AMCG00007854


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00007854
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030123.1
NCBI id CM030123.1
chromosome length 53548854
location 33763513 ~ 33794941 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00007854
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TTATGGTTTTCCTCGAAAGTATGTTTGATAtcaaaagacagaaaatatctctactataataataataataataataataataata
>TU33593
tatttatgagtttaattttctttatggACAAGTTTGAAATCTATgtaaaacatgagaaaaaaatatataagaccAAAACAAggtcaattaattttaaagctgtaatagctaataaaaggaaaagtcaCTTCTACTGCAATCTCAATCTGAGACAAATTCGTTTATGGTTTTCCTCGAAAGTATGTTTGATAtcaaaagacagaaaatatctctactataataataataataataataataataataataatctactgttattattattattattattattattattattattattattataactcgCATATCGAACCTGCGCCACCCATTCTACAACTCCATCTTCATCCTCCACCCAATCCTCTCCaaacaacttttttattttttagttgtttgAAATTATTAACAAATGCGTATCTGTGTAAGATATTCCTTTACAAATatggtttatattaaaaatgaagaaatactaaacacacacacacaaacacaaaaacgaCTTAAGGACAGGGTCCCCATCCATATCTTATGACTTTATTTCTCACAGGAGACATTGAGCTGCCTGTCGTCGCGTAATTACGAGACGTAACGCTGTTGGTCCCtatcccttgtatttatttatgcaggtTTTTTCAAATAACAAAGCCTTTTCTTTATAGAAACAACAAATTACCATACAACAAATAAAGAGATTTTGTATACACCATTAATTTGCCAATATATAACGTGTGTACATGACTCTTAAGGAAATAGCATTAAATTGAAACATCCAGGGATTGCTTAAATTGActtatatattaacatatagaatatgtattaaacatggaTTGTTTACACAGatttactgttttatatattttttatcgaaaaaaaaaatatatatatatatacgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttcttacaacataaatattgtagttcttcaaacaaatgtattcgtAATTAGTAAACTAATAGTAATACAGCTAAAATTCCTACGGGGAAAATATCAGAATATTTCGTTGTAATGACATGTCATTGTATCGAAATAGTAGCATTACTCTCGCATTACTCTCGCATTACTCTCGCATTAGTATTCGGCTACTAACAATCGGCTGGGACTTGGACATATTTTCCATATTGTGAAATTTTCGTTTTAAACCGATTCGACCTGTATTTTAGTTTACAATGTAaagctaatatttattttcacgaTGTTATATTTATGTTGATATTTATAcgtaattattatataatttgacTGTTTCCGTGCACGCTGCAATACttctatttatatttctatattgtaatataatccattatataacttttataaatattacattatatatttttgtaatgttctcGTTTGGTACTGTTAGTGTAAAACagcatatatatctatatctatatacagtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatttcagcaatattaaaatggcagtaCATCTTCTGACATTCAGATGTATTCCATTGTTCCACTTAATACGGTACTAAAATTCTTAACttaattaattcttaattcttAACTTAGAAAGAGTTAGACTAACTTAGCACCCTGCTTTAGTATCTGCAGCAGTGGGTCTTGGGAACCCAATGTCCTGCTTCTTTTTGTTCTCTCACTCTCATTTAACCATCAATTGGCCGAATCAgagtttatttacaatgttaaaCCATTAGAGACATCAGGCTAAATTTCATTGTATATGAGGCAACCAAATTCTCCAAcgttttataatttaaataattataaattaaggtttcagttaattaactTAGTGTGTAATTGAATCAAAAAGCATCAGGATAGTGGCTCCCCAGGACCACGATTAGGAACCACTGCTATAGAATTTGGGTGccttatatacttttattattttattttattttatattgtactttTATATAATGAAAACTCAAACAGGTCAATAGAATATATTCCAATATGCTGTGAAGAATGATTTTTAAGTATCTCTGTGAGATGTAGTCAGTCTGTACATGTTTACTGGAAGAAGGAGTGAGGaggaaaataatgcaatattaattttgattttaaaaaacagggGCAATGGCTTTGAGACCATACTTTGAAGGGATGAAAAGGGGGGGGGAATCGGGACTCATTTTGTACTTGAATATGACCCTAGATTTGTGCAAAAAATGCTGGGaaagttatgttttaaaaaatccatTACAGGAAAAAGTCACTTGAATACAACTGAAACCAGTTACACTAACTAATTATGAGACAAAAAAGGGTGGATTCCCCTGAATAAGTAGTAGACACCTGACTTTAAACTACAAGACAATCCAGTATTTGTTCAGTAGTGGGAGGTCTGTACTGTCTGACAGTCCCATCTCATCCCTCCTATCCCTTGCCTTTTATCTGGTGGTAAATATACTAGATTCCCTTGTAACATTACTCCTCAAAATGATGTGCAGGTAAGCACATACTTTGATTGGGAGGTTATAAATAGAGAAtatttgcacttattttgtaagttgccctggataagggcgtctgccaagaaataaaaataataataataattctacatCATATGTATAAATCGTTTAATGATCAGAATTGtatacattgctttaaaaatggaTAGCATtttattctggaaaaaaaaagtaataattaatcaaattaaacaaaaaagttggaaaatgttttgaaaaatccTCAGCTATCCAGTGCCAACCTCTGTATTCCTCAGTACACTTGGTAGAGGCAGGTATTTGGTGTCGACACTATTAAACTGGAGTGAAAAGGGGACACAGCGTTCACATGCCAACAAAGCAGCACCTTCCCGCTTGATTTCAGCACTTTGACATTTCTGCTCTCTGCCTCAGTCATCCTGAAATCCAGAAAcgcaaaatataaaataattcacttGGAGATAGacagaaaatgtttgcattttagcttcaaataaattagatttgccttttttgttgtgATATGTCTGAAGCAACACATCCGGTTGCATTATCTACGAAGAACAACTCTTACCTTCTAACTCCCTTCACACAACGTTTCATGGCAGACATACAGACTTTAATGTTGCTATGATATGCAAAACACATGCAACTGTGACAAACTAAATAACATTACAGAGTAGAAGACTGACCATAGATAATGTGAATATATGACCACATCTATTCATGGTAAAGAAATAGATGGACTATTTTTTTTGCCTATTACAGCAAattccctctttttttttttcttacccaCTCGTCGTCATCTGCTCCATCTCCTTGTGCAGCTAGTTTTGCGGTGCTCCCTGTGTCAGACTTGTTGGCCATGATCTTATCAGTCCAGGAGGCCCCTGCCTTTTCATCACCAGCAAAGTTACACTTGGTCACTGAGCCACCATCAAGCTTGGCTAAAGAAACTACAGAAGGAGGCAGATGAAAGGCCCGTCTCCCTTAGTTTTCAGCCTGATTTCCTGgccctcctccagctctgtcttctccatctctccctctggAATCCAGAAGGCCAGGGTCTCACTGGGGGTGTGCCTCCCCGTCACCTTCACCAGGTCTGCCCTGTTCACTGCAGCCCTCAGCTGCTCCTCTGACAGCCGGTCTGTCTCCCCTTTCTCCTCCACCTCTGGGAATTAAAGACATACAGAGCAAGCAATTAGTTCCTAAAGGTCGATTATCACGGTTTCTACAATGATTGGTTTATAATATGTCTCCATGATGCTGGTAGGAATGTATAAGTAAAGTATCTGGGATGTTTCTGTTGAATTCTATGATATTACTATTTGTTTTGCCCCAACTAACAGCTAACAGCAATGGCAGACACCTGCAAATAACAaaacttttataaaaaaaacatggggTCTGATTaagtcaacattttttttatttttgtttaagtgcTACTCTTGTAACACAGAAAGATTCAAACGATGGCCCTTCCACTTATAAAGGTTTACTGAAATATACAATAGTAAAACAACAGGCATGAAACTATattaaaacatgataaaaacTATGGAAAACCAAGGCAAAGCTAAGTTCTTGCTTACCACAAACTGCCACGTTACTGTGCAAACTTACTGTGATACACTTTCTTAACGGTCTCACATTCCCACTACATCAGATTATATAAGAGCATAAATAACCTTATGCAACTGTAGCCCAGATGttatttgttaatttctgtGTCCTTGTGGGCCCTTTTGTTTGCATCAAACAACTCTGCATAATATGACTCTTCTATCATCTATTGTTTCTCCATTCTGTCCCTAATGTTTTCATCCAGCTGACCTTTTTCATCCATTTCCCAAACATTAGCATCTGATTGGTTGGCTCAAGAGCTGCCATTCAGTTGCAAAATATTACTGGccaacaaatatttttcagcTCCAATGCAAAGTCATTGCTCAATTTGTCTCCTgcaatattttttcattctacTAGTAATCTCTTTATGAACACTTTGTCTTTTGTAATTCTGAGGAACGTTCAGTTCAAATGTcga

Function

GO: NA

KEGG:

id description
K11140 ANPEP, CD13; aminopeptidase N

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00007854 True 5085 mRNA 0.40 20 33763513 33790185
TU33593 False 4528 lncRNA 0.34 2 33789940 33794941

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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AMCG00007863 lrrc28,LOC107706938,LOC107563201,LOC107662304,LOC107690794 coding downstream 249671 34044612 ~ 34052190 (+)
AMCG00007864 NA coding downstream 270190 34065131 ~ 34083321 (+)
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G26825 NA non-coding downstream 197237 33992178 ~ 33993982 (+)
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AMCG00007827 ell3,LOC103370942,LOC102298519,LOC102798071,LOC108431223,LOC107714787 other upstream 2323135 31414154 ~ 31440378 (+)
G26258 tpm1,tpma,LOC108237348 other upstream 3943961 29755040 ~ 29819552 (+)
AMCG00007788 NA other upstream 4038779 29622311 ~ 29724734 (+)
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AMCG00007873 fam174b,LOC103466638,LOC101474125,LOC102798031,LOC103147863 other downstream 1816041 35610982 ~ 35620801 (+)
AMCG00007889 NA other downstream 2501277 36296218 ~ 36302841 (+)
AMCG00007923 LOC105031092,LOC105901836,LOC102299656,LOC101482251 other downstream 3408929 37203870 ~ 37216558 (+)
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AMCG00007952 romo1,LOC102788570 other downstream 4373629 38168570 ~ 38170146 (+)

Expression


Co-expression Network