G82228


Basic Information

Item Value
gene id G82228
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030129.1
NCBI id CM030129.1
chromosome length 41163702
location 38087393 ~ 38093714 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU102579
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>TU102581
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU102579 True 6322 lncRNA 0.40 1 38087393 38093714
TU102581 False 3148 lncRNA 0.36 1 38087393 38090540

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00010643 NA coding upstream 36446 38043745 ~ 38050947 (+)
AMCG00010644 LOC108427269,LOC105894604 coding upstream 62064 38010059 ~ 38025329 (+)
AMCG00010641 LOC106571427 coding upstream 115713 37960752 ~ 37971680 (+)
AMCG00010636 NA coding upstream 213908 37865062 ~ 37873485 (+)
AMCG00010635 NA coding upstream 278146 37795529 ~ 37809247 (+)
AMCG00010650 NA coding downstream 183603 38277317 ~ 38278369 (+)
AMCG00010652 NA coding downstream 212540 38306254 ~ 38317804 (+)
AMCG00010653 ppp2cb,LOC107758729,LOC105021738 coding downstream 231971 38325685 ~ 38339014 (+)
AMCG00010654 enoph1 coding downstream 281745 38375459 ~ 38378170 (+)
AMCG00010660 cops4,csn4,LOC106562268,LOC107685106 coding downstream 353589 38447303 ~ 38458936 (+)
G82156 NA non-coding upstream 261477 37825697 ~ 37825916 (+)
G82140 NA non-coding upstream 343662 37743525 ~ 37743731 (+)
G82092 NA non-coding upstream 426238 37658307 ~ 37661155 (+)
G82063 NA non-coding upstream 530792 37554453 ~ 37556601 (+)
G82057 NA non-coding upstream 554249 37526083 ~ 37533144 (+)
G82229 NA non-coding downstream 1907 38095621 ~ 38095902 (+)
G82230 NA non-coding downstream 3312 38097026 ~ 38097286 (+)
G82231 NA non-coding downstream 16535 38110249 ~ 38110555 (+)
G82234 NA non-coding downstream 62683 38156397 ~ 38156598 (+)
G82250 NA non-coding downstream 191865 38285579 ~ 38287528 (+)
G82192 NA other upstream 199230 37886220 ~ 37888163 (+)
G81987 NA other upstream 823344 37261324 ~ 37264049 (+)
G81971 NA other upstream 836224 37230428 ~ 37251169 (+)
AMCG00010585 NA other upstream 1992896 36091539 ~ 36094497 (+)
AMCG00010578 NA other upstream 2007501 36077113 ~ 36079892 (+)
G82236 NA other downstream 75442 38169156 ~ 38169531 (+)
AMCG00010648 NA other downstream 153307 38247021 ~ 38252010 (+)
AMCG00010655 NA other downstream 254564 38348278 ~ 38353962 (+)
AMCG00010656 hnrnpdl,hnrpdl,LOC106562358,LOC107653490 other downstream 273955 38367669 ~ 38372651 (+)
AMCG00010681 trim23,LOC107558665,LOC106562204,LOC106568315 other downstream 542762 38636476 ~ 38640125 (+)

Expression


Co-expression Network