G105968



Basic Information


Item Value
gene id G105968
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CM030133.1
NCBI id CM030133.1
chromosome length 32682731
location 19396793 ~ 19480084 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence


>TU132566
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>TU132567
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>TU132569
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU132566 False 4009 lncRNA 0.40 2 19422435 19427947
TU132567 True 4795 lncRNA 0.39 5 19396793 19469364
TU132569 False 4178 lncRNA 0.40 6 19422435 19480084

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00011335 rbm22,LOC107685490 coding downstream 74754 19313827 ~ 19322039 (-)
AMCG00011336 LOC107715168,LOC103027224,LOC108430945,LOC108274535,LOC103354395 coding downstream 89085 19296084 ~ 19307708 (-)
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AMCG00011334 NA coding downstream 188764 19200496 ~ 19208029 (-)
AMCG00011349 NA coding upstream 19276 19499360 ~ 19513320 (-)
AMCG00011348 NA coding upstream 37347 19517431 ~ 19539640 (-)
AMCG00011350 LOC105888595 coding upstream 70143 19550227 ~ 19570328 (-)
AMCG00011355 NA coding upstream 241070 19721154 ~ 19726365 (-)
AMCG00011357 camk2a,LOC106563741,LOC106602935 coding upstream 250408 19730492 ~ 19759043 (-)
G105967 ndst1,LOC106611870,LOC107094997 non-coding downstream 19885 19376513 ~ 19376908 (-)
G105918 NA non-coding downstream 152310 19233722 ~ 19244483 (-)
G105859 LOC105030512,LOC106609167,LOC106569888 non-coding downstream 779709 18616849 ~ 18617084 (-)
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G105840 NA non-coding downstream 1152648 18240676 ~ 18244145 (-)
G106023 NA non-coding upstream 108091 19588175 ~ 19588972 (-)
G106163 NA non-coding upstream 460945 19941029 ~ 20014274 (-)
G106183 NA non-coding upstream 591398 20071482 ~ 20115868 (-)
G106212 NA non-coding upstream 737167 20217251 ~ 20217476 (-)
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G105890 NA other downstream 291524 19102293 ~ 19105269 (-)
AMCG00011316 LOC107664359,LOC107560145,LOC108427843,LOC107752026,LOC105007072,LOC103354679 other downstream 1205598 18180646 ~ 18191195 (-)
G105793 NA other downstream 1396348 17999668 ~ 18000445 (-)
G105770 NA other downstream 1645291 17751253 ~ 17751502 (-)
AMCG00011313 NA other downstream 1645694 17717626 ~ 17751099 (-)
AMCG00011356 ndufa2,ndua2,LOC106602938,LOC107661794,LOC107569768 other upstream 385530 19865614 ~ 19867902 (-)
AMCG00011391 smad5,LOC107664766,LOC107563595,LOC105912044 other upstream 3062565 22542649 ~ 22554137 (-)
AMCG00011399 NA other upstream 3263346 22743430 ~ 22753616 (-)
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AMCG00011414 NA other upstream 3913020 23393104 ~ 23489642 (-)

Expression



Co-expression Network