G39556


Basic Information

Item Value
gene id G39556
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 6786456 ~ 6795733 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU49313
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU49313 True 9053 lncRNA 0.40 2 6786456 6795733

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00012752 NA coding downstream 166698 6607194 ~ 6619758 (-)
AMCG00012745 NA coding downstream 326430 6452009 ~ 6460026 (-)
AMCG00012744 NA coding downstream 350825 6412731 ~ 6435631 (-)
AMCG00012743 NA coding downstream 408202 6362449 ~ 6378254 (-)
AMCG00012742 NA coding downstream 459381 6289631 ~ 6327075 (-)
AMCG00012757 strap,LOC106576022,LOC106609126,LOC105020178 coding upstream 20075 6815808 ~ 6823765 (-)
AMCG00012758 NA coding upstream 132797 6928530 ~ 6981212 (-)
AMCG00012759 NA coding upstream 220372 7016105 ~ 7024518 (-)
AMCG00012760 NA coding upstream 418012 7213745 ~ 7235643 (-)
AMCG00012766 NA coding upstream 482969 7278702 ~ 7289692 (-)
G39462 NA non-coding downstream 498521 6285455 ~ 6287935 (-)
G39443 NA non-coding downstream 517518 6268235 ~ 6268938 (-)
G39377 NA non-coding downstream 891342 5816472 ~ 5895114 (-)
G39371 NA non-coding downstream 974420 5778290 ~ 5812036 (-)
G39295 NA non-coding downstream 1240387 5545834 ~ 5546069 (-)
G39561 NA non-coding upstream 102254 6897987 ~ 6898237 (-)
G39580 NA non-coding upstream 354884 7150617 ~ 7150823 (-)
G39662 NA non-coding upstream 875503 7671236 ~ 7671642 (-)
G39707 NA non-coding upstream 1031545 7827278 ~ 7828147 (-)
G39839 NA non-coding upstream 1473261 8268994 ~ 8269221 (-)
AMCG00012751 NA other downstream 90532 6638480 ~ 6695924 (-)
G39487 NA other downstream 330278 6455721 ~ 6456178 (-)
AMCG00012732 NA other downstream 722639 6052364 ~ 6063817 (-)
G38490 NA other downstream 4602293 2183885 ~ 2184163 (-)
G38458 NA other downstream 5009235 1776854 ~ 1777221 (-)
AMCG00012782 NA other upstream 1095756 7891489 ~ 7904455 (-)
AMCG00012829 NA other upstream 2316708 9112441 ~ 9152405 (-)
AMCG00012858 NA other upstream 3944621 10740354 ~ 10753698 (-)
AMCG00012856 lsm8,LOC107592220,LOC107580766,LOC107656302 other upstream 4062148 10857881 ~ 10862322 (-)
AMCG00012888 mkln1,LOC107104017 other upstream 5444663 12240396 ~ 12271789 (-)

Expression


Co-expression Network