G107167 (hnrnpa0,LOC105905838,LOC107664751,LOC107567479,LOC107598338,LOC107756703,LOC107741073)


Basic Information

Item Value
gene id G107167
gene name hnrnpa0,LOC105905838,LOC107664751,LOC107567479,LOC107598338,LOC107756703,LOC107741073
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030133.1
NCBI id CM030133.1
chromosome length 32682731
location 26388212 ~ 26409375 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU134043
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>TU134049
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Function

symbol description
hnrnpa0 Enables mRNA 3'-UTR AU-rich region binding activity and protein kinase binding activity. Predicted to be involved in 3'-UTR-mediated mRNA stabilization; inflammatory response; and response to lipopolysaccharide. Located in nucleoplasm. Biomarker of gastric adenocarcinoma.

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC105905838

GO: NA

KEGG: NA

RNA

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TU134045 False 1875 lncRNA 0.49 2 26388212 26398851
TU134049 False 8223 lncRNA 0.42 3 26388212 26409375

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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AMCG00011481 NA coding downstream 18345 26369321 ~ 26369867 (-)
AMCG00011480 NA coding downstream 20096 26362391 ~ 26368116 (-)
AMCG00011482 NA coding downstream 26157 26348588 ~ 26362055 (-)
AMCG00011475 csnk1a1,LOC106604944,LOC107593197,LOC106611977,LOC107554841 coding downstream 53451 26320021 ~ 26334761 (-)
AMCG00011484 LOC107598335,LOC107741069,LOC107664724,LOC107567475 coding upstream 37205 26446580 ~ 26490473 (-)
AMCG00011486 LOC106604933 coding upstream 161797 26571172 ~ 26641966 (-)
AMCG00011487 slit3,LOC106604933,LOC106611921 coding upstream 279039 26688414 ~ 26731680 (-)
AMCG00011489 NA coding upstream 395507 26804882 ~ 26818358 (-)
AMCG00011492 pde6a,LOC107662021,LOC107756707,LOC107601194 coding upstream 522011 26931386 ~ 26943383 (-)
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G107057 NA non-coding downstream 260447 26094805 ~ 26127765 (-)
G107038 NA non-coding downstream 371532 26015984 ~ 26016680 (-)
G107037 NA non-coding downstream 375765 26009520 ~ 26012447 (-)
G107232 NA non-coding upstream 424190 26833565 ~ 26833850 (-)
G107233 NA non-coding upstream 428792 26838167 ~ 26842786 (-)
G107237 NA non-coding upstream 501140 26910515 ~ 26910758 (-)
G107238 NA non-coding upstream 502633 26912008 ~ 26912220 (-)
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Expression


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