G106874


Basic Information

Item Value
gene id G106874
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030133.1
NCBI id CM030133.1
chromosome length 32682731
location 24986838 ~ 24991237 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU133680
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>TU133681
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU133680 True 4400 lncRNA 0.37 1 24986838 24991237
TU133681 False 4337 lncRNA 0.37 1 24986838 24991174

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00011440 rnf44 coding upstream 115 24971547 ~ 24986723 (+)
AMCG00011441 NA coding upstream 69898 24915075 ~ 24916940 (+)
AMCG00011438 NA coding upstream 100077 24881356 ~ 24886761 (+)
AMCG00011439 NA coding upstream 162809 24817579 ~ 24824029 (+)
AMCG00011437 NA coding upstream 178014 24793372 ~ 24808824 (+)
AMCG00011443 cltb coding downstream 12427 25003664 ~ 25014869 (+)
AMCG00011444 prelid1 coding downstream 52968 25044205 ~ 25047214 (+)
AMCG00011450 NA coding downstream 80500 25071737 ~ 25093488 (+)
AMCG00011451 ddx41 coding downstream 103292 25094529 ~ 25105105 (+)
AMCG00011449 NA coding downstream 115091 25106328 ~ 25114493 (+)
G106863 NA non-coding upstream 43160 24919851 ~ 24943678 (+)
G106871 NA non-coding upstream 46015 24939022 ~ 24940823 (+)
G106742 NA non-coding upstream 1015655 23941012 ~ 23971183 (+)
G106718 NA non-coding upstream 1153538 23829289 ~ 23833300 (+)
G106640 fat2 non-coding upstream 1446110 23539365 ~ 23540728 (+)
G106906 NA non-coding downstream 56287 25047524 ~ 25049147 (+)
G106946 NA non-coding downstream 346315 25337552 ~ 25337767 (+)
G106947 NA non-coding downstream 380242 25371479 ~ 25371745 (+)
G106961 NA non-coding downstream 674887 25666124 ~ 25667782 (+)
G106966 NA non-coding downstream 683179 25674416 ~ 25677419 (+)
AMCG00011430 dctn4,LOC107749746,LOC106604160 other upstream 1141927 23835819 ~ 23844911 (+)
G106711 zgc:175280,slc7a1,LOC107719755,LOC107702889,LOC107557764,LOC103353344,LOC106563607 other upstream 1233836 23748674 ~ 23753002 (+)
G106618 NA other upstream 1630279 23356062 ~ 23356559 (+)
G106613 NA other upstream 1645073 23341308 ~ 23341765 (+)
G106242 NA other upstream 4619615 20361208 ~ 20367223 (+)
AMCG00011455 unc5a,LOC107677380,LOC107653334 other downstream 616749 25607986 ~ 25662179 (+)
AMCG00011476 NA other downstream 1364930 26356167 ~ 26360775 (+)
G107202 NA other downstream 1779201 26770438 ~ 26771214 (+)
AMCG00011488 NA other downstream 1826815 26818052 ~ 26842792 (+)
G107394 NA other downstream 2720969 27712206 ~ 27727867 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) LOC110487796 LOC106612310 misc NC_048578.1 CM023232.3 39274667 ~ 39319184 (+)
eurasian perch (Perca fluviatilis) G105066 NA non-coding NC_053121.1 CM020918.1 15086584 ~ 15090581 (+)
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G215494 NA non-coding NC_047607.1 CM018553.1 22754560 ~ 22755107 (-)