AMCG00012599


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00012599
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030138.1
NCBI id CM030138.1
chromosome length 24262032
location 24043955 ~ 24069451 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00012599
GAGTTATTGTGGTTTTCCTCCAAGATGCAGTTCTTGCCCCTTTCACAATGACTGGTCTCGGCAAACAGAGGAAGTCCCTGTCTTCTGTTCAACTCCGCACCAGTCACAGACGCTCAGTGGTGTTGGACACACTCACTCTCTGAAAGCCTCCAACCAGCGTGCCATCTATCTCCCAGTCTGTGGCACTGTGGAAATCCTCTGGTCTCtctttgcctcctctccacgTGGGCGCAGGATCAGTCATCAGTATGACATTGCGGAGACTAGCATCCGGAATCGTGCTGCATGTTTTGCTTCAAACCGTCACATGGGCAAAACTCACCCCCCGAACTTCCTTCATTAATGGGAACCCCGGTAGAGTGTTGGCCATGTTCAACCCCACTGGCACCTGGAACACCACCACACTGCTGCTAAGTGATGATGGAAACAAACTGTACGTGGGGGCCCGGGATACTGTGCTCTCATTGGATGTCAGTCAGCGGGGGGTCATCAACATGCGAAAGCAGctgaaatggaaaacaacagaTGAAAAGGCTAAAGAATGTTCCATGAAGGGCAAAGATAAAGAGGAAGCACAGactttttcatttgtgaatgcaAGCAATGGGGAACAGATCACAGAAGATGGCAAAGGTCGATGTCCCTATGACCCCTATCAGAAGTTGACGGCTATCACTGTTGGTGGTGAACTATACACAGGAACAGTCTCAGATTTCCAGGGCAATAAGCCTGTGATCTCACGCTATCTGGGGGAGGAAGGCCGTGTTGACATGAAGGTGGACGACAGCCTGGGCTGGCTACAAGAACCCATGTTTGTCAGCTCCTCCTTCATCCCAGGAGATCGTGGAAATGACAAAGTCTACTTCTTCTTCAGCGAGCTGGACAAAGAGTACGACTTCATCAAGAAGTTCACTGTGTCGAGGGTCGCTCAGGTCTGCACGAATGACATAGGGGGTGTGCGGATCCTCCAGAAGCGCTGGACCACTTTAGTGAAAGCTCAGATCCTCTGCCTGGCCCAAAATGAGCTGCCGTACAATGTTCTGCAAGACATCTTCACCCTGTTGCCACCCGAGGGCGCTTCTAGGGATGACACATGTGGGCTGCACAATGACACAGACCAAGCTCTTACGTTCGTAAAGGAGAACTTCCTGGCAGATACCAATGTTCATCCTATGGGTGGCCTGCCGTCCCTCATCTCCAGCGATCAAAGATACCGCAAGATCGCTGTGCAGAGGAAAATGTCAGCAGATGGCAAACAATACACTATTCTCTTCCTCCTAACTGGCTCTTCAGAGGGAGTCTTCCAGGTCCCAGTGTCCAACTGCTCTTTCTATTGGAGCTGTGCTGACTGTATTCTCGCCAGGGACCCTTTCTGTGGTTGGGATCCTGTCAAGAAAGTCTGTGCTGATGTCTCCCTCACCGAGAGTAAACTTGCTCAGGATGTTGAAAAGGGGAATGTGGAGGTGATGTGTTCCTCATCAATTGGTCCCAGAGCCAGATTTCCTTCCCAGCAGCAACTGCTCCTAGATAAACAGATGACCGTGTCTCTGAACTCTGTGCTAAAGTTGTCTTGTCCCAGCATCTCCCACCTGGCCACGCTACAATGGGAGCGAGATGGAAAGCCTGTCTCCAGTGAGGACTGCGTTCAACTGCAGGATGGCAAGCTCCACTTCTTGGCCACCAACCAGTCACAGGGTGAATATGTATGCCTTGCTATTGAGAATGGCTTTAGACAGCCTTTGGCCCGCTATGTGCTGAGTGCGATTGAAGGCCCTGTCCCAGACCCCAGCACGGAGGACAAGGAAGAGGGGCAAAGAGTGGGGGAGGACAAGGAAGAGGGGCAAAGAGAGGAGAAGCCTATCATCAAGCAGACCAGCAGTCCCTCTTTCAAAGAGCGCAGCTTTCCTTCAGTCAACAAGACCCCAAATCCCCCTGGTACAGAAGTACCAGAGAAGTCCAGTACCAATGGCCCAAGCTACTATAAGGAGCTAGTGGCTGTGTCCATTTTCCTAGCGTTGGCACTAACTTTGCTTTTGGTGGGCACCCTCTATGGCTGGCGCCAGAGGAACCGGGGAAAGGCCAGGGTGCAAGGCTGTCAGAAGAGCCCCAAGAAAAATCCAGAAGCTGGTAGCACCCCAGAGCATGTTCCCCTAACCCAAGACCATGGTCCAGTAAGCGTGGTGGTACAGAACAGTCAGGGTACAGGAGGCAAGGAGCATGAAAACAATGCACAGCATGCTTCCAATGGGCATCTTCCTAGTGCCACTTAACATTCAGGGATACCACCTCCCAATTAATCAATTCCTTCATTGTATACAGGACATTTAAGAAGAGAATGAGAGGAAAGGGGTGAAATACTCCAGAAACAATTGTCAAACATTGTCTTGTTTTCTGTGACAGATGTAtcaatgaaaaccacaaatcacttcctgttccaaTCAATCACCACTAATTCAGACACGGGTCcaattttcattgttttttcccAGATTGCTGCGGAACAAAAATTATCAGTggacatttttctgttttagaatTTCCTTAGAAGCCAGGGTCAAACTGGTCAATCTTGTAGAATGTATATGGACATGTTTATGCATCTGCTGCCTTCCCTACATCCCTACAAAAAAGCTTTCGTAACAGCACTGGACATTGATAATAACCCATcttaatggaaattaaaaatcttaaggaaaataacaaattgtGCCCTACTTTGTACCTGACACGATGAAGAATGTTGATTCACATTgtgatttccaattaaaaaaaaaaaaaaaaaactatttgcacTGTTTTGACAATAGAATGGGTGTTATTTAACCACTAGAGGGCTACATTTTGGCAAACCATTCTTGGGGGGTGGAGTGGAAcataactctgaaatgaaatTTAACCACTGATTTAATACATCTTTGTATACAGATCAactgcaatattttttattaaaatatattcttttaattgtgttaatgaatgcttttgaaaatgtattattgatgaATGTTCTATTTGTATGTGCTATGACTAGATCTGGATGTCAGTAGacagtgtgtctgtttttttttattgaaggtaCTGCCAAATATGTATGCTTTActgacaaaacaacaaactggTGTAGTGTTAAATTTTGGGCAATCGTGGAAACCGGAATCTTAAAAATGGAAGACTTAATGGACTACCACTTTAGTATTATATAAagccaagaaaaaaagaaaaagaaaagtttaggGATCTTGTTCTTGTTAAACTAAAGAAAGCTTCTGACTGCTTATGAgatgtatatttatgttttctgtatttcagagaTAAGATGATGTTGTCcacagattttaaaagcacaattacCTATTCCCATCTGATCACTTTGAGACAGGATATTTGCCTTAAACTGAAgcaataaatgtgaaatatgagcGGTAAACCTGTGCTCAGTTGATATTTTGCTGTATTATCAGACAGTTTGACACTAtaattccaaaatgtattttgaatattttgtattattattttcaatatgaatAATGGTTTTGTAGTTAATTATTTTGCCTTAAATTGCACAGACTTTTCCTGATCAAATACGTCATACTGGTCAGCTGTTCGCTCAGTTTTATTGGCAACAGGAATGGTGGTCAGTTGTACTTAATTGGAGGATAACCTAGTAAAATTAGGATGGTATATCATTTGTAAATCTAATAGGAGTAACAAATGTAGcttaagaaataatgaaaaaaatactactatgtttttttcttttaaataaatctggtttattaaaatataacaattgcATCACCGACCAGGCTGTCATGCCTTAATTAATGGTCAATATTTAACAAGTGTTTAAAATATCAAAGTAATTTTAAGGCAACAGAAAAAGACCTGTCTCAAAGTGCTCTGCAATTATAGGGTCTAGAGACCACCCTACCCCTAACTTTAAAGTTACATGTCTACAATTGTACCTTTTTAAtgattatgtattaattaagatcagcttgttgttgtttttaatattgtaatcaCTACTACTACATTCCAGACACGGGTCTCTGTCAGGACCTTGCCTTGCCCTGACAGAATAAAAAGTGTGGTACCGTTGCAACCAATTTGAAAATTGTAGTttttcaccatttatttatttgttggaatGCATCAGCAGAAAATTCAGCTTCAACTAGCAATCACCACAGAAGAATGTCTAATAATTTGCCCATTTCAACGCATCAGTTTGGGTTGGTCTCAGAAGTGTGCATTGGTAACTGAAAACGACAGATAGAGCTGTTATGAGTACAAGGCTGATAAGTAGCCTCATCTCAAGGTACAATTGCGTTACTATGCTTGTCTTAACCACTGTTTGTGTAATACACTGTCTGtgatttttatctttattttatttatatactatctttaaatgcaatgtttgaagagtttaaattaaaatatggcAAAGCAGGTGTGATATAATCAAATGTGATGAAATTAGTTCAACTTAATTTGTTGATGTTTGAATGGTATAAACCAGGCTTTtggtatttttacactttttggACTTAACCCAAAGGGAAGCAAACATAATATTAAGAGGGGGGGTGCATTACATTCACAAAGTGTTTATCCAGTATGGTGGATGTTTTTCCAAACCAcctaaaataattttgtttgatttaatatgaCAAAATGGTGATAGTATTAGAGTATATTATTTACTCAGccattatattaatttgctgTCTTATGGTAATTTCATACTGCTTGTTGCTACAGTGCAAATATGCTCACacataaatttaaatatatttcagaagtAATTTGAATGTTAAAGAACCCAATCAGGCATCTTCATAATATTTGACTTCACCAGGTACTGCCACTCTGTATAAGAGgaagaaaaatgtgaataatttatttctccACGAATAAATTCCACTACTAGTGATTTGCATTGAAGGTTTGAATAATTACTCATCCTGAGTCaactggaaaataatataatacaa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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00012599 True 5464 mRNA 0.41 11 24043955 24069451

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00012596 NA coding upstream 67386 23952192 ~ 23976569 (+)
AMCG00012595 NA coding upstream 144618 23859829 ~ 23899337 (+)
AMCG00012592 NA coding upstream 354414 23663228 ~ 23689541 (+)
AMCG00012591 NA coding upstream 394114 23628460 ~ 23649841 (+)
AMCG00012589 NA coding upstream 482139 23554060 ~ 23561816 (+)
AMCG00012598 NA coding downstream 146916 24216367 ~ 24222350 (+)
G138118 NA non-coding upstream 122086 23920076 ~ 23921869 (+)
G138042 NA non-coding upstream 200744 23798606 ~ 23843211 (+)
G138034 NA non-coding upstream 768005 23275664 ~ 23275950 (+)
G138010 NA non-coding upstream 880336 23162991 ~ 23163619 (+)
G137984 NA non-coding upstream 985564 23058086 ~ 23058391 (+)
G138209 NA non-coding downstream 167211 24236662 ~ 24236977 (+)
G138212 NA non-coding downstream 171688 24241139 ~ 24241424 (+)
AMCG00012593 NA other upstream 301364 23697424 ~ 23742591 (+)
AMCG00012579 NA other upstream 1132299 22880359 ~ 22911656 (+)
G137947 NA other upstream 1225497 22817953 ~ 22818458 (+)
G137899 NA other upstream 1477849 22565424 ~ 22566106 (+)
G137775 NA other upstream 2085797 21932295 ~ 21958158 (+)

Expression


Co-expression Network