AMCG00014533


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00014533
gene name NA
gene type coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030128.1
NCBI id CM030128.1
chromosome length 42883965
location 16479887 ~ 16496581 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00014533
caaatctaatccTAAGCAGGATCAAAAAGGTAAGGGTGCTATCCATTATTTCTTATGCTCAGTTTGGATGGCTTCCAGAAACAAGattaaatatagtaataatGTATCCAGTGTTTGCCTTCACTGGGAAGAGAAATTGGAACACAAgtcaatgatttattaattgcaCAAAGTCAACAAAAAAGTTGGAAAAAATCTTAACCCTctagaaaaaatattgaattcctgttttgttttttaataaaggcatgtatttatatagagCTGCCAGCTTTCAGCGTATACTTGCCTTTTTTGattggtaaaaaacaaaattaatacaaatcattttaaaaagcagttaatttaattgtcaGAGGAAAAAGCTTTTTATGTCAGTAAAATCACAGTGTTAGTTAGTTACTGGAGCCTTTTTAAAGAGACCGGCTCCAAGTCTCTCAGGAATAGCCTCTCCATCTACTCATAGAGGGTCAAGTGTCAGATTTCAATGAACCACAGCCAATAAATCTGTGTCTGTGGAACTAATCAAGGATATATTTACTTTTACGCTCATCAGttatttcataaataataaaataaacttctggCTGACTGTCCTTGGCATTAAGTTTCAGCAGAATGGTTTACAAGGTCAGCCCCAAAATTGTCATTGGCAGGTATCAGTGCATATATACCACACGCAAACAACCAGCATATCAGTTCGAGCTGCAGTGTTGTATTCATTTCCACAACGCTGAACTCCCATTCTCCAATCCATTTACTGAGGGAACTGATTGCTCCACCTGTGGCCATGTCTCTTGCTGGCGAAGTGTGCCTCATCACTGGGGCTTGTGGCTTCCTGGGGGAGAGAATTATCAAGCTTCTGTTGGAAGAAGAGGAACTCACGGAGATTCGGCTCCTTGATAGGGATATCAAGCCTGATCTCATCACATCTCTGAAAGGTACTCAGCTTTTGCTGGAGGCTTGCATCCAAGAGAATGTGAGGTCTTTCATCTACACCAGCAGTATTGAGGTGGCTGGCCCCAACCCACAGGGTGACCCTATTATCAATGGCACTGAAGACACACGCTACTCCTGCTGCCTGAAATTCCCCTACAGTAAGACCAAGTTCCAGGCTGAACAGTTGACTCTGCAGACCAATGGAGAATTTCTCCGCAGTGGAGACAAAATAGCAACCTGTGCCTTGCGTCCCATGTATATTTATGGTGAGGGTTGCAAATTCCTTGTGGGCCACATGGAGAATGGAATGAGAAATGGCGACGTGTTACTGCGCACCTCAACAAAGGAGGCTGTGGTGAACCCTGTGTATGTAGGGAATGTGGCTTGGGCCCATGTCTTAGCAGCCAAAGCCCTGAAGGACCCTAAAAAAAGAGCAGCGATCGGGGGCAGTTTCTATTTCATCTCGGACGACACCCCCCACATGAGCTACTCGGATTTCAATCATGAAGTTATGAAGCCTCTGGGATTTGGGATTCAGGGTAGGCTCTCCCTACCTCTGCCTCTGCTCTTCTTTATATCCTTCCTCTTGGAGATGGCTCAAGTGCTGCTGAGCCCCTTCTTGAAGTTCAACCCGCCAATGAACCGCCAGTTGCTCACCATGCTCAACACGCAGTTCACCTTCACCTATGGAAAGGCTCAACGGGACCTGGACTACACCCCGCGCTACTGCTGGGAGGACGCCAAGACCTGGACCACGGACTGGTTGGCGTCTGTCCTGCCCAAGCAACGAGAAATTGTGAGAGCTCCCAAACACCCTTGACTCCCAGAGGGCCCTACTTGCAAGACTCTGTGTGTACTTGATCTATGCTCTGTCAGACATTGACTCTTTctttttacacaattaaaaaaataacagtgacCGTCCTCTTCTGTTTCCTTAAAGGGGTATTGTTGTGGTTCTGTTaattattagaaataaaaaataaatgttaaatttaacacaaaatgaaaagataacCACTTTAAATGtggttaaatgtaatattaaacattttaaacatgttttacaacATAGTTAACATGAACACTGTCCACAAACCATCACTGCtgcattttctattaaaaacattttcctttaatctCTGACCTTTCTGATTGATCTACATGAAAGTCAGGTTTTAAGTAATTGTTgggtttattttctaaatacaaaattaggtgtttttcatttcatatttaccTGAAATTTCTTATACACAGATAACCTTCCtttcaaatgtgtattgtaATGCATCCCTATAGAGAATATTGTTATAACACTGTATAATGTACACAATTGTTGGTTACACTGGTGACTGTATATTATTTgacaccaaaaaaacatttcagtcaatACTGAGgcataatgtttaaaaacaaattcctctcactttttaatgttatcaataaaataaataaacacacaatgaaaCCTTTTAATAttaccatttaatttattttgaattgtgttgCATTacataaagtaatataaaacaataattgtaaAAGATAATGAATCTTACATTGTAGAAATAGTACATTTCTAAAGTTGTATTGTTGTGCTTATGTATTATCAACATACAATAACTTACATTTgattgaatttgtgttttattacaaccatttattatttttgggatACCTGACTATATCAACTTAATTTAAACTGcttaatgaaaactaaaattatGTCAGTTTACTTCAACTGTGATTCCTTCAGTTCTTTGAATGTGCACATGATCAATGAATGTTCCTGCTTCAGTAGTTGCCTTTTTAACAGTTATTGAAAGGTTTTTCTAaagattaattattaacaaGAAATCTCCCATCAAAATACATCAACCTGGAAGGAGATCTATTTAACTGAGCAATGTTTACAGACTTGTGTAAGTTTCAGCATTGTAGAAGTGTGGTATGTATATCAAAACAACTGTGGTAGCTTCATTACGCAGATAGAAAGCTAAGTGCTCTACATTTTTAATGGCCTAATTCAAACTTGTGCAATTTCTACTGACTGTGCTGTAAACTGCTACACCTCCATGATCTTAACCACATTTCAGTTAACCTTATTGCTGAAATAACAACCATTCAATGCACTTCAATTTTGCAGTAATGGAAGCCTTTATATTTGCCAGTAACAAGTTACTATTATTTTGGGTTGTGTAATACTTACCTAGATGTTGCCCATTGCCTGTAACAGAATGTAGGCCTGCATTTTAGTCATGCGGTAGACAAATAGCAATGCATTCTGGCAAACAGGGGATACAAAAGGTCAGTGTTCTTCAGACAAATGATCATTCATGAATGTGAGATGACATATTTGTCCACACATTTCTGCATATTTTTGTCTCTCTGGAAAAAAAGCCTGCAAGTCCCTGTCCTCCAGCTGCAGGCAGCCTTTTCCTGAGTGCATGAGTCTTGCATGCTGTTAAGAATGGAGATTAGACTGACATAGTGGTAGGATCTAGAAAACAAGAAGTAGACTAGCTGCATATTAGAcgtgtcttgtttttttctgggaGGCTTTGCATgaatcatttttttgtgtgtggtttctaTAATCCTTGTACTGTTACATCAGGGCAGATACATAATACTagtggaaaacaacaaaatgcgCCTGAGGTGATTTTGTATTCCAAAAGATTCCCTGTCTTTCCGTAATCATTAACCAAGTTGAGTAATCATTATCCAAAAAGCAGCTGAGAAGAAAAGTTTTCTGTTGTGACTGCTGTCTGGGAATGGCTTGTATCGGGAGAAAAGTTCTGTCCTTCTTTGGCGTGTTGATGCTCTgtgctcattttaatgcagGGGCTGAGAATGCCACCGTGTCCAACTGTGCCGCCTTTGGGACCACCACTTGGAAGGAATATCGGCAGGACAAGACACTGCAGATCCAGTACCTGCTCTTCAACCGCCAGGGCATGAGCTGTGGCAAGGTTATGAGCCCCGAGGCAGTTAAGAACATCAGCTCCTCTTACTACACAGCCTCTCTCCCCACCAAAATCATCATCCATGGTTTCAGGGCTTTGGGAAGCAAACCCTCCTGGATTCAAAACCTGGTCCAAGCTCTCTTGACTGCAACTGATGCAAACGTGCTGGTAGTGGACTGGATCCACGCAGCTTCTTTTGCCTATAACAGGGTGGTGAACAACTATCAAGAGGTGGCATTAGAAATCTCACATCTCATCAAAGAGCTTATTAATATTGGAAGCAAGAAGGAGTCGATTCACCTGATCGGGGTCAGTGTAGGGGCACATGTTGCAGGATATGTGGGGACACTCTTTGGTGGAAAGCTTGGCAGAATAACAGGCCTGGATGCAGCTGGCCCCATGTTTAAACATGCAAGAACTTTCAACCGGCTGGATCACACCGACGCGCTCTTTGTGGAGGCTATTCACACTGACTCAGACAATTTCGGGATATCCATCCCCGTTGGACATGTCAATTTTTTCCTCAATGGAGGGAATGACCAGCCCGGCTGTACCCGATCCAGCTTCTCAACAATGTATGACTATCTGATCTGTGACCACATGAGGGCCGTGTACGTCTACATCAGCGCTTTGAACGGCTCCTGTCCGCTGATGGGCTTCCCGTGTGACAACTATGAACGATTTGTCAGTGGAAGCTGTCTGGATTGCAAAGTACCATTCAACGGCTCCTGCCCTCAGATAGGGCTCCCTGAAAATAACTGGATCAAAGTCACCCCACCggaaaatgaaaaccttttCCTGATGACAACAGCTGCAGCACCTTTCTGTACCCATCACTTTCTCCTGGAGCTGGAAATTACGCCACTGAAGAAGAGCACTGAGGTCTTAGTGACTCTGAGAAGTGAGAGGAACAGTGACACGCAAGACAAAATCAAACTGCAATCAAATGTGCccagtttaaaaaaagtgaCATCCCACCCTGCTGCCCTTTGTAATATAGACTCCATTGAGTTGAAGACATCTTCACGGTTCTTTCCTAGGAAAGAAATAACCATTCACAAAATCTGCATCACTCAACTTCCATATGGA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Function

GO:

id name namespace
GO:0006629 lipid metabolic process biological_process
GO:0003824 catalytic activity molecular_function

KEGG:

id description
K13618 PLA1A; phosphatidylserine sn-1 acylhydrolase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00014533 True 6483 mRNA 0.39 12 16479887 16496581

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00014529 NA coding downstream 22519 16451881 ~ 16457368 (-)
AMCG00014526 NA coding downstream 32919 16439295 ~ 16446968 (-)
AMCG00014530 NA coding downstream 48230 16425395 ~ 16431657 (-)
AMCG00014527 LOC104951642 coding downstream 59396 16411736 ~ 16420491 (-)
AMCG00014528 xpo4,LOC106582068 coding downstream 70599 16380894 ~ 16409288 (-)
AMCG00014532 NA coding upstream 706 16497287 ~ 16504076 (-)
AMCG00014534 hao2,LOC102793069 coding upstream 10806 16507387 ~ 16512051 (-)
AMCG00014540 fam46c,LOC107658236,LOC107597368,LOC107724489,LOC107668849,LOC107569365 coding upstream 286496 16783077 ~ 16785522 (-)
AMCG00014541 man1a2,LOC107668846,LOC107658234,LOC107724469,LOC107597367,LOC106582087 coding upstream 303460 16800041 ~ 16814919 (-)
AMCG00014544 man1a2,LOC107658234,LOC107712247,LOC107724469,LOC107668846 coding upstream 330064 16826645 ~ 16955741 (-)
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G70689 NA non-coding downstream 110423 16366124 ~ 16369464 (-)
G70679 NA non-coding downstream 197988 16281685 ~ 16281899 (-)
G70660 NA non-coding downstream 265760 16212544 ~ 16214127 (-)
G70491 pdcl3,LOC106586481,LOC102788355,LOC106582251 non-coding downstream 776573 15700208 ~ 15703314 (-)
G70876 NA non-coding upstream 787738 17284319 ~ 17284576 (-)
G70898 NA non-coding upstream 852855 17349436 ~ 17350972 (-)
G70954 NA non-coding upstream 1507229 18003810 ~ 18004023 (-)
G71016 NA non-coding upstream 1832616 18329197 ~ 18331100 (-)
G71133 NA non-coding upstream 2167683 18664264 ~ 18664631 (-)
AMCG00014412 LOC106574775,LOC107704546 other downstream 3346136 13087608 ~ 13133751 (-)
AMCG00014374 NA other downstream 4812350 11660011 ~ 11667537 (-)
AMCG00014365 ube2al,ube2a,LOC105016494,LOC107552373,LOC103021436,LOC103029486,LOC108259060,LOC105934920 other downstream 5342801 11125029 ~ 11137086 (-)
G69537 NA other downstream 5681740 10796716 ~ 10798147 (-)
AMCG00014339 dph3,LOC105022091,LOC106574460 other downstream 6418657 10058097 ~ 10061230 (-)
AMCG00014539 wdr3,LOC107569352,LOC107658238,LOC107712260,LOC107724477,LOC107668854 other upstream 225492 16722073 ~ 16737877 (-)
AMCG00014555 LOC103136798,LOC106917865,LOC103473267,LOC106919874,LOC103148706,LOC108242195,LOC100692262,LOC101156309 other upstream 950287 17446868 ~ 17462290 (-)
AMCG00014559 NA other upstream 1092686 17589267 ~ 17621151 (-)
AMCG00014567 mzt1,si:dkey-15d12.2 other upstream 1494070 17990651 ~ 18022095 (-)
AMCG00014604 kctd4,LOC107688678,LOC107748885 other upstream 2705222 19201803 ~ 19203567 (-)

Expression


Co-expression Network