AMCG00010937



Basic Information


Item Value
gene id AMCG00010937
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030133.1
NCBI id CM030133.1
chromosome length 32682731
location 5115715 ~ 5129141 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence


>AMCG00010937
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>TU128989
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>TU128990
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00010937 False 2728 mRNA 0.43 3 5117222 5128684
TU128989 True 4435 lncRNA 0.43 4 5115715 5129141
TU128990 False 4331 lncRNA 0.43 3 5115715 5124287

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00010940 NA coding downstream 12318 5096591 ~ 5103397 (-)
AMCG00010934 LOC106605147,LOC101067841 coding downstream 85185 5002886 ~ 5030530 (-)
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AMCG00010932 NA coding downstream 218158 4894919 ~ 4897557 (-)
AMCG00010930 man1c1,LOC101464129,LOC100705345,LOC105006133 coding downstream 276656 4816733 ~ 4839059 (-)
AMCG00010938 dhdds,LOC107564097,LOC104959484,LOC104959477 coding upstream 12083 5141224 ~ 5149261 (-)
AMCG00010944 NA coding upstream 46758 5175899 ~ 5203631 (-)
AMCG00010947 NA coding upstream 206705 5335846 ~ 5347367 (-)
AMCG00010945 id3 coding upstream 224802 5353943 ~ 5355562 (-)
AMCG00010948 NA coding upstream 244718 5373859 ~ 5383129 (-)
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G103087 NA non-coding downstream 976078 4138620 ~ 4139637 (-)
G103050 LOC103376870 non-coding downstream 1331084 3784257 ~ 3784631 (-)
G103309 NA non-coding upstream 202591 5331732 ~ 5334257 (-)
G103329 NA non-coding upstream 230834 5359975 ~ 5378226 (-)
G103362 NA non-coding upstream 429536 5558677 ~ 5615853 (-)
G103473 NA non-coding upstream 1255340 6384481 ~ 6386604 (-)
G103503 NA non-coding upstream 1384722 6513863 ~ 6514123 (-)
AMCG00010925 srsf10,LOC108426370,LOC101486875 other downstream 465309 4642652 ~ 4650406 (-)
G103112 NA other downstream 929741 4169793 ~ 4185974 (-)
AMCG00010901 NA other downstream 1540900 3553986 ~ 3574815 (-)
G102990 NA other downstream 1696539 3320813 ~ 3419176 (-)
AMCG00010895 NA other downstream 1788156 3321376 ~ 3327559 (-)
AMCG00010939 NA other upstream 4912 5134053 ~ 5140509 (-)
AMCG00010946 NA other upstream 155189 5284330 ~ 5325424 (-)
G103395 NA other upstream 575629 5704770 ~ 5748564 (-)
AMCG00010966 NA other upstream 835992 5965133 ~ 5974307 (-)
AMCG00010988 NA other upstream 1499429 6628570 ~ 6644723 (-)

Expression



Co-expression Network