AMCG00013770


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00013770
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 42428101 ~ 42446480 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00013770
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>TU58194
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>TU58195
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>TU58196
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005657 replication fork cellular_component

KEGG:

id description
ko03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00013770 True 8010 mRNA 0.42 5 42428777 42446480
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TU58196 False 1488 TUCP 0.43 5 42428101 42441245

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00013761 NA coding upstream 640707 41764744 ~ 41787394 (+)
AMCG00013759 NA coding upstream 790876 41621764 ~ 41637225 (+)
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AMCG00013771 nudt3,LOC106566013 coding downstream 31191 42477671 ~ 42487364 (+)
AMCG00013774 pacsin1b coding downstream 109328 42555808 ~ 42569579 (+)
AMCG00013776 uhrf1bp1,LOC102796170 coding downstream 218802 42665282 ~ 42689203 (+)
AMCG00013780 anks1a,LOC107746333 coding downstream 272213 42718693 ~ 42723943 (+)
AMCG00013782 anks1a coding downstream 287065 42733545 ~ 42738221 (+)
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G46798 NA non-coding downstream 531132 42977612 ~ 42980239 (+)
AMCG00013729 NA other upstream 2038160 40377732 ~ 40389941 (+)
G46345 NA other upstream 2054301 40350652 ~ 40373800 (+)
G46244 NA other upstream 2865801 39561973 ~ 39562300 (+)
AMCG00013681 NA other upstream 3606147 38811945 ~ 38821954 (+)
AMCG00013672 h3f3b,H3F3A,LOC101073377,LOC105909691,LOC107388308,LOC107572204 other upstream 3720747 38656596 ~ 38707354 (+)
G46723 cunh6orf106,zgc:101577,LOC107696455,LOC107579776,LOC107724532,LOC107595408 other downstream 198507 42644987 ~ 42648754 (+)
AMCG00013777 NA other downstream 203710 42650190 ~ 42661844 (+)
G46840 LOC107711852,LOC107679810,LOC107594520,LOC108425079,LOC108265838 other downstream 593504 43039984 ~ 43044436 (+)
G46862 NA other downstream 640809 43087289 ~ 43089643 (+)
G46945 NA other downstream 992012 43438492 ~ 43440698 (+)

Expression


Co-expression Network