AMCG00007704


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00007704
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 27357731 ~ 27370519 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00007704
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>TU32249
AAAGGctatcttctctctctcacacacacacacacgtatatatatatatatatatatatatatatatacacacacacacacacacacactctctctctctctctctctctcacacacacactagactTCATGACACCCAGACGCGATTGCCTGTTTTCTTTACCCATGATCCCCTAGCTCTTGGTGTTTAAATAACCTGAAGCAATCATTTAGCCACATTGTAACTGAGCATTGTAACTGACAGTTAAAGTGTTTACAAAATATCCTGGTCCGGAGAGAAGAGACAAAGGCAAACTGGGGATGTTTCAGTGATCCTGACGGTTTTTTTACGGATGGTGAACCGCTCCGTGGAGCTTCTATTAAATAGTCACTGCTTTGGTTGTCAGAAAGGATACAATATACATCTCGATTCCTCCGAAGTGATCATGCTAAATAGTGAAGAAAGTACCTCGTTAATGGGCTCCAAGCTCCACTGCACCAGGCACCAGGCTCCAGGGCCTCTGTGGTGCTCCTGATGCCCCTCACCCACTAGTGAAGATCCCGGGTGGGCGAGGGACTGGCAGGGATCACTCTCTCACTGTGCTCCTACACAAGGATGACAGACTCACAGTAACGCAGGCTGCTCCAGTTAATGGGACGCCACCAGTTCTGTACTTCCAGTACCAGCTGAGCGAGACCCGGGTGTCCTACTGGGAGGCTGTGCTGTCTGGAGGCAGCCTCTTCCTGGAGATTGCAGAGGGGGCATTACCAGAAGGAAGCAAGGAGGGACTGACTGTTCTACTGGAGTTTGCAGAAGAGAAGTTGAAagtcaattatgtttttctgtggttttaCAAAAGCAGAGACGATCGATTGTCTATCACAAAGACTTTCCATTACCTGGGCTTTGAGATTGTGAAACCAGGCCACCCCTCAGTGCCCACCCGGCCAGACATCCTGTTCATGGTCTACTCTCTGGATCAGAGCACTTCAGATGAAGAATGAAGGAATCCACCAGTGCATTGTTCTCCTGCCACCTGGGTCATTGGAACAACCTGTCTCACTGTCCTCTTTACTCGGATATCCAGGCACTGTGCAAATGTAGGCAGCTAAAGGCAAATCTTAGGTGTGAGACATCGTATACTCTTTAACAATATAGCCATGCTAACACGCACAAGGGGGTGATTCGGACCGGATGGCAATCTCATTTATCTTTATTTCCCCTCTGCCCACCTCGGATCTTTTAAATAAGCAGGGTTCTGGCAGACAGAACAGGACACTCTAACTGGGTCATTTGGTGCTAAAAATACTATGTAACCTCCAATACCTTGTGTTGAATGTCAGGGTTCTGggattatatatacagtgggaaGAGAGATGCAGTAATGAGAATCttttatcacatttgtttttagtaaGGGTTaggacattacatttttctcccATTACTGTAGCACTCTTTTTAAGgttctttatttacatttttatatatagttcaaccatattctttttttttttactgaattgtATATCGCATTTTCTAACTACACATGAACATGGACTTTGCACTGGAGATTTGCCTTTATTTGCCAAATCATAAAACAAGGAATTCTGCTGGGATTAGCTAGATTTACTGCAGGGTAAAAAACTAGGAGTTCTGCAGGCTAAATCAGAAGTGAGATGTACGGCTGGGCACTTCTAATCCATTTTCTCCCTGAGCTTAACTCCCACTTCGTCACTAATTACTGCTTTATTGTCTTAATTAGGTTTGATTAATTCGTCAAGGGCATGGAAAGAATTAAGCCCTGtgatgtaatataaataaactagcCAAGACTGTGCAACCTTGAACCCAAATGGTATGTACAATTACGTTCAAATTAACATCCGATTTCAGACAAGTTGCCCAAATATGTACtaggacaaacaaacaagctaAGAACCAAAAGCATAAGTTATAACCATTTAACTTGCAAGATGTTAAGCATTGGGAAGTTTGCTTCAATTTGTCTATATAAAGTAAAGTTGATCACCAGAACCCTACTGATGCTAAAAGCTTTTCTCATTCACTTCAatttcagtgtttacagtgtagaTTTCATGTTCTGTACTCATGGGTTCCAAACTTTAAGACAGAAATCAAACCGGACTGACACAGGAGCACTTAAGGGATTCACCAGCAAAAGGAAATGTGCATTAAACTGCTGGTACAGTAGATATATTAAGTCGTACACAACAGATTGTGGGTTTTCAGCaccttgtttttgtgtttatagttttttttcccccaatgtgTGTAAGCCTCACAACGTTGCCAAAGATCTGGTCTCCCTTACTCTTGGCACTTCAATGCTGAAATCgttaaatgttaacatttaatatgagtgtggttttttttaaatctgtaactAAGCTGATTTCTAAGTGTAAACACTGGCATTCTCTTATTTACCAAATCaactttagaaaaaaaacagaacacagcTATACATTCCCCAACATTATAATCTTTAAGTCAGAAAAGCACAACCAAGTAAAATACAAAGTACTGcgtgtaattgttattattttttgtctgtatgTCTGCAAGAGGCTTAAATTTGCATGGGTGCGGGGGGTGCTTTTAGAGTCCTTAGTGTTTAACTAAGCAGTGTTTATTAGCACTAGTTTCTATTCAGCTTTTCAGAGTTCTATTTTTATGTTACTTTTTTTCTTAGATCTTTGTTTACAGGGAAAAATagacttaaaacataaaaaggcaaTCCATGCTCATATCCTCTTGGATTTTATGTATAttagaaattacaaaataaagtttaagGTTTAACTTCTAAAAACTAA

Function

GO: NA

KEGG:

id description
K16613 OAZ2; ornithine decarboxylase antizyme 2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00007704 True 9283 mRNA 0.39 4 27357735 27370382
TU32249 False 2820 lncRNA 0.40 6 27357731 27370519

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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AMCG00007694 hmg20a,LOC102798875 coding downstream 1085281 26262988 ~ 26272450 (-)
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G25735 NA non-coding upstream 130431 27500950 ~ 27504962 (-)
G25746 NA non-coding upstream 182978 27553497 ~ 27554110 (-)
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AMCG00007687 LOC107703195,LOC107589318,LOC103130145 other downstream 1286883 26053764 ~ 26070848 (-)
AMCG00007684 shf,LOC108430988 other downstream 1726139 25630792 ~ 25631592 (-)
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AMCG00007835 LOC107594750 other upstream 4434380 31804899 ~ 31816151 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G216688 NA non-coding CI01000050 null 6930980 ~ 6931315 (-)