AMCG00013761


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00013761
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 41764744 ~ 41787394 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00013761
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
K15290 SYT1; synaptotagmin-1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00013761 True 8247 mRNA 0.36 8 41764744 41787394

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00013759 NA coding upstream 127519 41621764 ~ 41637225 (+)
AMCG00013755 NA coding upstream 159801 41594817 ~ 41604943 (+)
AMCG00013756 NA coding upstream 176805 41573978 ~ 41587939 (+)
AMCG00013760 NA coding upstream 212174 41549426 ~ 41552570 (+)
AMCG00013758 NA coding upstream 260277 41484312 ~ 41504467 (+)
AMCG00013771 nudt3,LOC106566013 coding downstream 690277 42477671 ~ 42487364 (+)
AMCG00013774 pacsin1b coding downstream 768414 42555808 ~ 42569579 (+)
AMCG00013776 uhrf1bp1,LOC102796170 coding downstream 877888 42665282 ~ 42689203 (+)
AMCG00013780 anks1a,LOC107746333 coding downstream 931299 42718693 ~ 42723943 (+)
AMCG00013782 anks1a coding downstream 946151 42733545 ~ 42738221 (+)
G46538 NA non-coding upstream 351144 41413360 ~ 41413600 (+)
G46508 NA non-coding upstream 560595 41203064 ~ 41204149 (+)
G46455 NA non-coding upstream 879115 40882849 ~ 40885629 (+)
G46360 NA non-coding upstream 1339237 40416632 ~ 40425507 (+)
G46355 NA non-coding upstream 1352072 40391888 ~ 40412672 (+)
G46652 NA non-coding downstream 57914 41845308 ~ 41893174 (+)
G46701 NA non-coding downstream 708352 42495746 ~ 42499599 (+)
G46730 NA non-coding downstream 904812 42692206 ~ 42692546 (+)
G46734 NA non-coding downstream 906268 42693662 ~ 42695623 (+)
G46739 NA non-coding downstream 916262 42703656 ~ 42792219 (+)
AMCG00013729 NA other upstream 1374803 40377732 ~ 40389941 (+)
G46345 NA other upstream 1390944 40350652 ~ 40373800 (+)
G46244 NA other upstream 2202444 39561973 ~ 39562300 (+)
AMCG00013681 NA other upstream 2942790 38811945 ~ 38821954 (+)
AMCG00013672 h3f3b,H3F3A,LOC101073377,LOC105909691,LOC107388308,LOC107572204 other upstream 3057390 38656596 ~ 38707354 (+)
AMCG00013770 NA other downstream 640707 42428101 ~ 42446480 (+)
G46723 cunh6orf106,zgc:101577,LOC107696455,LOC107579776,LOC107724532,LOC107595408 other downstream 857593 42644987 ~ 42648754 (+)
AMCG00013777 NA other downstream 862796 42650190 ~ 42661844 (+)
G46840 LOC107711852,LOC107679810,LOC107594520,LOC108425079,LOC108265838 other downstream 1252590 43039984 ~ 43044436 (+)
G46862 NA other downstream 1299895 43087289 ~ 43089643 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location