGCCCATCACCCTACGTTGGGAAGAACTGTCAATTGCGCTGTATCTCCATGCTGGGGATGGAGGGCGGGGGCATTGCAGAGTCTCAGATCTCGTCCTCCTCGGTGCACTATGGTTTCCTGGGGCTGCAACGCTGGGGACCGGAGCTCGCCAGACTTAACAACAAGGGCATTGTCAACGCCTGGACCTCAGCCACCCATGATAAGAACCCCTGGATAGAGATCAACCTGCAGAGGAAGATGCGTCTCTCTGGGATTATCACGCAGGGTGCCAGTCGCATGGGCACTGCAGAGTACATCAAATCCTTCAAGGTGTTTGTTGGCAACGTGGATAACGATGGCACCAAGACCAACCTGTTTGACCCGCCCATCGTGGCGCAGTACATCCGCATTGTACCGTTGGTGTGTCGGCATGCCTGCACTCTGCGCATGGAGCTTGTGGGCTGTGAGCTAAATGTGTATTTAAACACGGCAGGTTGCTCTGAGCCCCTGGGCATGAAGTCCTATCTGATCTCAGACAGCCAGGTGTCAGCCTCCAGTGCCTTTCGCACATGGGGCATTGATGCCTTCACCTGGCATCCCCACTTCGCCCGCCTTGACAAGCGGGGCAAGACCAACGCCTGGACGGCACTTAGCAACAACCGCTCTGAGTGGCTGCAGGTGGACTTGCAATCTCCAAAACGAGTCACAGCGATCATCACCCAGGGAGCCAAGGACTTTGGGAACGTCCAGTTTGTGTCGGCCTTTAAGCTTGCCTACAGTGATGATGGCCAGTCCTGGACAGTGTATAAAGATGACAAAACCAGAGCGGAGAAAgTGTTCCAGGGCAA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Function

GO:

id name namespace
GO:0007155 cell adhesion biological_process
GO:0005509 calcium ion binding molecular_function

KEGG:

id description
K24464 EDIL3; EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00007645 True 7521 mRNA 0.42 7 24484012 24495209

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00007643 NA coding downstream 4176 24471035 ~ 24479836 (-)
AMCG00007648 NA coding downstream 19665 24463727 ~ 24464347 (-)
AMCG00007644 ppip5k1,LOC105015023 coding downstream 80890 24368631 ~ 24403122 (-)
AMCG00007634 NA coding downstream 227971 24251466 ~ 24256041 (-)
AMCG00007635 iqgap1,LOC106562619,LOC107730269 coding downstream 297122 24150344 ~ 24186890 (-)
AMCG00007647 rlbp1 coding upstream 51323 24546532 ~ 24550224 (-)
AMCG00007642 NA coding upstream 63846 24559055 ~ 24562456 (-)
AMCG00007646 pdia3,LOC107716732,LOC107753598,LOC107696263,LOC107661453 coding upstream 68586 24563795 ~ 24570297 (-)
AMCG00007652 ckmt1,LOC108418758,LOC105913433,LOC106584654,LOC105028550,LOC107661454,LOC107554962,LOC107753597 coding upstream 119291 24614500 ~ 24624473 (-)
AMCG00007651 NA coding upstream 134297 24629506 ~ 24645364 (-)
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G25078 NA non-coding downstream 433939 24049815 ~ 24050073 (-)
G25248 NA non-coding upstream 3156 24498365 ~ 24542158 (-)
G25375 NA non-coding upstream 486725 24981934 ~ 24982139 (-)
G25387 NA non-coding upstream 493636 24988845 ~ 24989054 (-)
G25415 LOC108275329,LOC103046663,LOC108436939,LOC105912564,LOC107696286,LOC103375935,LOC106584709,LOC104942717,LOC107753195 non-coding upstream 712565 25207774 ~ 25247379 (-)
G25421 NA non-coding upstream 757507 25252716 ~ 25256361 (-)
AMCG00007637 NA other downstream 202448 24262690 ~ 24281564 (-)
G25026 NA other downstream 511347 23971671 ~ 23972665 (-)
AMCG00007594 zfand6,zfand5,zfand5a,LOC105015049 other downstream 1063709 23406928 ~ 23420303 (-)
AMCG00007572 LOC107703942,LOC103366351,LOC107665298,LOC107726337 other downstream 1907558 22561496 ~ 22576454 (-)
AMCG00007565 gatm other downstream 2125566 22340599 ~ 22358446 (-)
G25422 NA other upstream 769123 25264332 ~ 25264951 (-)
AMCG00007684 shf,LOC108430988 other upstream 1135583 25630792 ~ 25631592 (-)
AMCG00007687 LOC107703195,LOC107589318,LOC103130145 other upstream 1558555 26053764 ~ 26070848 (-)
AMCG00007704 NA other upstream 2862522 27357731 ~ 27370519 (-)
AMCG00007757 tbc1d2b,LOC107757764,LOC107659498 other upstream 4399484 28894693 ~ 28921123 (-)

Expression


Co-expression Network