AMCG00007696


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00007696
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 27159491 ~ 27179372 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00007696
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TCTAAACAGTACCCAAGAAGCAAAGTCCTTGCTGTAAAAGCCAAAATGCCAAAAATAAAGAGATGAATCATT

Function

GO: NA

KEGG:

id description
K08115 CSPG4; chondroitin sulfate proteoglycan 4

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00007696 True 10072 mRNA 0.41 9 27159491 27179372

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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AMCG00007690 LOC107583870,LOC107742881 coding upstream 1043883 26096726 ~ 26115608 (+)
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AMCG00007685 NA coding upstream 1451353 25698223 ~ 25708138 (+)
AMCG00007698 NA coding downstream 35398 27214770 ~ 27226777 (+)
AMCG00007697 ptpn9,ptpn9a,LOC106573036 coding downstream 56622 27235994 ~ 27253888 (+)
AMCG00007700 sin3a coding downstream 83133 27262505 ~ 27280545 (+)
AMCG00007701 wdr61 coding downstream 138167 27317539 ~ 27324818 (+)
AMCG00007702 NA coding downstream 155553 27334925 ~ 27348351 (+)
G25588 NA non-coding upstream 845926 26313363 ~ 26313565 (+)
G25574 NA non-coding upstream 888771 26262827 ~ 26270720 (+)
G25562 NA non-coding upstream 1017203 26136767 ~ 26142288 (+)
G25561 NA non-coding upstream 1024914 26134361 ~ 26134577 (+)
G25531 NA non-coding upstream 1098245 26053701 ~ 26061246 (+)
G25631 NA non-coding downstream 11797 27191169 ~ 27191379 (+)
G25645 NA non-coding downstream 74729 27254101 ~ 27256998 (+)
G25658 NA non-coding downstream 101285 27280657 ~ 27282110 (+)
G25674 NA non-coding downstream 124476 27303848 ~ 27307066 (+)
G25677 slc25a44,s2544,LOC108438536,LOC108432728,LOC107673271 non-coding downstream 149575 27328947 ~ 27330202 (+)
AMCG00007640 NA other upstream 2659841 24476487 ~ 24499650 (+)
AMCG00007631 NA other upstream 2965010 24192221 ~ 24194481 (+)
AMCG00007604 asb7,LOC107755647,LOC107662256,LOC107742335,LOC106562481,LOC102792420 other upstream 3489412 23657850 ~ 23670079 (+)
G24824 mesdc1,LOC107553753,LOC107691577,LOC107709503,LOC107662264 other upstream 3965970 23189460 ~ 23193521 (+)
AMCG00007585 star5,stard5,LOC104953929 other upstream 4019970 23133811 ~ 23139521 (+)
G25822 NA other downstream 904450 28083822 ~ 28094741 (+)
AMCG00007735 LOC104966693,LOC107388733,LOC105916711,LOC106514397,LOC105007422,LOC106561846 other downstream 1259272 28438644 ~ 28454707 (+)
AMCG00007754 NA other downstream 1502799 28682171 ~ 28700062 (+)
AMCG00007763 tbc1d2b other downstream 1720686 28900058 ~ 28911566 (+)
AMCG00007769 acsbg1 other downstream 1823723 29003095 ~ 29006379 (+)

Expression


Co-expression Network