G44468


Basic Information

Item Value
gene id G44468
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 31303537 ~ 31310491 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU55435
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>TU55436
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU55435 True 6955 lncRNA 0.37 1 31303537 31310491
TU55436 False 4687 lncRNA 0.37 1 31303537 31308223

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00013451 NA coding upstream 153228 31149173 ~ 31150309 (+)
AMCG00013447 NA coding upstream 172323 31107642 ~ 31131214 (+)
AMCG00013446 vasp,LOC102786205 coding upstream 258801 30985472 ~ 31044736 (+)
AMCG00013440 NA coding upstream 354187 30940080 ~ 30949350 (+)
AMCG00013439 NA coding upstream 395540 30906846 ~ 30907997 (+)
AMCG00013455 fkrp,LOC107699218,LOC107752280,LOC107566082 coding downstream 46314 31356805 ~ 31358367 (+)
AMCG00013460 NA coding downstream 154203 31464694 ~ 31465848 (+)
AMCG00013459 egln2 coding downstream 174051 31484542 ~ 31491406 (+)
AMCG00013458 NA coding downstream 185628 31496119 ~ 31502050 (+)
AMCG00013461 NA coding downstream 306433 31616924 ~ 31641312 (+)
G44433 NA non-coding upstream 197229 31099350 ~ 31106308 (+)
G44388 NA non-coding upstream 333037 30966909 ~ 30970500 (+)
G44383 NA non-coding upstream 367366 30935840 ~ 30936171 (+)
G44379 NA non-coding upstream 369100 30922746 ~ 30934437 (+)
G44380 NA non-coding upstream 377057 30924736 ~ 30926480 (+)
G44486 NA non-coding downstream 58716 31369207 ~ 31371002 (+)
G44529 NA non-coding downstream 336872 31647363 ~ 31665161 (+)
G44549 NA non-coding downstream 474102 31784593 ~ 31871473 (+)
G44561 NA non-coding downstream 588130 31898621 ~ 31899202 (+)
G44581 NA non-coding downstream 719765 32030256 ~ 32030922 (+)
G44325 NA other upstream 526368 30776851 ~ 30777169 (+)
AMCG00013417 mcrip1,LOC106601427,LOC106606980 other upstream 735318 30563240 ~ 30568219 (+)
AMCG00013416 alyref,LOC106606979 other upstream 806924 30490827 ~ 30496613 (+)
AMCG00013408 NA other upstream 872888 30425007 ~ 30430649 (+)
AMCG00013399 NA other upstream 959532 30339802 ~ 30344005 (+)
AMCG00013468 NA other downstream 591039 31901530 ~ 31911801 (+)
AMCG00013473 LOC105911162,LOC105012052,LOC107580644,LOC107566293,LOC107577119,LOC107725066 other downstream 962777 32273268 ~ 32284951 (+)
AMCG00013477 ppp1r37 other downstream 1083327 32393818 ~ 32400452 (+)
AMCG00013478 NA other downstream 1112785 32423276 ~ 32455686 (+)
G44870 NA other downstream 1795801 33106292 ~ 33106595 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
eurasian perch (Perca fluviatilis) G20947 NA non-coding NC_053113.1 CM020910.1 31694641 ~ 31759065 (+)
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G217401 NA non-coding NC_047608.1 CM018554.1 69744 ~ 73158 (-)
bowfin (Amia calva) G22730 NA non-coding CM030123.1 CM030123.1 11512153 ~ 11522358 (+)